UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1KLHL14n/a
n/a
n/a
n/a
0chr18 32,722,848kelch like family member 14 (from RefSeq NM_020805.3)
2TMEM26n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 61,430,011transmembrane protein 26, transcript variant 1 (from RefSeq NM_178505.8)
3PRTGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 55,677,348protogenin (from RefSeq NM_173814.6)
4ENSG00000240535n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 55,034,261ENSG00000240535 (from geneSymbol)
5ENSG00000248115n/a
    
    
     
n/achr4 52,951,888ENSG00000248115 (from geneSymbol)
6SUCNR1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 151,879,131succinate receptor 1 (from RefSeq NM_033050.6)
7SLC5A8n/a
    
    
     
n/achr12 101,182,865solute carrier family 5 member 8 (from RefSeq NM_145913.5)
8BNIP3P17n/a
    
    
     
n/achr19 20,222,166BCL2 interacting protein 3 pseudogene 17 (from HGNC BNIP3P17)
9OR5G5Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 56,802,325olfactory receptor family 5 subfamily G member 5 pseudogene (from HGNC OR5G5P)
10ENSG00000290749n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 56,811,253ENSG00000290749 (from geneSymbol)
11LINC02422n/a
    
    
     
n/achr12 31,918,142long intergenic non-protein coding RNA 2422 (from HGNC LINC02422)
12ENSG00000259869n/a
    
    
     
n/achr10 42,752,737uncharacterized LOC283028 (from RefSeq NR_136644.1)
13XCL2n/a
    
    
     
n/achr1 168,542,382X-C motif chemokine ligand 2 (from RefSeq NM_003175.4)
14GGT3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 18,782,524gamma-glutamyltransferase 3 pseudogene (from RefSeq NR_003267.1)
15TRGV4n/a
    
    
     
n/achr7 38,354,116V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0C4DH28)
16LINC03058n/a
    
    
     
n/achr14 20,784,090LINC03058 (from geneSymbol)
17CD180n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 67,188,206CD180 molecule (from RefSeq NM_005582.3)
18NOX5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 69,038,728NADPH oxidase 5, transcript variant 1 (from RefSeq NM_024505.4)
19SPESP1-NOX5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 68,993,629SPESP1-NOX5 (from geneSymbol)
20RNU5B-2Pn/a
    
    
     
n/achr3 40,498,947RNA, U5B small nuclear 2, pseudogene (from HGNC RNU5B-2P)
21PHF10P2n/a
    
    
     
n/achr22 25,349,932PHF10P2 (from geneSymbol)
22ENSG00000262312n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 3,544,126ENSG00000262312 (from geneSymbol)
23ENSG00000255089n/a
    
    
     
n/achr11 322,208ENSG00000255089 (from geneSymbol)
24LINC01539n/a
    
    
     
n/achr18 56,097,437long intergenic non-protein coding RNA 3069 (from RefSeq NR_148972.1)
25TRGV2n/a
    
    
     
n/achr7 38,363,191V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A075B6R0)
26XCL1n/a
    
    
     
n/achr1 168,579,337X-C motif chemokine ligand 1 (from RefSeq NM_002995.3)
27ENSG00000271680n/a
    
    
     
n/achr1 206,906,160ENSG00000271680 (from geneSymbol)
28ENSG00000272858n/a
    
    
     
n/achr22 28,815,288ENSG00000272858 (from geneSymbol)
29UBE2CP2n/a
    
    
     
n/achr18 22,900,740ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 2 (from HGNC UBE2CP2)
30ENSG00000272334n/a
    
    
     
n/achr3 36,973,394ENSG00000272334 (from geneSymbol)
31GPR182n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 56,996,469G protein-coupled receptor 182 (from RefSeq NM_007264.4)
32ENSG00000240710n/a
    
    
     
n/achr1 204,609,800ENSG00000240710 (from geneSymbol)
33ENSG00000226355n/a
    
    
     
n/achr9 129,443,075uncharacterized LOC105376291 (from RefSeq NR_188645.1)
34CRIPTOn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 46,580,122cripto, EGF-CFC family member, transcript variant 1 (from RefSeq NM_003212.4)
35FAM240An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 46,619,534family with sequence similarity 240 member A (from RefSeq NM_001195442.2)
36ENSG00000283877n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 46,599,188ENSG00000283877 (from geneSymbol)
37CLEC4Fn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 70,814,621C-type lectin domain family 4 member F, transcript variant 1 (from RefSeq NM_173535.3)
38ENSG00000260022n/a
    
    
     
n/achr16 884,435ENSG00000260022 (from geneSymbol)
39ENSG00000267986n/a
    
    
     
n/achr19 8,581,937ENSG00000267986 (from geneSymbol)
40TIGITn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 114,302,158T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (from RefSeq NM_173799.4)
41ENSG00000260971n/a
    
    
     
n/achr1 56,311,835ENSG00000260971 (from geneSymbol)
42ENSG00000284686n/a
    
    
     
n/achr1 56,386,394Membrane ; Multi-  pass membrane protein (from UniProt A0A286YES4)
43ENSG00000266783n/a
    
    
     
n/achr18 2,561,696ENSG00000266783 (from geneSymbol)
44RPS18P14n/a
    
    
     
n/achr22 31,559,711ribosomal protein S18 pseudogene 14 (from HGNC RPS18P14)
45MATN1n/a
    
    
     
n/achr1 30,717,431matrilin 1 (from RefSeq NM_002379.3)
46IGHV3-66n/a
    
    
     
n/achr14 106,675,280V region of the variable domain of immunoglobulin heavy  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0C4DH42)
47ENSG00000270571n/a
    
    
     
n/achr2 75,172,157uncharacterized LOC105374811, transcript variant 3 (from RefSeq NR_168011.1)
48MIR5001n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 232,550,523microRNA 5001 (from RefSeq NR_049797.1)
49DUX4L27n/a
    
    
     
n/achr12 34,209,045double homeobox 4 like 27 (from HGNC DUX4L27)
50LRTM1n/a
    
    
     
n/achr3 54,923,145leucine rich repeats and transmembrane domains 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_020678.4)