UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1FCAMRn/a
n/a
n/a
n/a
0chr1 206,964,213Fc alpha and mu receptor, transcript variant 3 (from RefSeq NM_001170631.2)
2LINC02294n/a
    
    
     
n/achr14 26,798,801long intergenic non-protein coding RNA 2294 (from RefSeq NR_110033.1)
3LINC02274n/a
    
    
     
n/achr14 73,826,347long intergenic non-protein coding RNA 2274 (from RefSeq NR_135238.1)
4PRKAG2-AS2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 151,808,655PRKAG2 antisense RNA 2 (from RefSeq NR_171033.1)
5ENSG00000226733n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 50,137,311ENSG00000226733 (from geneSymbol)
6CTSL3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 87,773,376cathepsin L family member 3, pseudogene (from HGNC CTSL3P)
7CTSL3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 87,779,899cathepsin L family member 3, pseudogene (from RefSeq NR_027917.1)
8ENSG00000271044n/a
    
    
     
n/achr15 84,940,818ENSG00000271044 (from geneSymbol)
9ENSG00000251599n/a
    
    
     
n/achr5 73,141,300uncharacterized LOC105379030 (from RefSeq NR_134252.1)
10ENSG00000278690n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 36,012,697ENSG00000278690 (from geneSymbol)
11TMEM174n/a
    
    
     
n/achr5 73,174,168transmembrane protein 174 (from RefSeq NM_153217.3)
12PDZK1P1n/a
    
    
     
n/achr1 148,001,946PDZ domain containing 1 pseudogene 1 (from HGNC PDZK1P1)
13LINC02303n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 45,711,112long intergenic non-protein coding RNA 2303, transcript variant 1 (from RefSeq NR_146546.1)
14LINC01762n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 116,451,266long intergenic non-protein coding RNA 1762, transcript variant 1 (from RefSeq NR_125972.1)
15HMGN2P47n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 67,000,949high mobility group nucleosomal binding domain 2 pseudogene 47 (from HGNC HMGN2P47)
16SLC6A18n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 1,235,785solute carrier family 6 member 18 (from RefSeq NM_182632.3)
17UGT2B11n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 69,207,349UDP glucuronosyltransferase family 2 member B11 (from RefSeq NM_001073.3)
18TMEM252-DTn/a
    
    
     
n/achr9 68,592,739TMEM252 divergent transcript (from RefSeq NR_187592.1)
19CRPP1n/a
    
    
     
n/achr1 159,705,295C-reactive protein pseudogene 1 (from HGNC CRPP1)
20LINC01788n/a
    
    
     
n/achr1 70,746,460long intergenic non-protein coding RNA 1788 (from RefSeq NR_125938.1)
21ENSG00000261058n/a
    
    
     
n/achr16 75,131,879ENSG00000261058 (from geneSymbol)
22RPL7AP34n/a
    
    
     
n/achr6 63,549,108ribosomal protein L7a pseudogene 34 (from HGNC RPL7AP34)
23ENSG00000228697n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 168,448,579uncharacterized LOC125312414, transcript variant 4 (from RefSeq NR_176087.1)
24ENSG00000248763n/a
    
    
     
n/achr4 69,068,141ENSG00000248763 (from geneSymbol)
25RIPPLY1n/a
    
    
     
n/achrX 106,901,702ripply transcriptional repressor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_138382.3)
26ENSG00000224417n/a
    
    
     
n/achr6 168,300,091ENSG00000224417 (from geneSymbol)
27RNU1-47Pn/a
    
    
     
n/achr14 99,945,396RNA, U1 small nuclear 47, pseudogene (from HGNC RNU1-47P)
28UGT1A2Pn/a
    
    
     
n/achr2 233,747,646UDP glucuronosyltransferase family 1 member A2, pseudogene (from HGNC UGT1A2P)
29ENSG00000250696n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 69,198,287uncharacterized LOC105377267 (from RefSeq NR_136191.1)
30ENSG00000237158n/a
    
    
     
n/achr9 6,569,102ENSG00000237158 (from geneSymbol)
31ERVH-1n/a
    
    
     
n/achr4 23,728,420endogenous retrovirus group H member 1 (from HGNC ERVH-1)
32MIR1236n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 31,956,889microRNA 1236 (from RefSeq NR_031601.1)
33RNU1-75Pn/a
    
    
     
n/achr1 119,331,461RNA, U1 small nuclear 75, pseudogene (from HGNC RNU1-75P)
34ENSG00000214890n/a
    
    
     
n/achr5 79,000,618ENSG00000214890 (from geneSymbol)
35MIR1227n/a
    
    
     
n/achr19 2,234,105microRNA 1227 (from RefSeq NR_031596.1)
36IGHVII-78-1n/a
    
    
     
n/achr14 106,865,761immunoglobulin heavy variable (II)-78-1 (pseudogene) (from HGNC IGHVII-78-1)
37AFPn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 73,446,197alpha fetoprotein, transcript variant 2 (from RefSeq NM_001354717.2)
38BASP1P1n/a
    
    
     
n/achr13 22,897,673brain abundant, membrane attached signal protein 1 pseudogene 1 (from HGNC BASP1P1)
39LINC02512n/a
    
    
     
n/achr4 170,357,700long intergenic non-protein coding RNA 2512 (from HGNC LINC02512)
40RNA5SP163n/a
    
    
     
n/achr4 71,759,567RNA, 5S ribosomal pseudogene 163 (from HGNC RNA5SP163)
41RPS24P17n/a
    
    
     
n/achr16 56,906,745ribosomal protein S24 pseudogene 17 (from HGNC RPS24P17)
42AMD1P4n/a
    
    
     
n/achr6 11,862,298adenosylmethionine decarboxylase 1 pseudogene 4 (from HGNC AMD1P4)
43LINC02938n/a
    
    
     
n/achr13 44,248,883LINC02938 (from geneSymbol)
44Y_RNAn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 44,344,886Y_RNA (from geneSymbol)
45AZGP1P2n/a
    
    
     
n/achr7 101,288,626alpha-2-glycoprotein 1, zinc-binding pseudogene 2 (from HGNC AZGP1P2)
46KILHn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 53,589,148KRT19 interacting long noncoding RNA in hepatocellular carcinoma (from RefSeq NR_110840.1)
47LINC01780n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 119,342,217long intergenic non-protein coding RNA 1780 (from RefSeq NR_146623.1)
48LINC01687n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 22,053,838long intergenic non-protein coding RNA 1687 (from HGNC LINC01687)
49RPL6P23n/a
    
    
     
n/achr8 94,202,482RPL6P23 (from geneSymbol)
50TRAV30n/a
    
    
     
n/achr14 22,168,708V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A087WSZ9)