Affine Alignment
 
Alignment between RPGR (top ENST00000645032.1 1152aa) and RPGR (bottom ENST00000645032.1 1152aa) score 115444

0001 MREPEELMPDSGAVFTFGKSKFAENNPGKFWFKNDVPVHLSCGDEHSAVVTGNNKLYMFG 0060
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0001 MREPEELMPDSGAVFTFGKSKFAENNPGKFWFKNDVPVHLSCGDEHSAVVTGNNKLYMFG 0060

0061 SNNWGQLGLGSKSAISKPTCVKALKPEKVKLAACGRNHTLVSTEGGNVYATGGNNEGQLG 0120
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0061 SNNWGQLGLGSKSAISKPTCVKALKPEKVKLAACGRNHTLVSTEGGNVYATGGNNEGQLG 0120

0121 LGDTEERNTFHVISFFTSEHKIKQLSAGSNTSAALTEDGRLFMWGDNSEGQIGLKNVSNV 0180
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0121 LGDTEERNTFHVISFFTSEHKIKQLSAGSNTSAALTEDGRLFMWGDNSEGQIGLKNVSNV 0180

0181 CVPQQVTIGKPVSWISCGYYHSAFVTTDGELYVFGEPENGKLGLPNQLLGNHRTPQLVSE 0240
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0181 CVPQQVTIGKPVSWISCGYYHSAFVTTDGELYVFGEPENGKLGLPNQLLGNHRTPQLVSE 0240

0241 IPEKVIQVACGGEHTVVLTENAVYTFGLGQFGQLGLGTFLFETSEPKVIENIRDQTISYI 0300
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0241 IPEKVIQVACGGEHTVVLTENAVYTFGLGQFGQLGLGTFLFETSEPKVIENIRDQTISYI 0300

0301 SCGENHTALITDIGLMYTFGDGRHGKLGLGLENFTNHFIPTLCSNFLRFIVKLVACGGCH 0360
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0301 SCGENHTALITDIGLMYTFGDGRHGKLGLGLENFTNHFIPTLCSNFLRFIVKLVACGGCH 0360

0361 MVVFAAPHRGVAKEIEFDEINDTCLSVATFLPYSSLTSGNVLQRTLSARMRRRERERSPD 0420
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0361 MVVFAAPHRGVAKEIEFDEINDTCLSVATFLPYSSLTSGNVLQRTLSARMRRRERERSPD 0420

0421 SFSMRRTLPPIEGTLGLSACFLPNSVFPRCSERNLQESVLSEQDLMQPEEPDYLLDEMTK 0480
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0421 SFSMRRTLPPIEGTLGLSACFLPNSVFPRCSERNLQESVLSEQDLMQPEEPDYLLDEMTK 0480

0481 EAEIDNSSTVESLGETTDILNMTHIMSLNSNEKSLKLSPVQKQKKQQTIGELTQDTALTE 0540
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0481 EAEIDNSSTVESLGETTDILNMTHIMSLNSNEKSLKLSPVQKQKKQQTIGELTQDTALTE 0540

0541 NDDSDEYEEMSEMKEGKACKQHVSQGIFMTQPATTIEAFSDEEVEIPEEKEGAEDSKGNG 0600
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0541 NDDSDEYEEMSEMKEGKACKQHVSQGIFMTQPATTIEAFSDEEVEIPEEKEGAEDSKGNG 0600

0601 IEEQEVEANEENVKVHGGRKEKTEILSDDLTDKAEVSEGKAKSVGEAEDGPEGRGDGTCE 0660
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0601 IEEQEVEANEENVKVHGGRKEKTEILSDDLTDKAEVSEGKAKSVGEAEDGPEGRGDGTCE 0660

0661 EGSSGAEHWQDEEREKGEKDKGRGEMERPGEGEKELAEKEEWKKRDGEEQEQKEREQGHQ 0720
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0661 EGSSGAEHWQDEEREKGEKDKGRGEMERPGEGEKELAEKEEWKKRDGEEQEQKEREQGHQ 0720

0721 KERNQEMEEGGEEEHGEGEEEEGDREEEEEKEGEGKEEGEGEEVEGEREKEEGERKKEER 0780
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0721 KERNQEMEEGGEEEHGEGEEEEGDREEEEEKEGEGKEEGEGEEVEGEREKEEGERKKEER 0780

0781 AGKEEKGEEEGDQGEGEEEETEGRGEEKEEGGEVEGGEVEEGKGEREEEEEEGEGEEEEG 0840
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0781 AGKEEKGEEEGDQGEGEEEETEGRGEEKEEGGEVEGGEVEEGKGEREEEEEEGEGEEEEG 0840

0841 EGEEEEGEGEEEEGEGKGEEEGEEGEGEEEGEEGEGEGEEEEGEGEGEEEGEGEGEEEEG 0900
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0841 EGEEEEGEGEEEEGEGKGEEEGEEGEGEEEGEEGEGEGEEEEGEGEGEEEGEGEGEEEEG 0900

0901 EGEGEEEGEGEGEEEEGEGKGEEEGEEGEGEGEEEEGEGEGEDGEGEGEEEEGEWEGEEE 0960
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0901 EGEGEEEGEGEGEEEEGEGKGEEEGEEGEGEGEEEEGEGEGEDGEGEGEEEEGEWEGEEE 0960

0961 EGEGEGEEEGEGEGEEGEGEGEEEEGEGEGEEEEGEEEGEEEGEGEEEGEGEGEEEEEGE 1020
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
0961 EGEGEGEEEGEGEGEEGEGEGEEEEGEGEGEEEEGEEEGEEEGEGEEEGEGEGEEEEEGE 1020

1021 VEGEVEGEEGEGEGEEEEGEEEGEEREKEGEGEENRRNREEEEEEEGKYQETGEEENERQ 1080
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1021 VEGEVEGEEGEGEGEEEEGEEEGEEREKEGEGEENRRNREEEEEEEGKYQETGEEENERQ 1080

1081 DGEEYKKVSKIKGSVKYGKHKTYQKKSVTNTQGNGKEQRSKMPVQSKRLLKNGPSGSKKF 1140
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1081 DGEEYKKVSKIKGSVKYGKHKTYQKKSVTNTQGNGKEQRSKMPVQSKRLLKNGPSGSKKF 1140

1141 WNNVLPHYLELK 1152
     ||||||||||||
1141 WNNVLPHYLELK 1152