UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1SOSTn/a
    
    
     
9e-96chr17 43,756,264sclerostin (from RefSeq NM_025237.3)
2ENSG00000253105n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 96,379,119uncharacterized LOC102724804, transcript variant 1 (from RefSeq NR_125828.1)
3TRAV39n/a
    
    
     
n/achr14 22,304,303V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J263)
4CTSL3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 87,773,376cathepsin L family member 3, pseudogene (from HGNC CTSL3P)
5CTSL3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 87,779,899cathepsin L family member 3, pseudogene (from RefSeq NR_027917.1)
6HCCAT5n/a
    
    
     
n/achr16 73,096,013hepatocellular carcinoma associated transcript 5 (non-protein coding) (from HGNC HCCAT5)
7LINC02468n/a
    
    
     
n/achr12 20,128,553long intergenic non-protein coding RNA 2468 (from HGNC LINC02468)
8RNU1-36Pn/a
    
    
     
n/achr4 88,000,319RNA, U1 small nuclear 36, pseudogene (from HGNC RNU1-36P)
9ENSG00000251599n/a
    
    
     
n/achr5 73,141,300uncharacterized LOC105379030 (from RefSeq NR_134252.1)
10ENSG00000225028n/a
    
    
     
n/achr1 47,819,151ENSG00000225028 (from geneSymbol)
11LINC01788n/a
    
    
     
n/achr1 70,746,460long intergenic non-protein coding RNA 1788 (from RefSeq NR_125938.1)
12LINC02303n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 45,711,112long intergenic non-protein coding RNA 2303, transcript variant 1 (from RefSeq NR_146546.1)
13ENSG00000248362n/a
    
    
     
n/achr5 147,886,482ENSG00000248362 (from geneSymbol)
14SLC6A18n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 1,235,785solute carrier family 6 member 18 (from RefSeq NM_182632.3)
15TMEM252-DTn/a
    
    
     
n/achr9 68,592,739TMEM252 divergent transcript (from RefSeq NR_187592.1)
16PPIAP52n/a
    
    
     
n/achr17 8,560,716peptidylprolyl isomerase A pseudogene 52 (from HGNC PPIAP52)
17ENSG00000248763n/a
    
    
     
n/achr4 69,068,141ENSG00000248763 (from geneSymbol)
18ENSG00000196893n/a
    
    
     
n/achr17 18,952,887ENSG00000196893 (from geneSymbol)
19ENSG00000206776n/a
    
    
     
n/achr8 119,388,408ENSG00000206776 (from geneSymbol)
20LINC01449n/a
    
    
     
n/achr7 41,117,555long intergenic non-protein coding RNA 1449 (from RefSeq NR_110832.1)
21ENSG00000244604n/a
    
    
     
n/achr17 8,561,403ENSG00000244604 (from geneSymbol)
22KRT8P23n/a
    
    
     
n/achr15 76,979,848keratin 8 pseudogene 23 (from HGNC KRT8P23)
23NOX4P1n/a
    
    
     
n/achr11 49,342,601NOX4P1 (from geneSymbol)
24ENSG00000290402n/a
    
    
     
n/achr11 49,372,870ENSG00000290402 (from geneSymbol)
25ENSG00000253373n/a
    
    
     
n/achr8 69,176,884ENSG00000253373 (from geneSymbol)
26ENSG00000255583n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 63,704,841ENSG00000255583 (from geneSymbol)
27ENSG00000259509n/a
    
    
     
n/achr15 46,827,742ENSG00000259509 (from geneSymbol)
28ENSG00000250781n/a
    
    
     
n/achr4 42,336,531ENSG00000250781 (from geneSymbol)
29DUX4L51n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 31,250,433double homeobox 4 like 51 (pseudogene) (from HGNC DUX4L51)
30LINC02725n/a
    
    
     
n/achr11 128,139,677LINC02725 (from geneSymbol)
31ENSG00000253398n/a
    
    
     
n/achr8 119,441,130ENSG00000253398 (from geneSymbol)
32LINC01593n/a
    
    
     
n/achr2 108,050,977long intergenic non-protein coding RNA 1593 (from RefSeq NR_135071.1)
33LINC02294n/a
    
    
     
n/achr14 26,798,801long intergenic non-protein coding RNA 2294 (from RefSeq NR_110033.1)
34RNU1-14Pn/a
    
    
     
n/achr7 53,366,133RNA, U1 small nuclear 14, pseudogene (from HGNC RNU1-14P)
35RN7SKP293n/a
    
    
     
n/achr6 12,406,633RNA, 7SK small nuclear pseudogene 293 (from HGNC RN7SKP293)
36BASP1P1n/a
    
    
     
n/achr13 22,897,673brain abundant, membrane attached signal protein 1 pseudogene 1 (from HGNC BASP1P1)
37LINC02524n/a
    
    
     
n/achr6 135,631,735long intergenic non-protein coding RNA 2524 (from RefSeq NR_183501.1)
38RN7SL356Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 76,967,641RNA, 7SL, cytoplasmic 356, pseudogene (from HGNC RN7SL356P)
39ENSG00000223436n/a
    
    
     
n/achr7 132,360,155ENSG00000223436 (from geneSymbol)
40ENSG00000248537n/a
    
    
     
n/achr5 9,392,878ENSG00000248537 (from geneSymbol)
41HMGB3P7n/a
    
    
     
n/achr13 101,802,183high mobility group box 3 pseudogene 7 (from HGNC HMGB3P7)
42LINC00603n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 40,032,118long intergenic non-protein coding RNA 603 (from HGNC LINC00603)
43ENSG00000226286n/a
    
    
     
n/achr1 3,133,318ENSG00000226286 (from geneSymbol)
44ENSG00000212391n/a
    
    
     
n/achr2 226,969,055ENSG00000212391 (from geneSymbol)
45ENSG00000223728n/a
    
    
     
n/achr1 147,841,660ENSG00000223728 (from geneSymbol)
46RN7SL278Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 76,977,062RNA, 7SL, cytoplasmic 278, pseudogene (from HGNC RN7SL278P)
47MIR1231n/a
    
    
     
n/achr1 201,808,656microRNA 1231 (from RefSeq NR_031599.1)
48UGT2B26Pn/a
    
    
     
n/achr4 69,036,204UDP glucuronosyltransferase family 2 member B26, pseudogene (from HGNC UGT2B26P)
49RPL34P9n/a
    
    
     
n/achr3 120,513,019ribosomal protein L34 pseudogene 9 (from HGNC RPL34P9)
50HMGN1P17n/a
    
    
     
n/achr5 56,381,928high mobility group nucleosome binding domain 1 pseudogene 17 (from HGNC HMGN1P17)