Affine Alignment
 
Alignment between HNF1B (top ENST00000617811.5 557aa) and HNF1B (bottom ENST00000617811.5 557aa) score 54796

001 MVSKLTSLQQELLSALLSSGVTKEVLVQALEELLPSPNFGVKLETLPLSPGSGAEPDTKP 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MVSKLTSLQQELLSALLSSGVTKEVLVQALEELLPSPNFGVKLETLPLSPGSGAEPDTKP 060

061 VFHTLTNGHAKGRLSGDEGSEDGDDYDTPPILKELQALNTEEAAEQRAEVDRMLSEDPWR 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 VFHTLTNGHAKGRLSGDEGSEDGDDYDTPPILKELQALNTEEAAEQRAEVDRMLSEDPWR 120

121 AAKMIKGYMQQHNIPQREVVDVTGLNQSHLSQHLNKGTPMKTQKRAALYTWYVRKQREIL 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 AAKMIKGYMQQHNIPQREVVDVTGLNQSHLSQHLNKGTPMKTQKRAALYTWYVRKQREIL 180

181 RQFNQTVQSSGNMTDKSSQDQLLFLFPEFSQQSHGPGQSDDACSEPTNKKMRRNRFKWGP 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 RQFNQTVQSSGNMTDKSSQDQLLFLFPEFSQQSHGPGQSDDACSEPTNKKMRRNRFKWGP 240

241 ASQQILYQAYDRQKNPSKEEREALVEECNRAECLQRGVSPSKAHGLGSNLVTEVRVYNWF 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 ASQQILYQAYDRQKNPSKEEREALVEECNRAECLQRGVSPSKAHGLGSNLVTEVRVYNWF 300

301 ANRRKEEAFRQKLAMDAYSSNQTHSLNPLLSHGSPHHQPSSSPPNKLSGVRYSQQGNNEI 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 ANRRKEEAFRQKLAMDAYSSNQTHSLNPLLSHGSPHHQPSSSPPNKLSGVRYSQQGNNEI 360

361 TSSSTISHHGNSAMVTSQSVLQQVSPASLDPGHNLLSPDGKMISVSGGGLPPVSTLTNIH 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 TSSSTISHHGNSAMVTSQSVLQQVSPASLDPGHNLLSPDGKMISVSGGGLPPVSTLTNIH 420

421 SLSHHNPQQSQNLIMTPLSGVMAIAQSLNTSQAQSVPVINSVAGSLAALQPVQFSQQLHS 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 SLSHHNPQQSQNLIMTPLSGVMAIAQSLNTSQAQSVPVINSVAGSLAALQPVQFSQQLHS 480

481 PHQQPLMQQSPGSHMAQQPFMAAVTQLQNSHMYAHKQEPPQYSHTSRFPSAMVVTDTSSI 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 PHQQPLMQQSPGSHMAQQPFMAAVTQLQNSHMYAHKQEPPQYSHTSRFPSAMVVTDTSSI 540

541 STLTNMSSSKQCPLQAW 557
    |||||||||||||||||
541 STLTNMSSSKQCPLQAW 557