UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1SLCO4C1n/a
    
    
     
0chr5 102,265,135solute carrier organic anion transporter family member 4C1 (from RefSeq NM_180991.5)
2HAVCR1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 157,044,264hepatitis A virus cellular receptor 1, transcript variant 3 (from RefSeq NM_001173393.3)
3LINC01762n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 116,451,266long intergenic non-protein coding RNA 1762, transcript variant 1 (from RefSeq NR_125972.1)
4GK-IT1n/a
    
    
     
n/achrX 30,671,900GK intronic transcript 1 (from HGNC GK-IT1)
5LINC02294n/a
    
    
     
n/achr14 26,798,801long intergenic non-protein coding RNA 2294 (from RefSeq NR_110033.1)
6RPS2P36n/a
    
    
     
n/achr10 96,621,292ribosomal protein S2 pseudogene 36 (from HGNC RPS2P36)
7TMEM252-DTn/a
    
    
     
n/achr9 68,592,739TMEM252 divergent transcript (from RefSeq NR_187592.1)
8ENSG00000253269n/a
    
    
     
n/achr5 169,776,165ENSG00000253269 (from geneSymbol)
9LINC02772n/a
    
    
     
n/achr1 157,279,420long intergenic non-protein coding RNA 2772, transcript variant 3 (from RefSeq NR_183768.1)
10CTSL3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 87,773,376cathepsin L family member 3, pseudogene (from HGNC CTSL3P)
11CTSL3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 87,779,899cathepsin L family member 3, pseudogene (from RefSeq NR_027917.1)
12LINC01788n/a
    
    
     
n/achr1 70,746,460long intergenic non-protein coding RNA 1788 (from RefSeq NR_125938.1)
13TREML4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 41,233,615triggering receptor expressed on myeloid cells like 4 (from RefSeq NM_198153.3)
14RN7SL798Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 55,980,390RNA, 7SL, cytoplasmic 798, pseudogene (from HGNC RN7SL798P)
15ENSG00000255746n/a
    
    
     
n/achr12 255,370uncharacterized LOC102723544 (from RefSeq NR_120482.1)
16DDX11L10n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 12,606DEAD/H-box helicase 11 like 10 (from HGNC DDX11L10)
17ENSG00000251599n/a
    
    
     
n/achr5 73,141,300uncharacterized LOC105379030 (from RefSeq NR_134252.1)
18IFNGn/a
    
    
     
n/achr12 68,157,254interferon gamma (from RefSeq NM_000619.3)
19SCAT1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 78,620,016SCAT1 (from geneSymbol)
20AOAH-IT1n/a
    
    
     
n/achr7 36,598,977AOAH intronic transcript 1 (from RefSeq NR_046764.1)
21TRAV30n/a
    
    
     
n/achr14 22,168,708V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A087WSZ9)
22AQP10n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 154,323,209aquaporin 10 (from RefSeq NM_080429.3)
23KIR2DP1n/a
    
    
     
n/achr19 54,761,197killer cell immunoglobulin like receptor, two Ig domains pseudogene 1 (from HGNC KIR2DP1)
24YWHAEP7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 37,854,765tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein epsilon pseudogene 7 (from HGNC YWHAEP7)
25LINC02471n/a
    
    
     
n/achr12 40,183,766long intergenic non-protein coding RNA 2471 (from HGNC LINC02471)
26ORMDL1P1n/a
    
    
     
n/achr10 10,776,442ORMDL1P1 (from geneSymbol)
27PEBP1P3n/a
    
    
     
n/achr1 198,679,586phosphatidylethanolamine binding protein 1 pseudogene 3 (from HGNC PEBP1P3)
28ENSG00000249309n/a
    
    
     
n/achr4 153,724,024ENSG00000249309 (from geneSymbol)
29ENSG00000261245n/a
    
    
     
n/achr16 31,361,486ENSG00000261245 (from geneSymbol)
30GCM1n/a
    
    
     
n/achr6 53,137,901glial cells missing transcription factor 1 (from RefSeq NM_003643.4)
31FILNC1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 139,769,057FOXO induced long non-coding RNA 1 (from HGNC FILNC1)
32MPHOSPH10P1n/a
    
    
     
n/achr16 53,369,032MPHOSPH10P1 (from geneSymbol)
33KIR3DX1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,538,263killer cell immunoglobulin like receptor, three Ig domains X1 (from HGNC KIR3DX1)
34ENSG00000290933n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,539,265killer cell immunoglobulin like receptor, three Ig domains X1 (pseudogene), transcript variant 1 (from RefSeq NR_026716.2)
35MMP10n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 102,775,565matrix metallopeptidase 10 (from RefSeq NM_002425.3)
36RN7SL172Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 121,654,145RNA, 7SL, cytoplasmic 172, pseudogene (from HGNC RN7SL172P)
37GYPAn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 144,125,010glycophorin A (MNS blood group), transcript variant 1 (from RefSeq NM_002099.8)
38ENSG00000285783n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 144,490,996ENSG00000285783 (from geneSymbol)
39BNIP3P43n/a
    
    
     
n/achr21 13,120,525BNIP3P43 (from geneSymbol)
40DEFA8Pn/a
    
    
     
n/achr8 6,951,162defensin alpha 8, pseudogene (from RefSeq NR_073407.1)
41ENSG00000256249n/a
    
    
     
n/achr12 122,701,552ENSG00000256249 (from geneSymbol)
42RNU2-6Pn/a
    
    
     
n/achr13 46,374,495RNA, U2 small nuclear 6, pseudogene (from HGNC RNU2-6P)
43LINC02524n/a
    
    
     
n/achr6 135,631,735long intergenic non-protein coding RNA 2524 (from RefSeq NR_183501.1)
44TRAV41n/a
    
    
     
n/achr14 22,320,439V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J266)
45MGC27382n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 78,299,543uncharacterized MGC27382 (from RefSeq NR_027310.2)
46LINC02303n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 45,711,112long intergenic non-protein coding RNA 2303, transcript variant 1 (from RefSeq NR_146546.1)
47ENSG00000272046n/a
    
    
     
n/achr13 87,809,433ENSG00000272046 (from geneSymbol)
48RN7SKP51n/a
    
    
     
n/achr6 117,301,606RNA, 7SK small nuclear pseudogene 51 (from HGNC RN7SKP51)
49ENSG00000269353n/a
    
    
     
n/achr19 40,946,898ENSG00000269353 (from geneSymbol)
50LINC02938n/a
    
    
     
n/achr13 44,248,883LINC02938 (from geneSymbol)