Affine Alignment
 
Alignment between NPAS1 (top ENST00000602212.6 590aa) and NPAS1 (bottom ENST00000602212.6 590aa) score 59033

001 MAAPYPGSGGGSEVKCVGGRGASVPWDFLPGLMVKAPSGPCLQAQRKEKSRNAARSRRGK 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MAAPYPGSGGGSEVKCVGGRGASVPWDFLPGLMVKAPSGPCLQAQRKEKSRNAARSRRGK 060

061 ENLEFFELAKLLPLPGAISSQLDKASIVRLSVTYLRLRRFAALGAPPWGLRAAGPPAGLA 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 ENLEFFELAKLLPLPGAISSQLDKASIVRLSVTYLRLRRFAALGAPPWGLRAAGPPAGLA 120

121 PGRRGPAALVSEVFEQHLGGHILQSLDGFVFALNQEGKFLYISETVSIYLGLSQVEMTGS 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 PGRRGPAALVSEVFEQHLGGHILQSLDGFVFALNQEGKFLYISETVSIYLGLSQVEMTGS 180

181 SVFDYIHPGDHSEVLEQLGLRTPTPGPPTPPSVSSSSSSSSSLADTPEIEASLTKVPPSS 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 SVFDYIHPGDHSEVLEQLGLRTPTPGPPTPPSVSSSSSSSSSLADTPEIEASLTKVPPSS 240

241 LVQERSFFVRMKSTLTKRGLHVKASGYKVIHVTGRLRAHALGLVALGHTLPPAPLAELPL 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 LVQERSFFVRMKSTLTKRGLHVKASGYKVIHVTGRLRAHALGLVALGHTLPPAPLAELPL 300

301 HGHMIVFRLSLGLTILACESRVSDHMDLGPSELVGRSCYQFVHGQDATRIRQSHVDLLDK 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 HGHMIVFRLSLGLTILACESRVSDHMDLGPSELVGRSCYQFVHGQDATRIRQSHVDLLDK 360

361 GQVMTGYYRWLQRAGGFVWLQSVATVAGSGKSPGEHHVLWVSHVLSQAEGGQTPLDAFQL 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 GQVMTGYYRWLQRAGGFVWLQSVATVAGSGKSPGEHHVLWVSHVLSQAEGGQTPLDAFQL 420

421 PASVACEEASSPGPEPTEPEPPTEGKQAAPAENEAPQTQGKRIKVEPGPRETKGSEDSGD 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 PASVACEEASSPGPEPTEPEPPTEGKQAAPAENEAPQTQGKRIKVEPGPRETKGSEDSGD 480

481 EDPSSHPATPRPEFTSVIRAGVLKQDPVRPWGLAPPGDPPPTLLHAGFLPPVVRGLCTPG 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 EDPSSHPATPRPEFTSVIRAGVLKQDPVRPWGLAPPGDPPPTLLHAGFLPPVVRGLCTPG 540

541 TIRYGPAELGLVYPHLQRLGPGPALPEAFYPPLGLPYPGPAGTRLPRKGD 590
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
541 TIRYGPAELGLVYPHLQRLGPGPALPEAFYPPLGLPYPGPAGTRLPRKGD 590