UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1XCL1n/a
    
    
     
1e-52chr1 168,579,337X-C motif chemokine ligand 1 (from RefSeq NM_002995.3)
2ENSG00000262312n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 3,544,126ENSG00000262312 (from geneSymbol)
3PTPRN2-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 157,856,190PTPRN2 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_038966.1)
4TRGV2n/a
    
    
     
n/achr7 38,363,191V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A075B6R0)
5UNC93B5n/a
    
    
     
n/achr11 67,713,853unc-93 homolog B5, pseudogene (from HGNC UNC93B5)
6LINC03058n/a
    
    
     
n/achr14 20,784,090LINC03058 (from geneSymbol)
7FASLGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 172,662,989Fas ligand, transcript variant 1 (from RefSeq NM_000639.3)
8BTG1P1n/a
    
    
     
n/achr12 9,135,337BTG anti-proliferation factor 1 pseudogene 1 (from HGNC BTG1P1)
9RPL13AP8n/a
    
    
     
n/achr1 206,907,924ribosomal protein L13a pseudogene 8 (from HGNC RPL13AP8)
10TIGITn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 114,302,158T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (from RefSeq NM_173799.4)
11RPS12P20n/a
    
    
     
n/achr11 72,708,375ribosomal protein S12 pseudogene 20 (from HGNC RPS12P20)
12RPL17P28n/a
    
    
     
n/achr7 139,049,731ribosomal protein L17 pseudogene 28 (from HGNC RPL17P28)
13PERPP3n/a
    
    
     
n/achr6 16,161,168PERPP3 (from geneSymbol)
14TRGV7n/a
    
    
     
n/achr7 38,335,277T cell receptor gamma variable 7 (pseudogene) (from HGNC TRGV7)
15IL9RP3n/a
    
    
     
n/achr16 33,828interleukin 9 receptor pseudogene 3 (from HGNC IL9RP3)
16FTH1P22n/a
    
    
     
n/achr1 116,775,363ferritin heavy chain 1 pseudogene 22 (from HGNC FTH1P22)
17IFITM3P6n/a
    
    
     
n/achr12 47,135,699IFITM3P6 (from geneSymbol)
18ENSG00000272334n/a
    
    
     
n/achr3 36,973,394ENSG00000272334 (from geneSymbol)
19TRAT1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 108,838,895T cell receptor associated transmembrane adaptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_016388.4)
20PLCB2-AS1n/a
    
    
     
n/achr15 40,301,245PLCB2 antisense RNA 1 (from HGNC PLCB2-AS1)
21ENSG00000267359n/a
    
    
     
n/achr17 35,553,986uncharacterized LOC107985033, transcript variant 2 (from RefSeq NR_138032.1)
22ENSG00000217078n/a
    
    
     
n/achr6 16,163,569ENSG00000217078 (from geneSymbol)
23PRADC1P1n/a
    
    
     
n/achr3 36,976,578protease associated domain containing 1 pseudogene 1 (from HGNC PRADC1P1)
24ENSG00000272908n/a
    
    
     
n/achr7 38,327,856ENSG00000272908 (from geneSymbol)
25ENSG00000225931n/a
    
    
     
n/achr1 2,568,149ENSG00000225931 (from geneSymbol)
26SIGLEC22Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 51,211,599sialic acid binding Ig like lectin 22, pseudogene (from HGNC SIGLEC22P)
27ARPC3P1n/a
    
    
     
n/achr20 49,134,746actin related protein 2/3 complex subunit 3 pseudogene 1 (from HGNC ARPC3P1)
28LYNn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 55,947,002LYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002350.4)
29ENSG00000272839n/a
    
    
     
n/achr7 157,868,846ENSG00000272839 (from geneSymbol)
30ENSG00000240535n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 55,034,261ENSG00000240535 (from geneSymbol)
31TRGV5Pn/a
    
    
     
n/achr7 38,345,264T cell receptor gamma variable 5P (pseudogene) (from HGNC TRGV5P)
32GCATP1n/a
    
    
     
n/achr14 63,594,661glycine C-acetyltransferase pseudogene 1 (from HGNC GCATP1)
33ENSG00000269924n/a
    
    
     
n/achr8 47,527,772ENSG00000269924 (from geneSymbol)
34ENSG00000213600n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 50,239,801ENSG00000213600 (from geneSymbol)
35RN7SKP26n/a
    
    
     
n/achr18 45,989,799RNA, 7SK small nuclear pseudogene 26 (from HGNC RN7SKP26)
36CHORDC1P4n/a
    
    
     
n/achr18 2,946,042CHORDC1P4 (from geneSymbol)
37ENSG00000293203n/a
    
    
     
n/achr18 2,946,258ENSG00000293203 (from geneSymbol)
38KRT8P46n/a
    
    
     
n/achr4 102,729,458keratin 8 pseudogene 46 (from HGNC KRT8P46)
39SNX25P1n/a
    
    
     
n/achr1 211,417,479sorting nexin 25 pseudogene 1 (from HGNC SNX25P1)
40ENSG00000234211n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 161,673,401ENSG00000234211 (from geneSymbol)
41ENSG00000269161n/a
    
    
     
n/achr19 17,519,447ENSG00000269161 (from geneSymbol)
42TBCAP3n/a
    
    
     
n/achr4 98,909,692tubulin folding cofactor A pseudogene 3 (from HGNC TBCAP3)
43RPL4P6n/a
    
    
     
n/achr22 40,587,351ribosomal protein L4 pseudogene 6 (from HGNC RPL4P6)
44SUMO2P19n/a
    
    
     
n/achr8 102,242,329SUMO2 pseudogene 19 (from HGNC SUMO2P19)
45GASAL1n/a
    
    
     
n/achr8 102,808,396growth arrest associated lncRNA 1 (from RefSeq NR_149020.1)
46ENSG00000269578n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 16,587,445ENSG00000269578 (from geneSymbol)
47UBE2D3P1n/a
    
    
     
n/achr20 5,292,609ubiquitin conjugating enzyme E2 D3 pseudogene 1 (from HGNC UBE2D3P1)
48PCNPP5n/a
    
    
     
n/achr13 48,328,324PEST containing nuclear protein pseudogene 5 (from HGNC PCNPP5)
49ENSG00000280387n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 56,522,875ENSG00000280387 (from geneSymbol)
50ENSG00000243403n/a
    
    
     
n/achr15 64,593,152ENSG00000243403 (from geneSymbol)