Affine Alignment
 
Alignment between FOXC1 (top ENST00000645831.2 553aa) and FOXC1 (bottom ENST00000645831.2 553aa) score 55898

001 MQARYSVSSPNSLGVVPYLGGEQSYYRAAAAAAGGGYTAMPAPMSVYSHPAHAEQYPGGM 060
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
001 MQARYSVSSPNSLGVVPYLGGEQSYYRAAAAAAGGGYTAMPAPMSVYSHPAHAEQYPGGM 060

061 ARAYGPYTPQPQPKDMVKPPYSYIALITMAIQNAPDKKITLNGIYQFIMDRFPFYRDNKQ 120
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
061 ARAYGPYTPQPQPKDMVKPPYSYIALITMAIQNAPDKKITLNGIYQFIMDRFPFYRDNKQ 120

121 GWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDKKPGKGSYWTLDPDSYNMFENGSFLRRRRRFKKKDAV 180
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121 GWQNSIRHNLSLNECFVKVPRDDKKPGKGSYWTLDPDSYNMFENGSFLRRRRRFKKKDAV 180

181 KDKEEKDRLHLKEPPPPGRQPPPAPPEQADGNAPGPQPPPVRIQDIKTENGTCPSPPQPL 240
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
181 KDKEEKDRLHLKEPPPPGRQPPPAPPEQADGNAPGPQPPPVRIQDIKTENGTCPSPPQPL 240

241 SPAAALGSGSAAAVPKIESPDSSSSSLSSGSSPPGSLPSARPLSLDGADSAPPPPAPSAP 300
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
241 SPAAALGSGSAAAVPKIESPDSSSSSLSSGSSPPGSLPSARPLSLDGADSAPPPPAPSAP 300

301 PPHHSQGFSVDNIMTSLRGSPQSAAAELSSGLLASAAASSRAGIAPPLALGAYSPGQSSL 360
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
301 PPHHSQGFSVDNIMTSLRGSPQSAAAELSSGLLASAAASSRAGIAPPLALGAYSPGQSSL 360

361 YSSPCSQTSSAGSSGGGGGGAGAAGGAGGAGTYHCNLQAMSLYAAGERGGHLQGAPGGAG 420
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
361 YSSPCSQTSSAGSSGGGGGGAGAAGGAGGAGTYHCNLQAMSLYAAGERGGHLQGAPGGAG 420

421 GSAVDDPLPDYSLPPVTSSSSSSLSHGGGGGGGGGGQEAGHHPAAHQGRLTSWYLNQAGG 480
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421 GSAVDDPLPDYSLPPVTSSSSSSLSHGGGGGGGGGGQEAGHHPAAHQGRLTSWYLNQAGG 480

481 DLGHLASAAAAAAAAGYPGQQQNFHSVREMFESQRIGLNNSPVNGNSSCQMAFPSSQSLY 540
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481 DLGHLASAAAAAAAAGYPGQQQNFHSVREMFESQRIGLNNSPVNGNSSCQMAFPSSQSLY 540

541 RTSGAFVYDCSKF 553
    |||||||||||||
541 RTSGAFVYDCSKF 553