UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1PMCHn/a
    
    
     
8e-95chr12 102,197,146pro-melanin concentrating hormone (from RefSeq NM_002674.4)
2HCRTn/a
    
    
     
n/achr17 42,184,756hypocretin neuropeptide precursor (from RefSeq NM_001524.1)
3RTL1n/a
    
    
     
n/achr14 100,891,737retrotransposon Gag like 1 (from RefSeq NM_001134888.3)
4MIR433n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 100,881,932microRNA 433 (from RefSeq NR_029966.1)
5ENSG00000270978n/a
    
    
     
n/achr5 151,849,838ENSG00000270978 (from geneSymbol)
6LINC02642n/a
    
    
     
n/achr10 7,458,100long intergenic non-protein coding RNA 2642, transcript variant 12 (from RefSeq NR_184124.1)
7PLEKHA3P1n/a
    
    
     
n/achr19 41,521,516pleckstrin homology domain containing A3 pseudogene 1 (from HGNC PLEKHA3P1)
8GSX1n/a
    
    
     
n/achr13 27,793,625GS homeobox 1 (from RefSeq NM_145657.3)
9SNORA14Bn/a
    
    
     
n/achr1 235,127,870small nucleolar RNA, H/ACA box 14B (from RefSeq NR_002956.1)
10ENSG00000248571n/a
    
    
     
n/achr4 152,668,237ENSG00000248571 (from geneSymbol)
11ENSG00000235419n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 230,550,300ENSG00000235419 (from geneSymbol)
12ENSG00000225370n/a
    
    
     
n/achr19 54,671,911ENSG00000225370 (from geneSymbol)
13TACR3n/a
    
    
     
n/achr4 103,653,008tachykinin receptor 3 (from RefSeq NM_001059.3)
14TRGV1n/a
    
    
     
n/achr7 38,367,877Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0A0MS02)
15CENPUP2n/a
    
    
     
n/achr12 25,093,307centromere protein U pseudogene 2 (from HGNC CENPUP2)
16STK16P1n/a
    
    
     
n/achr14 49,677,631serine/threonine kinase 16 pseudogene 1 (from HGNC STK16P1)
17ENSG00000262703n/a
    
    
     
n/achr16 11,348,732ENSG00000262703 (from geneSymbol)
18ENSG00000279578n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 48,849,695ENSG00000279578 (from geneSymbol)
19RNA5SP508n/a
    
    
     
n/achrX 76,655,068RNA, 5S ribosomal pseudogene 508 (from HGNC RNA5SP508)
20ENSG00000231424n/a
    
    
     
n/achr1 171,000,190ENSG00000231424 (from geneSymbol)
21BNIP3P43n/a
    
    
     
n/achr21 13,120,525BNIP3P43 (from geneSymbol)
22ENSG00000257258n/a
    
    
     
n/achr12 29,150,753ENSG00000257258 (from geneSymbol)
23SNORA74An/a
    
    
     
n/achr5 139,278,879small nucleolar RNA, H/ACA box 74A (from RefSeq NR_002915.1)
24RNU6-327Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 132,835,437RNA, U6 small nuclear 327, pseudogene (from HGNC RNU6-327P)
25MIR431n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 100,881,063microRNA 431 (from RefSeq NR_029965.1)
26KIR3DX1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,538,263killer cell immunoglobulin like receptor, three Ig domains X1 (from HGNC KIR3DX1)
27ENSG00000290933n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,539,265killer cell immunoglobulin like receptor, three Ig domains X1 (pseudogene), transcript variant 1 (from RefSeq NR_026716.2)
28ATP5MC2P3n/a
    
    
     
n/achr2 197,263,323ATP synthase membrane subunit c locus 2 pseudogene 3 (from HGNC ATP5MC2P3)
29ENSG00000258760n/a
    
    
     
n/achr14 65,269,580ENSG00000258760 (from geneSymbol)
30USP41Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 20,370,436USP41P (from geneSymbol)
31SLC15A5n/a
    
    
     
n/achr12 16,233,085solute carrier family 15 member 5 (from RefSeq NM_001170798.1)
32ENSG00000253824n/a
    
    
     
n/achr8 100,397,483ENSG00000253824 (from geneSymbol)
33MRPL9P1n/a
    
    
     
n/achr8 76,603,546mitochondrial ribosomal protein L9 pseudogene 1 (from HGNC MRPL9P1)
34ENSG00000268289n/a
    
    
     
n/achr19 17,053,540ENSG00000268289 (from geneSymbol)
35IKBKE-AS1n/a
    
    
     
n/achr1 206,494,422IKBKE antisense RNA 1 (from RefSeq NR_172918.1)
36E2F3P1n/a
    
    
     
n/achr17 35,490,623E2F transcription factor 3 pseudogene 1 (from HGNC E2F3P1)
37ELOCP28n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 2,538,433elongin C pseudogene 28 (from HGNC ELOCP28)
38HLA-DRB9n/a
    
    
     
n/achr6 32,466,660major histocompatibility complex, class II, DR beta 9 (pseudogene) (from HGNC HLA-DRB9)
39TPM3P8n/a
    
    
     
n/achr2 230,573,488tropomyosin 3 pseudogene 8 (from HGNC TPM3P8)
40CLEC19An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 19,298,339C-type lectin domain containing 19A (from RefSeq NM_001256720.2)
41ENSG00000244167n/a
    
    
     
n/achr7 7,178,138ENSG00000244167 (from geneSymbol)
42ENSG00000267312n/a
    
    
     
n/achr17 35,460,015ENSG00000267312 (from geneSymbol)
43POLR2CP1n/a
    
    
     
n/achr21 14,757,970RNA polymerase II subunit C pseudogene 1 (from HGNC POLR2CP1)
44PPP1R2P1n/a
    
    
     
n/achr6 32,879,524protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 2 pseudogene 1 (from HGNC PPP1R2P1)
45ENSG00000293216n/a
    
    
     
n/achr6 32,879,509ENSG00000293216 (from geneSymbol)
46ENSG00000255860n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 72,175,204ENSG00000255860 (from geneSymbol)
47ENSG00000256988n/a
    
    
     
n/achr12 4,817,638ENSG00000256988 (from geneSymbol)
48CDC6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 40,296,268cell division cycle 6 (from RefSeq NM_001254.4)
49ENSG00000229559n/a
    
    
     
n/achr6 37,546,935ENSG00000229559 (from geneSymbol)
50ENSG00000293212n/a
    
    
     
n/achr6 37,545,154ENSG00000293212 (from geneSymbol)