UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ADGRG5n/a
n/a
n/a
n/a
0chr16 57,559,916adhesion G protein-coupled receptor G5, transcript variant 3 (from RefSeq NM_001318481.2)
2ZC3H12Dn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 149,465,904zinc finger CCCH-type containing 12D (from RefSeq NM_207360.3)
3TMEM156n/a
    
    
     
n/achr4 38,999,576transmembrane protein 156, transcript variant 1 (from RefSeq NM_024943.3)
4CXCR3n/a
    
    
     
n/achrX 71,617,215C-X-C motif chemokine receptor 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001504.2)
5LINC02397n/a
    
    
     
n/achr12 92,479,271long intergenic non-protein coding RNA 2397 (from HGNC LINC02397)
6CLLU1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 92,426,259chronic lymphocytic leukemia up-regulated 1, transcript variant 2 (from RefSeq NR_027932.1)
7ENSG00000266923n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 92,452,605ENSG00000266923 (from geneSymbol)
8ENSG00000268027n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 41,550,221ENSG00000268027 (from geneSymbol)
9CARD11-AS1n/a
    
    
     
n/achr7 2,945,563CARD11 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_187443.1)
10PDCD1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 241,854,389programmed cell death 1 (from RefSeq NM_005018.3)
11LY9n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 160,812,214lymphocyte antigen 9, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002348.4)
12ENSG00000260997n/a
    
    
     
n/achr7 44,959,954ENSG00000260997 (from geneSymbol)
13IGHV1OR15-1n/a
    
    
     
n/achr15 22,160,649Immunoglobulins are composed of two identical heavy chains and  two identical light chains; disulfide-linked. (from UniProt A0A075B7D0)
14IGHV5-78n/a
    
    
     
n/achr14 106,851,270immunoglobulin heavy variable 5-78 (pseudogene) (from HGNC IGHV5-78)
15RHOHn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 40,221,999ras homolog family member H, transcript variant 6 (from RefSeq NM_004310.5)
16ENSG00000253690n/a
    
    
     
n/achr8 28,294,659ENSG00000253690 (from geneSymbol)
17LINC00996n/a
    
    
     
n/achr7 150,440,897long intergenic non-protein coding RNA 996 (from RefSeq NR_034033.1)
18ENSG00000269954n/a
    
    
     
n/achr8 11,558,591ENSG00000269954 (from geneSymbol)
19PDE6Gn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 81,653,500phosphodiesterase 6G, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002602.4)
20ENSG00000233665n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 48,984,800ENSG00000233665 (from geneSymbol)
21LINC00426n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 30,358,630long intergenic non-protein coding RNA 426 (from HGNC LINC00426)
22RPL7AP75n/a
    
    
     
n/achr15 59,407,558RPL7AP75 (from geneSymbol)
23CENPAn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 26,790,322centromere protein A, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001809.4)
24LAX1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 203,770,777lymphocyte transmembrane adaptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_017773.4)
25PRR11-AS1n/a
    
    
     
n/achr17 59,203,253PRR11-AS1 (from geneSymbol)
26GNGT2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 49,208,405G protein subunit gamma transducin 2, transcript variant 2 (from RefSeq NM_001198754.2)
27ENSG00000271680n/a
    
    
     
n/achr1 206,906,160ENSG00000271680 (from geneSymbol)
28GPR55n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 230,916,285G protein-coupled receptor 55 (from RefSeq NM_005683.4)
29CNR2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 23,891,938cannabinoid receptor 2 (from RefSeq NM_001841.3)
30SIRPGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 1,643,465signal regulatory protein gamma, transcript variant 1 (from RefSeq NM_018556.4)
31IKZF3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 39,811,015IKAROS family zinc finger 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_012481.5)
32SPC25n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 168,880,660SPC25 component of NDC80 kinetochore complex (from RefSeq NM_020675.4)
33APOBEC3B-AS1n/a
    
    
     
n/achr22 38,994,884APOBEC3B antisense RNA 1 (from RefSeq NR_104187.1)
34NCR3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 31,590,950natural cytotoxicity triggering receptor 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_147130.3)
35TRGV4n/a
    
    
     
n/achr7 38,354,116V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0C4DH28)
36IL12RB1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 18,072,964interleukin 12 receptor subunit beta 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_005535.3)
37ENSG00000267074n/a
    
    
     
n/achr17 35,504,980ENSG00000267074 (from geneSymbol)
38TLR7n/a
    
    
     
n/achrX 12,878,716toll like receptor 7 (from RefSeq NM_016562.4)
39XCL2n/a
    
    
     
n/achr1 168,542,382X-C motif chemokine ligand 2 (from RefSeq NM_003175.4)
40UBASH3An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 42,425,793ubiquitin associated and SH3 domain containing A, transcript variant 1 (from RefSeq NM_018961.4)
41GVINP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 6,718,245GTPase, very large interferon inducible pseudogene 1 (from RefSeq NR_003945.1)
42ENSG00000272825n/a
    
    
     
n/achr21 44,936,628ENSG00000272825 (from geneSymbol)
43TRGV3n/a
    
    
     
n/achr7 38,358,837V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt P03979)
44ENSG00000269050n/a
    
    
     
n/achr19 38,871,961ENSG00000269050 (from geneSymbol)
45TIGITn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 114,302,158T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (from RefSeq NM_173799.4)
46KIF18Bn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 44,936,242kinesin family member 18B, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001265577.2)
47SOWAHDn/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 119,759,395sosondowah ankyrin repeat domain family member D (from RefSeq NM_001105576.3)
48KIF4An/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 70,355,495kinesin family member 4A (from RefSeq NM_012310.5)
49CENPKn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 65,540,467centromere protein K, transcript variant 1 (from RefSeq NM_022145.5)
50CCL3L3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17_KI270909v1_alt 251,521C-C motif chemokine ligand 3 like 1, transcript variant 2 (from RefSeq NR_111964.2)