UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1CD96n/a
n/a
n/a
n/a
0chr3 111,597,284CD96 molecule, transcript variant 2 (from RefSeq NM_005816.5)
2PYHIN1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 158,954,305pyrin and HIN domain family member 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_152501.5)
3ENSG00000237568n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 89,265,168ENSG00000237568 (from geneSymbol)
4TXKn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 48,100,321TXK tyrosine kinase (from RefSeq NM_003328.3)
5GPR171n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 151,200,524G protein-coupled receptor 171 (from RefSeq NM_013308.4)
6FCRL6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 159,809,308Fc receptor like 6, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001004310.3)
7CXCR6n/a
    
    
     
n/achr3 45,945,907C-X-C motif chemokine receptor 6, transcript variant 1 (from RefSeq NM_006564.2)
8GVINP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 6,718,245GTPase, very large interferon inducible pseudogene 1 (from RefSeq NR_003945.1)
9KLRD1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 10,318,739killer cell lectin like receptor D1, transcript variant 12 (from RefSeq NR_182262.1)
10ITGB2-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 44,925,364ITGB2 antisense RNA 1, transcript variant 6 (from RefSeq NR_038316.1)
11CD5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 61,115,170CD5 molecule, transcript variant 1 (from RefSeq NM_014207.4)
12LINC00861n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 126,118,944long intergenic non-protein coding RNA 861 (from HGNC LINC00861)
13SCML4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 107,763,233Scm polycomb group protein like 4, transcript variant 1 (from RefSeq NM_198081.5)
14UBASH3An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 42,425,793ubiquitin associated and SH3 domain containing A, transcript variant 1 (from RefSeq NM_018961.4)
15ENSG00000267554n/a
    
    
     
n/achr17 35,470,348ENSG00000267554 (from geneSymbol)
16SLA2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 36,629,257Src like adaptor 2, transcript variant 1 (from RefSeq NM_032214.4)
17PIK3CGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 106,887,131phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma, transcript variant 3 (from RefSeq NM_001282427.2)
18XCL2n/a
    
    
     
n/achr1 168,542,382X-C motif chemokine ligand 2 (from RefSeq NM_003175.4)
19CTLA4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 203,870,868cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4, transcript variant 1 (from RefSeq NM_005214.5)
20TRBV20-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,627,024V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A075B6N2)
21UNC93B7n/a
    
    
     
n/achr4 9,495,901unc-93 homolog B7, pseudogene (from HGNC UNC93B7)
22ZBP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 57,612,139Z-DNA binding protein 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_030776.3)
23ENSG00000267074n/a
    
    
     
n/achr17 35,504,980ENSG00000267074 (from geneSymbol)
24NAIPP3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 69,620,879NAIPP3 (from geneSymbol)
25SIRPGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 1,643,465signal regulatory protein gamma, transcript variant 1 (from RefSeq NM_018556.4)
26TRGV4n/a
    
    
     
n/achr7 38,354,116V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0C4DH28)
27CD28n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 203,722,775CD28 molecule, transcript variant 1 (from RefSeq NM_006139.4)
28ARL11n/a
    
    
     
n/achr13 49,631,189ADP ribosylation factor like GTPase 11 (from RefSeq NM_138450.6)
29GFI1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 92,479,984growth factor independent 1 transcriptional repressor, transcript variant 1 (from RefSeq NM_005263.5)
30LAX1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 203,770,777lymphocyte transmembrane adaptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_017773.4)
31IL12RB1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 18,072,964interleukin 12 receptor subunit beta 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_005535.3)
32GRAP2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 39,937,402GRB2 related adaptor protein 2, transcript variant 3 (from RefSeq NM_004810.4)
33ENSG00000214846n/a
    
    
     
n/achr4 15,731,294ENSG00000214846 (from geneSymbol)
34ADAMTSL4-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 150,561,158ADAMTSL4 antisense RNA 1 (from HGNC ADAMTSL4-AS1)
35ENSG00000234389n/a
    
    
     
n/achr2 102,439,594ENSG00000234389 (from geneSymbol)
36ENSG00000237604n/a
    
    
     
n/achr21 44,175,971ENSG00000237604 (from geneSymbol)
37TIGITn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 114,302,158T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (from RefSeq NM_173799.4)
38ADGRE4Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 6,972,728adhesion G protein-coupled receptor E4, pseudogene (from HGNC ADGRE4P)
39ENSG00000290427n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 6,975,186adhesion G protein-coupled receptor E4, pseudogene, transcript variant 1 (from RefSeq NR_024075.2)
40IFITM3P6n/a
    
    
     
n/achr12 47,135,699IFITM3P6 (from geneSymbol)
41ENSG00000240535n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 55,034,261ENSG00000240535 (from geneSymbol)
42ICAM4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 10,287,737intercellular adhesion molecule 4 (Landsteiner-Wiener blood group), transcript variant 1 (from RefSeq NM_001544.5)
43LY9n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 160,812,214lymphocyte antigen 9, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002348.4)
44LAIR1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,358,157leukocyte associated immunoglobulin like receptor 1, transcript variant h (from RefSeq NR_110279.3)
45CXCR3n/a
    
    
     
n/achrX 71,617,215C-X-C motif chemokine receptor 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001504.2)
46ENSG00000271680n/a
    
    
     
n/achr1 206,906,160ENSG00000271680 (from geneSymbol)
47KLHL6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 183,521,628kelch like family member 6 (from RefSeq NM_130446.4)
48TRBV29-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,740,550V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A5B7)
49ENSG00000241886n/a
    
    
     
n/achrX 30,710,069ENSG00000241886 (from geneSymbol)
50TRAT1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 108,838,895T cell receptor associated transmembrane adaptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_016388.4)