UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1SPNS3n/a
n/a
n/a
n/a
0chr17 4,461,072SPNS lysolipid transporter 3, sphingosine-1-phosphate (putative), transcript variant 1 (from RefSeq NM_182538.5)
2LAIR1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,358,157leukocyte associated immunoglobulin like receptor 1, transcript variant h (from RefSeq NR_110279.3)
3LINC02978n/a
    
    
     
n/achr17 30,965,217LINC02978 (from geneSymbol)
4RN7SL138Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 30,959,707RNA, 7SL, cytoplasmic 138, pseudogene (from HGNC RN7SL138P)
5ENSG00000217078n/a
    
    
     
n/achr6 16,163,569ENSG00000217078 (from geneSymbol)
6UNC93B5n/a
    
    
     
n/achr11 67,713,853unc-93 homolog B5, pseudogene (from HGNC UNC93B5)
7ENSG00000238246n/a
    
    
     
n/achr10 20,081,294ENSG00000238246 (from geneSymbol)
8XCL1n/a
    
    
     
n/achr1 168,579,337X-C motif chemokine ligand 1 (from RefSeq NM_002995.3)
9PTPRN2-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 157,856,190PTPRN2 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_038966.1)
10KLHL2P1n/a
    
    
     
n/achr4 119,356,281kelch like family member 2 pseudogene 1 (from HGNC KLHL2P1)
11LINC03058n/a
    
    
     
n/achr14 20,784,090LINC03058 (from geneSymbol)
12SHISAL2An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 52,645,116shisa like 2A, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001042693.3)
13RPL10P19n/a
    
    
     
n/achr8 8,961,907ribosomal protein L10 pseudogene 19 (from HGNC RPL10P19)
14SELENOTP1n/a
    
    
     
n/achr9 6,278,910selenoprotein T pseudogene 1 (from HGNC SELENOTP1)
15AGA-DTn/a
    
    
     
n/achr4 177,561,052AGA divergent transcript, transcript variant 13 (from RefSeq NR_183789.1)
16ENSG00000262312n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 3,544,126ENSG00000262312 (from geneSymbol)
17ENSG00000267117n/a
    
    
     
n/achr19 55,694,338ENSG00000267117 (from geneSymbol)
18SCARNA10n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 6,510,386small Cajal body-specific RNA 10 (from RefSeq NR_004387.1)
19ENSG00000276232n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 6,510,398ENSG00000276232 (from geneSymbol)
20ENSG00000272334n/a
    
    
     
n/achr3 36,973,394ENSG00000272334 (from geneSymbol)
21ENSG00000273464n/a
    
    
     
n/achr21 29,657,618ENSG00000273464 (from geneSymbol)
22IFITM3P6n/a
    
    
     
n/achr12 47,135,699IFITM3P6 (from geneSymbol)
23TRGV2n/a
    
    
     
n/achr7 38,363,191V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A075B6R0)
24PSME2P2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 48,771,477proteasome activator subunit 2 pseudogene 2 (from HGNC PSME2P2)
25FAM21FPn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 45,714,435family with sequence similarity 21 member F, pseudogene (from HGNC FAM21FP)
26FGF7P6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 62,433,565fibroblast growth factor 7 pseudogene 6 (from HGNC FGF7P6)
27CEACAM16-AS1n/a
    
    
     
n/achr19 44,678,395CEACAM16-AS1 (from geneSymbol)
28CYLD-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 50,735,116CYLD antisense RNA 1, transcript variant 7 (from RefSeq NR_184279.1)
29NUTM2An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 87,230,213NUT family member 2A (from RefSeq NM_001099338.2)
30ENSG00000231613n/a
    
    
     
n/achr1 89,789,703ENSG00000231613 (from geneSymbol)
31TRAT1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 108,838,895T cell receptor associated transmembrane adaptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_016388.4)
32CD101-AS1n/a
    
    
     
n/achr1 117,042,486CD101 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_110786.1)
33KLHDC7Bn/a
    
    
     
n/achr22 50,548,461kelch domain containing 7B (from RefSeq NM_138433.5)
34ENSG00000269924n/a
    
    
     
n/achr8 47,527,772ENSG00000269924 (from geneSymbol)
35ENSG00000269949n/a
    
    
     
n/achr4 56,961,150ENSG00000269949 (from geneSymbol)
36PPIAP11n/a
    
    
     
n/achr5 82,009,848peptidylprolyl isomerase A pseudogene 11 (from HGNC PPIAP11)
37ENSG00000269397n/a
    
    
     
n/achr19 23,928,537ENSG00000269397 (from geneSymbol)
38HIGD1AP14n/a
    
    
     
n/achr4 109,673,983HIG1 hypoxia inducible domain family member 1A pseudogene 14 (from HGNC HIGD1AP14)
39TIGITn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 114,302,158T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (from RefSeq NM_173799.4)
40ATP5F1EP2n/a
    
    
     
n/achr13 27,945,337ATP synthase F1 subunit epsilon pseudogene 2 (from HGNC ATP5F1EP2)
41FTH1P3n/a
    
    
     
n/achr2 27,393,075ferritin heavy chain 1 pseudogene 3 (from HGNC FTH1P3)
42COP1-DTn/a
    
    
     
n/achr1 176,327,809COP1-DT (from geneSymbol)
43A2MP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 9,252,596alpha-2-macroglobulin pseudogene 1 (from HGNC A2MP1)
44A2MP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 9,231,370alpha-2-macroglobulin pseudogene 1 (from RefSeq NR_040112.1)
45ENSG00000291254n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 9,260,849ENSG00000291254 (from geneSymbol)
46ENSG00000280020n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 32,179,510ENSG00000280020 (from geneSymbol)
47PSME2P1n/a
    
    
     
n/achr5 98,213,761proteasome activator subunit 2 pseudogene 1 (from HGNC PSME2P1)
48ENSG00000225460n/a
    
    
     
n/achr9 89,472,464ENSG00000225460 (from geneSymbol)
49ABHD17AP5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 22,116,424abhydrolase domain containing 17A pseudogene 5 (from HGNC ABHD17AP5)
50TBCAP3n/a
    
    
     
n/achr4 98,909,692tubulin folding cofactor A pseudogene 3 (from HGNC TBCAP3)