UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1MIRLET7Dn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 94,178,877microRNA let-7d (from RefSeq NR_029481.1)
2ENSG00000258878n/a
    
    
     
n/achr14 65,234,808ENSG00000258878 (from geneSymbol)
3RNU6-216Pn/a
    
    
     
n/achr11 74,968,240RNA, U6 small nuclear 216, pseudogene (from HGNC RNU6-216P)
4MIR27Bn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 95,085,493microRNA 27b (from RefSeq NR_029665.1)
5RNU6-722Pn/a
    
    
     
n/achrX 48,959,230RNA, U6 small nuclear 722, pseudogene (from HGNC RNU6-722P)
6ENSG00000269954n/a
    
    
     
n/achr8 11,558,591ENSG00000269954 (from geneSymbol)
7ENSG00000259421n/a
    
    
     
n/achr22 39,070,542ENSG00000259421 (from geneSymbol)
8DDX5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 64,502,271DEAD-box helicase 5, transcript variant 2 (from RefSeq NM_004396.5)
9MIR3064n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 64,500,806microRNA 3064 (from RefSeq NR_039891.2)
10RPL21P7n/a
    
    
     
n/achr14 65,267,164ribosomal protein L21 pseudogene 7 (from HGNC RPL21P7)
11ENSG00000267016n/a
    
    
     
n/achr17 77,470,966ENSG00000267016 (from geneSymbol)
12VTRNA2-1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 136,080,533vault RNA 2-1 (from RefSeq NR_030583.3)
13FCRL4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 157,585,916Fc receptor like 4 (from RefSeq NM_031282.3)
14HNRNPA1P70n/a
    
    
     
n/achr12 68,036,310heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 70 (from HGNC HNRNPA1P70)
15ENSG00000258760n/a
    
    
     
n/achr14 65,269,580ENSG00000258760 (from geneSymbol)
16RN7SL32Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 233,205,339RNA, 7SL, cytoplasmic 32, pseudogene (from HGNC RN7SL32P)
17IGLJ3n/a
    
    
     
n/achr22 22,904,937immunoglobulin lambda joining 3 (from HGNC IGLJ3)
18SNORA80En/a
    
    
     
n/achr1 155,919,977small nucleolar RNA, H/ACA box 80E (from RefSeq NR_002974.1)
19SNORA22Bn/a
    
    
     
n/achr7 56,055,433small nucleolar RNA, H/ACA box 22B (from RefSeq NR_145724.1)
20Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr1 85,264,349Y_RNA (from geneSymbol)
21RN7SL650Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 21,429,657RNA, 7SL, cytoplasmic 650, pseudogene (from HGNC RN7SL650P)
22TPM3P8n/a
    
    
     
n/achr2 230,573,488tropomyosin 3 pseudogene 8 (from HGNC TPM3P8)
23RNY1P11n/a
    
    
     
n/achr7 129,164,905RNA, Ro-associated Y1 pseudogene 11 (from HGNC RNY1P11)
24RNA5SP69n/a
    
    
     
n/achr1 178,560,971RNA, 5S ribosomal pseudogene 69 (from HGNC RNA5SP69)
25ENSG00000279846n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 99,498,093ENSG00000279846 (from geneSymbol)
26RNFT1P2n/a
    
    
     
n/achr1 78,170,859ring finger protein, transmembrane 1 pseudogene 2 (from HGNC RNFT1P2)
27ENSG00000244167n/a
    
    
     
n/achr7 7,178,138ENSG00000244167 (from geneSymbol)
28ENSG00000266897n/a
    
    
     
n/achr19 13,131,990ENSG00000266897 (from geneSymbol)
29MAF1P1n/a
    
    
     
n/achr3 133,491,164MAF1P1 (from geneSymbol)
30IGHEn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,599,709Constant region of immunoglobulin heavy chains.  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:17576170, PubMed:20176268). (from UniProt P01854)
31RNVU1-15n/a
    
    
     
n/achr1 144,412,658RNA, variant U1 small nuclear 15 (from RefSeq NR_104076.1)
32LINC02909n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 25,000,733LINC02909 (from geneSymbol)
33IGHV1OR15-3n/a
    
    
     
n/achr15 22,178,324immunoglobulin heavy variable 1/OR15-3 (pseudogene) (from HGNC IGHV1OR15-3)
34ENSG00000225885n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 118,345,906ENSG00000225885 (from geneSymbol)
35RPL34P17n/a
    
    
     
n/achr8 52,313,327ribosomal protein L34 pseudogene 17 (from HGNC RPL34P17)
36MIR34An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 9,151,722microRNA 34a (from RefSeq NR_029610.1)
37RNU6-967Pn/a
    
    
     
n/achr19 31,787,201RNA, U6 small nuclear 967, pseudogene (from HGNC RNU6-967P)
38ATP5MC2P3n/a
    
    
     
n/achr2 197,263,323ATP synthase membrane subunit c locus 2 pseudogene 3 (from HGNC ATP5MC2P3)
39OR5AK1Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 57,018,560olfactory receptor family 5 subfamily AK member 1 pseudogene (from HGNC OR5AK1P)
40TIFABn/a
    
    
     
n/achr5 135,448,288TIFA inhibitor (from RefSeq NM_001099221.2)
41TRGV1n/a
    
    
     
n/achr7 38,367,877Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0A0MS02)
42VTRNA1-3n/a
    
    
     
n/achr5 140,726,202vault RNA 1-3 (from RefSeq NR_026705.1)
43SNORA68Bn/a
    
    
     
n/achr19 32,608,403small nucleolar RNA, H/ACA box 68B (from RefSeq NR_145718.1)
44IGKV7-3n/a
    
    
     
n/achr2 88,915,229immunoglobulin kappa variable 7-3 (pseudogene) (from HGNC IGKV7-3)
45LINC01775n/a
    
    
     
n/achr19 2,460,560long intergenic non-protein coding RNA 1775 (from RefSeq NR_134931.1)
46ENSG00000261552n/a
    
    
     
n/achr16 28,989,959ENSG00000261552 (from geneSymbol)
47ENSG00000235419n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 230,550,300ENSG00000235419 (from geneSymbol)
48ENSG00000250507n/a
    
    
     
n/achr19 54,329,853ENSG00000250507 (from geneSymbol)
49RNVU1-19n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 120,850,902RNA, variant U1 small nuclear 19 (from RefSeq NR_104086.2)
50DUX4L9n/a
    
    
     
n/achr4 190,022,036double homeobox 4 like 9 (from HGNC DUX4L9)