UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr12 113,178,471Y_RNA (from geneSymbol)
2MIR5091n/a
    
    
     
n/achr4 13,627,911microRNA 5091 (from RefSeq NR_049814.1)
3ATP6V0CP2n/a
    
    
     
n/achr3 111,478,840ATPase H+ transporting V0 subunit c pseudogene 2 (from HGNC ATP6V0CP2)
4MIR3972n/a
    
    
     
n/achr1 17,277,932microRNA 3972 (from RefSeq NR_039768.1)
5Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr1 111,446,853Y_RNA (from geneSymbol)
6ENSG00000251858n/a
    
    
     
n/achr14 41,594,527ENSG00000251858 (from geneSymbol)
7ARIH1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 72,538,658ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 1 (from RefSeq NM_005744.5)
8MIR630n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 72,587,265microRNA 630 (from RefSeq NR_030359.1)
9RNU6-190Pn/a
    
    
     
n/achr6 17,619,583RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene (from HGNC RNU6-190P)
10RN7SL306Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 128,970,881RNA, 7SL, cytoplasmic 306, pseudogene (from HGNC RN7SL306P)
11RNU6-1161Pn/a
    
    
     
n/achr22 45,624,581RNA, U6 small nuclear 1161, pseudogene (from HGNC RNU6-1161P)
12RNU6-199Pn/a
    
    
     
n/achr12 51,162,954RNA, U6 small nuclear 199, pseudogene (from HGNC RNU6-199P)
13RNU6-553Pn/a
    
    
     
n/achr4 105,407,044RNA, U6 small nuclear 553, pseudogene (from HGNC RNU6-553P)
14RNU6-1280Pn/a
    
    
     
n/achr15 85,651,575RNA, U6 small nuclear 1280, pseudogene (from HGNC RNU6-1280P)
15RPS18P8n/a
    
    
     
n/achr6 4,979,283ribosomal protein S18 pseudogene 8 (from HGNC RPS18P8)
16Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr17 62,036,889Y_RNA (from geneSymbol)
17ATP6V0E1P1n/a
    
    
     
n/achr5 132,948,605ATPase H+ transporting V0 subunit e1 pseudogene 1 (from HGNC ATP6V0E1P1)
18ENSG00000285879n/a
    
    
     
n/achr17 62,038,148ENSG00000285879 (from geneSymbol)
19ENSG00000251691n/a
    
    
     
n/achr4 69,306,821ENSG00000251691 (from geneSymbol)
20RNA5SP394n/a
    
    
     
n/achr15 49,982,502RNA, 5S ribosomal pseudogene 394 (from HGNC RNA5SP394)
21RNU6-1231Pn/a
    
    
     
n/achr10 102,803,980RNA, U6 small nuclear 1231, pseudogene (from HGNC RNU6-1231P)
22RNU6-1143Pn/a
    
    
     
n/achr11 3,714,823RNA, U6 small nuclear 1143, pseudogene (from HGNC RNU6-1143P)
23ENSG00000271598n/a
    
    
     
n/achr19 21,025,978ENSG00000271598 (from geneSymbol)
24SNORA74Dn/a
    
    
     
n/achr5 139,276,250small nucleolar RNA, H/ACA box 74D (from RefSeq NR_145749.2)
25RNU6-549Pn/a
    
    
     
n/achr15 64,671,316RNA, U6 small nuclear 549, pseudogene (from HGNC RNU6-549P)
26RNU6-482Pn/a
    
    
     
n/achr5 112,778,416RNA, U6 small nuclear 482, pseudogene (from HGNC RNU6-482P)
27ENSG00000259477n/a
    
    
     
n/achr15 57,980,181ENSG00000259477 (from geneSymbol)
28SNORA36Bn/a
    
    
     
n/achr1 220,200,611small nucleolar RNA, H/ACA box 36B (from RefSeq NR_002994.2)
29MIR664An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 220,200,578microRNA 664a (from RefSeq NR_031705.1)
30AKIRIN1P1n/a
    
    
     
n/achr12 80,561,288akirin 1 pseudogene 1 (from HGNC AKIRIN1P1)
31Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr11 129,030,515Y_RNA (from geneSymbol)
32RNA5SP197n/a
    
    
     
n/achr5 151,477,518RNA, 5S ribosomal pseudogene 197 (from HGNC RNA5SP197)
33ENSG00000236231n/a
    
    
     
n/achr2 176,528,281ENSG00000236231 (from geneSymbol)
34SCARNA3n/a
    
    
     
n/achr1 175,968,469small Cajal body-specific RNA 3 (from RefSeq NR_002998.1)
35UBE2D3P2n/a
    
    
     
n/achr3 37,134,880ubiquitin conjugating enzyme E2 D3 pseudogene 2 (from HGNC UBE2D3P2)
36ENSG00000237768n/a
    
    
     
n/achr10 73,072,651ENSG00000237768 (from geneSymbol)
37AIG1P1n/a
    
    
     
n/achr5 39,022,484androgen induced 1 pseudogene 1 (from HGNC AIG1P1)
38ENSG00000243303n/a
    
    
     
n/achr18 21,854,813ENSG00000243303 (from geneSymbol)
39RPL29P5n/a
    
    
     
n/achr1 75,582,327ribosomal protein L29 pseudogene 5 (from HGNC RPL29P5)
40RNU6-678Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 133,664,980RNA, U6 small nuclear 678, pseudogene (from HGNC RNU6-678P)
41ENSG00000282610n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 511,206V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0J9YX75)
42APOOP2n/a
    
    
     
n/achr3 87,595,107apolipoprotein O pseudogene 2 (from HGNC APOOP2)
43RN7SL784Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 4,883,145RNA, 7SL, cytoplasmic 784, pseudogene (from HGNC RN7SL784P)
44ENSG00000268209n/a
    
    
     
n/achr4 69,387,943ENSG00000268209 (from geneSymbol)
45RN7SL246Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 45,874,182RNA, 7SL, cytoplasmic 246, pseudogene (from HGNC RN7SL246P)
46SNORA49n/a
    
    
     
n/achr12 132,031,291small nucleolar RNA, H/ACA box 49 (from RefSeq NR_002979.2)
47BRWD1P3n/a
    
    
     
n/achr7 17,033,283bromodomain and WD repeat domain containing 1 pseudogene 3 (from HGNC BRWD1P3)
48RN7SL865Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 115,717,869RNA, 7SL, cytoplasmic 865, pseudogene (from HGNC RN7SL865P)
49ENSG00000252409n/a
    
    
     
n/achr3 41,687,950ENSG00000252409 (from geneSymbol)
50SUMO2P8n/a
    
    
     
n/achr6 108,618,142SUMO2 pseudogene 8 (from HGNC SUMO2P8)