UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1CLEC4Dn/a
n/a
n/a
n/a
2e-127chr12 8,517,934C-type lectin domain family 4 member D (from RefSeq NM_080387.5)
2MIR223n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 66,018,924microRNA 223 (from RefSeq NR_029637.1)
3ADGRE3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 14,646,980adhesion G protein-coupled receptor E3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_032571.5)
4TREML3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 41,213,790triggering receptor expressed on myeloid cells like 3, pseudogene (from HGNC TREML3P)
5ADGRE1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 6,914,014adhesion G protein-coupled receptor E1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001974.5)
6ENSG00000234389n/a
    
    
     
n/achr2 102,439,594ENSG00000234389 (from geneSymbol)
7ENSG00000260467n/a
    
    
     
n/achr16 57,691,427ENSG00000260467 (from geneSymbol)
8VSTM1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,052,361V-set and transmembrane domain containing 1, transcript variant 5 (from RefSeq NR_110142.2)
9CD300LBn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 74,526,324CD300 molecule like family member b (from RefSeq NM_174892.4)
10PEAK3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 2,278,403PEAK family member 3 (from RefSeq NM_198532.3)
11SLA2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 36,629,257Src like adaptor 2, transcript variant 1 (from RefSeq NM_032214.4)
12CEACAM8n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 42,587,583CEA cell adhesion molecule 8 (from RefSeq NM_001816.4)
13NAIPP3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 69,620,879NAIPP3 (from geneSymbol)
14ENSG00000234484n/a
    
    
     
n/achr6 132,753,313ENSG00000234484 (from geneSymbol)
15TRBV20-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,627,024V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A075B6N2)
16ITGB2-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 44,925,364ITGB2 antisense RNA 1, transcript variant 6 (from RefSeq NR_038316.1)
17NAIPP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 70,476,014NAIPP1 (from geneSymbol)
18NCR1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,909,610natural cytotoxicity triggering receptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_004829.7)
19TRBV29-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,740,550V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A5B7)
20LILRA2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,582,038leukocyte immunoglobulin like receptor A2, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001130917.3)
21ENSG00000269271n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,589,864ENSG00000269271 (from geneSymbol)
22CD300Hn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 74,564,022CD300H molecule (gene/pseudogene), transcript variant 3 (from RefSeq NM_001405511.1)
23OR52K3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 4,475,284olfactory receptor family 52 subfamily K member 3 pseudogene (from HGNC OR52K3P)
24IFIT1Bn/a
    
    
     
n/achr10 89,381,630interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 1B (from RefSeq NM_001010987.2)
25TRBV19n/a
    
    
     
n/achr7 142,619,190V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A075B6N1)
26RAB3D26109
n/a
n/a
n/a
n/achr19 11,330,862RAB3D, member RAS oncogene family (from RefSeq NM_004283.4)
27CLCn/a
    
    
     
n/achr19 39,734,642Charcot-Leyden crystal galectin (from RefSeq NM_001828.6)
28KIR2DS4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,840,622killer cell immunoglobulin like receptor, two Ig domains and short cytoplasmic tail 4 (from HGNC KIR2DS4)
29ENSG00000218809n/a
    
    
     
n/achr6 41,270,057ENSG00000218809 (from geneSymbol)
30ENSG00000240535n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 55,034,261ENSG00000240535 (from geneSymbol)
31LINC00861n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 126,118,944long intergenic non-protein coding RNA 861 (from HGNC LINC00861)
32IFITM3P6n/a
    
    
     
n/achr12 47,135,699IFITM3P6 (from geneSymbol)
33ENSG00000243273n/a
    
    
     
n/achr3 150,964,727ENSG00000243273 (from geneSymbol)
34MS4A3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 60,063,890membrane spanning 4-domains A3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_006138.5)
35KIR3DL1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,823,623killer cell immunoglobulin like receptor, three Ig domains and long cytoplasmic tail 1, transcript variant 1 (reference allele) (from RefSeq NM_013289.4)
36ARL11n/a
    
    
     
n/achr13 49,631,189ADP ribosylation factor like GTPase 11 (from RefSeq NM_138450.6)
37ACTBP8n/a
    
    
     
n/achr6 88,276,435actin, beta pseudogene 8 (from HGNC ACTBP8)
38C5AR2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 47,339,752complement C5a receptor 2, transcript variant 3 (from RefSeq NM_001271750.2)
39LRTM1n/a
    
    
     
n/achr3 54,923,145leucine rich repeats and transmembrane domains 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_020678.4)
40FASLGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 172,662,989Fas ligand, transcript variant 1 (from RefSeq NM_000639.3)
41LYNn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 55,947,002LYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002350.4)
42TRBV28n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 142,720,910V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A5B6)
43SH2D1Bn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 162,403,702SH2 domain containing 1B (from RefSeq NM_053282.5)
44KIR2DP1n/a
    
    
     
n/achr19 54,761,197killer cell immunoglobulin like receptor, two Ig domains pseudogene 1 (from HGNC KIR2DP1)
45KIR2DL3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,745,782killer cell immunoglobulin like receptor, two Ig domains and long cytoplasmic tail 3 (from RefSeq NM_015868.3)
46TRBV5-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,321,110V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A578)
47ENSG00000236525n/a
    
    
     
n/achr2 102,434,648ENSG00000236525 (from geneSymbol)
48KLRD1n/a
n/a
n/a
n/a
0.005chr12 10,318,739killer cell lectin like receptor D1, transcript variant 12 (from RefSeq NR_182262.1)
49MMP8n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 102,718,375matrix metallopeptidase 8, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002424.3)
50TRAT1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 108,838,895T cell receptor associated transmembrane adaptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_016388.4)