UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1KMOn/a
n/a
n/a
n/a
0chr1 241,564,010kynurenine 3-monooxygenase, transcript variant 1 (from RefSeq NM_003679.5)
2CLDN14n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 36,470,371claudin 14, transcript variant 5 (from RefSeq NM_001146079.2)
3ENSG00000286517n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 36,534,567ENSG00000286517 (from geneSymbol)
4IL27n/a
    
    
     
n/achr16 28,503,098interleukin 27 (from RefSeq NM_145659.3)
5NUGGCn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 28,052,950nuclear GTPase, germinal center associated (from RefSeq NM_001010906.2)
6TANARn/a
    
    
     
n/achr2 240,983,793TWIST1 associated long noncoding RNA regulated by androgen receptor (from RefSeq NR_186276.1)
7FAM99Bn/a
    
    
     
n/achr11 1,684,449family with sequence similarity 99 member B (from RefSeq NR_026642.1)
8ENSG00000228923n/a
    
    
     
n/achr22 24,517,447ENSG00000228923 (from geneSymbol)
9SLC22A10n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 63,300,843solute carrier family 22 member 10, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001039752.4)
10ENSG00000278967n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 62,608,675ENSG00000278967 (from geneSymbol)
11TRGV5Pn/a
    
    
     
n/achr7 38,345,264T cell receptor gamma variable 5P (pseudogene) (from HGNC TRGV5P)
12AKR1C6Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 4,881,938aldo-keto reductase family 1 member C6, pseudogene (from HGNC AKR1C6P)
13ENSG00000262151n/a
    
    
     
n/achr16 10,876,833ENSG00000262151 (from geneSymbol)
14SLC22A9n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 63,390,039solute carrier family 22 member 9 (from RefSeq NM_080866.3)
15CCND2P1n/a
    
    
     
n/achr11 63,243,544cyclin D2 pseudogene 1 (from HGNC CCND2P1)
16KLHDC7Bn/a
    
    
     
n/achr22 50,548,461kelch domain containing 7B (from RefSeq NM_138433.5)
17LINC02397n/a
    
    
     
n/achr12 92,479,271long intergenic non-protein coding RNA 2397 (from HGNC LINC02397)
18ENSG00000266923n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 92,452,605ENSG00000266923 (from geneSymbol)
19GDF2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 47,325,021growth differentiation factor 2 (from RefSeq NM_016204.4)
20COLEC10n/a
    
    
     
n/achr8 119,087,851collectin subfamily member 10, transcript variant 1 (from RefSeq NM_006438.5)
21LINC02428n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 103,355,050long intergenic non-protein coding RNA 2428 (from HGNC LINC02428)
22LINC02027n/a
    
    
     
n/achr3 81,049,530long intergenic non-protein coding RNA 2027 (from HGNC LINC02027)
23TRGV3n/a
    
    
     
n/achr7 38,358,837V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt P03979)
24TRGV5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 38,349,688V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0B4J1U4)
25MIR4496n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 108,635,840microRNA 4496 (from RefSeq NR_039717.1)
26LINC02997n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 67,629,415LINC02997 (from geneSymbol)
27TOMM20P2n/a
    
    
     
n/achr17 35,514,976TOMM20 pseudogene 2 (from HGNC TOMM20P2)
28ENSG00000240056n/a
    
    
     
n/achr6 134,941,921ENSG00000240056 (from geneSymbol)
29CYP3A7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 99,720,116cytochrome P450 family 3 subfamily A member 7 (from RefSeq NM_000765.5)
30ENSG00000280306n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 20,488,680ENSG00000280306 (from geneSymbol)
31CD180n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 67,188,206CD180 molecule (from RefSeq NM_005582.3)
32HLMR1n/a
    
    
     
n/achr3 142,934,604uncharacterized LOC100507389 (from RefSeq NR_038455.1)
33LINC01150n/a
    
    
     
n/achr11 1,902,835long intergenic non-protein coding RNA 1150 (from HGNC LINC01150)
34BTG1P1n/a
    
    
     
n/achr12 9,135,337BTG anti-proliferation factor 1 pseudogene 1 (from HGNC BTG1P1)
35ENSG00000286030n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 35,522,624ENSG00000286030 (from geneSymbol)
36MIR5195n/a
    
    
     
n/achr14 106,850,942microRNA 5195 (from RefSeq NR_049827.1)
37ABCB11n/a
    
    
     
n/achr2 168,976,052ATP binding cassette subfamily B member 11 (from RefSeq NM_003742.4)
38NACAP8n/a
    
    
     
n/achr12 93,124,303NACAP8 (from geneSymbol)
39CES1P1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 55,777,301carboxylesterase 1 pseudogene 1 (from HGNC CES1P1)
40PZP20703
n/a
n/a
n/a
n/achr12 9,178,617PZP alpha-2-macroglobulin like (from RefSeq NM_002864.3)
41PTPRN2-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 157,856,190PTPRN2 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_038966.1)
42RPL13AP8n/a
    
    
     
n/achr1 206,907,924ribosomal protein L13a pseudogene 8 (from HGNC RPL13AP8)
43FASLGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 172,662,989Fas ligand, transcript variant 1 (from RefSeq NM_000639.3)
44RPL7P50n/a
    
    
     
n/achr19 6,593,692ribosomal protein L7 pseudogene 50 (from HGNC RPL7P50)
45BFSP2n/a
    
    
     
n/achr3 133,437,632beaded filament structural protein 2 (from RefSeq NM_003571.4)
46FGF21n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 48,756,927fibroblast growth factor 21 (from RefSeq NM_019113.4)
47PDE6Gn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 81,653,500phosphodiesterase 6G, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002602.4)
48ENSG00000234211n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 161,673,401ENSG00000234211 (from geneSymbol)
49LINC02640n/a
    
    
     
n/achr10 68,237,815LINC02640 (from geneSymbol)
50XCL1n/a
    
    
     
n/achr1 168,579,337X-C motif chemokine ligand 1 (from RefSeq NM_002995.3)