UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1GPR25n/a
n/a
n/a
n/a
2e-161chr1 200,873,579G protein-coupled receptor 25 (from RefSeq NM_005298.4)
2PEBP1P3n/a
    
    
     
n/achr1 198,679,586phosphatidylethanolamine binding protein 1 pseudogene 3 (from HGNC PEBP1P3)
3ENSG00000235081n/a
    
    
     
n/achr19 54,229,624ENSG00000235081 (from geneSymbol)
4RPL9P33n/a
    
    
     
n/achr19 51,621,418ribosomal protein L9 pseudogene 33 (from HGNC RPL9P33)
5ENSG00000228403n/a
    
    
     
n/achr10 48,878,335ENSG00000228403 (from geneSymbol)
6ENSG00000235140n/a
    
    
     
n/achr10 59,622,648ENSG00000235140 (from geneSymbol)
7IGHV1OR15-3n/a
    
    
     
n/achr15 22,178,324immunoglobulin heavy variable 1/OR15-3 (pseudogene) (from HGNC IGHV1OR15-3)
8MIR371Bn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 53,787,709microRNA 371b (from RefSeq NR_039909.1)
9OR7E115Pn/a
    
    
     
n/achr10 15,008,372olfactory receptor family 7 subfamily E member 115 pseudogene (from HGNC OR7E115P)
10ANTXRLP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 46,253,721anthrax toxin receptor-like pseudogene 1 (from HGNC ANTXRLP1)
11TRAV6n/a
    
    
     
n/achr14 21,768,784V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A075B6T7)
12MYO5BP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 41,293,506myosin VB pseudogene 1 (from HGNC MYO5BP1)
13MSX2P1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 58,157,414msh homeobox 2 pseudogene 1 (from HGNC MSX2P1)
14IL17Cn/a
    
    
     
n/achr16 88,639,520interleukin 17C (from RefSeq NM_013278.4)
15RUNX3-AS1n/a
    
    
     
n/achr1 24,962,221RUNX3-AS1 (from geneSymbol)
16ENSG00000253269n/a
    
    
     
n/achr5 169,776,165ENSG00000253269 (from geneSymbol)
17DDX11L10n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 12,606DEAD/H-box helicase 11 like 10 (from HGNC DDX11L10)
18VDAC2P3n/a
    
    
     
n/achr1 117,641,225voltage dependent anion channel 2 pseudogene 3 (from HGNC VDAC2P3)
19LINC02325n/a
    
    
     
n/achr14 97,504,358long intergenic non-protein coding RNA 2325 (from HGNC LINC02325)
20RPS18P1n/a
    
    
     
n/achr20 5,533,106ribosomal protein S18 pseudogene 1 (from HGNC RPS18P1)
21TRAV22n/a
    
    
     
n/achr14 22,070,882V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J277)
22SIRPG-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 1,640,990SIRPG antisense RNA 1 (from RefSeq NR_110090.1)
23ENSG00000260782n/a
    
    
     
n/achr16 46,790,969ENSG00000260782 (from geneSymbol)
24GCM1n/a
    
    
     
n/achr6 53,137,901glial cells missing transcription factor 1 (from RefSeq NM_003643.4)
25ENSG00000280266n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 157,526,554ENSG00000280266 (from geneSymbol)
26TRBV21-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,637,154T cell receptor beta variable 21-1 (pseudogene) (from HGNC TRBV21-1)
27ENSG00000268866n/a
    
    
     
n/achr19 58,224,987ENSG00000268866 (from geneSymbol)
28RLN3n/a
    
    
     
n/achr19 14,029,849relaxin 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_080864.4)
29TRAV36DV7n/a
    
    
     
n/achr14 22,227,000V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A075B6V5)
30BNIP3P9n/a
    
    
     
n/achr19 19,857,251BCL2 interacting protein 3 pseudogene 9 (from HGNC BNIP3P9)
31TUBBP9n/a
    
    
     
n/achr6 39,996,524tubulin beta class I pseudogene 9 (from HGNC TUBBP9)
32SAP30BP-AS1n/a
    
    
     
n/achr17 75,684,173SAP30BP antisense RNA 1, transcript variant 1 (from RefSeq NR_186496.1)
33RPL12P42n/a
    
    
     
n/achr19 13,158,373ribosomal protein L12 pseudogene 42 (from HGNC RPL12P42)
34GPR89Pn/a
    
    
     
n/achr6 27,737,747G protein-coupled receptor 89 pseudogene (from HGNC GPR89P)
35ENSG00000243648n/a
    
    
     
n/achr5 134,423,086ENSG00000243648 (from geneSymbol)
36TRBV7-6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 475,996T cell receptor beta variable 7-6 (from HGNC TRBV7-6)
37TRAV27n/a
    
    
     
n/achr14 22,148,314V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn, ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A087WT01)
38SPTA1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 158,648,709spectrin alpha, erythrocytic 1 (from RefSeq NM_003126.4)
39TRAV1-1n/a
    
    
     
n/achr14 21,622,202V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J248)
40TRAV8-1n/a
    
    
     
n/achr14 21,797,586V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0A6YYK1)
41CIB3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 16,167,446calcium and integrin binding family member 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_054113.4)
42ANKUB1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 149,776,827ankyrin repeat and ubiquitin domain containing 1, transcript variant 2 (from RefSeq NM_001315505.2)
43ENSG00000262358n/a
    
    
     
n/achr17 3,729,927ENSG00000262358 (from geneSymbol)
44RN7SL798Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 55,980,390RNA, 7SL, cytoplasmic 798, pseudogene (from HGNC RN7SL798P)
45RPL30P7n/a
    
    
     
n/achr5 10,488,981ribosomal protein L30 pseudogene 7 (from HGNC RPL30P7)
46IGHEn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,599,709Constant region of immunoglobulin heavy chains.  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:17576170, PubMed:20176268). (from UniProt P01854)
47TRAV24n/a
    
    
     
n/achr14 22,105,594V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J272)
48ENSG00000260744n/a
    
    
     
n/achr16 47,199,370ENSG00000260744 (from geneSymbol)
49TRAV20n/a
    
    
     
n/achr14 22,040,873V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J274)
50ENSG00000275427n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 1,299,320uncharacterized LOC286083 (from RefSeq NR_111948.1)