UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1CD244n/a
n/a
n/a
n/a
0chr1 160,846,523CD244 molecule, transcript variant 1 (from RefSeq NM_016382.4)
2TBX21n/a
    
    
     
n/achr17 47,739,679T-box transcription factor 21 (from RefSeq NM_013351.2)
3ZBP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 57,612,139Z-DNA binding protein 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_030776.3)
4LINC00861n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 126,118,944long intergenic non-protein coding RNA 861 (from HGNC LINC00861)
5ARL11n/a
    
    
     
n/achr13 49,631,189ADP ribosylation factor like GTPase 11 (from RefSeq NM_138450.6)
6KLRD1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 10,318,739killer cell lectin like receptor D1, transcript variant 12 (from RefSeq NR_182262.1)
7ADGRE1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 6,914,014adhesion G protein-coupled receptor E1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001974.5)
8PIK3CGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 106,887,131phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma, transcript variant 3 (from RefSeq NM_001282427.2)
9ITGB2-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 44,925,364ITGB2 antisense RNA 1, transcript variant 6 (from RefSeq NR_038316.1)
10ENSG00000237568n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 89,265,168ENSG00000237568 (from geneSymbol)
11LY9n/a
n/a
n/a
n/a
0.000000001chr1 160,812,214lymphocyte antigen 9, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002348.4)
12XCL2n/a
    
    
     
n/achr1 168,542,382X-C motif chemokine ligand 2 (from RefSeq NM_003175.4)
13SLA2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 36,629,257Src like adaptor 2, transcript variant 1 (from RefSeq NM_032214.4)
14CD300LBn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 74,526,324CD300 molecule like family member b (from RefSeq NM_174892.4)
15FCRL6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 159,809,308Fc receptor like 6, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001004310.3)
16IL12RB1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 18,072,964interleukin 12 receptor subunit beta 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_005535.3)
17PEAK3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 2,278,403PEAK family member 3 (from RefSeq NM_198532.3)
18TRBV20-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,627,024V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A075B6N2)
19PYHIN1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 158,954,305pyrin and HIN domain family member 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_152501.5)
20ENSG00000233665n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 48,984,800ENSG00000233665 (from geneSymbol)
21ENSG00000234389n/a
    
    
     
n/achr2 102,439,594ENSG00000234389 (from geneSymbol)
22CD5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 61,115,170CD5 molecule, transcript variant 1 (from RefSeq NM_014207.4)
23NAIPP3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 69,620,879NAIPP3 (from geneSymbol)
24CEACAM21n/a
n/a
n/a
n/a
0.00002chr19 41,581,505CEA cell adhesion molecule 21, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001098506.4)
25PDE6Gn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 81,653,500phosphodiesterase 6G, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002602.4)
26GPR84n/a
    
    
     
n/achr12 54,363,465G protein-coupled receptor 84 (from RefSeq NM_020370.3)
27LINC02422n/a
    
    
     
n/achr12 31,918,142long intergenic non-protein coding RNA 2422 (from HGNC LINC02422)
28SIRPGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 1,643,465signal regulatory protein gamma, transcript variant 1 (from RefSeq NM_018556.4)
29ENSG00000267074n/a
    
    
     
n/achr17 35,504,980ENSG00000267074 (from geneSymbol)
30RGS18n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 192,172,138regulator of G protein signaling 18 (from RefSeq NM_130782.3)
31CYLD-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 50,735,116CYLD antisense RNA 1, transcript variant 7 (from RefSeq NR_184279.1)
32TRGV3n/a
    
    
     
n/achr7 38,358,837V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt P03979)
33SOWAHDn/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 119,759,395sosondowah ankyrin repeat domain family member D (from RefSeq NM_001105576.3)
34TRGV4n/a
    
    
     
n/achr7 38,354,116V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0C4DH28)
35GPR182n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 56,996,469G protein-coupled receptor 182 (from RefSeq NM_007264.4)
36ENSG00000271680n/a
    
    
     
n/achr1 206,906,160ENSG00000271680 (from geneSymbol)
37GRAP2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 39,937,402GRB2 related adaptor protein 2, transcript variant 3 (from RefSeq NM_004810.4)
38NCR3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 31,590,950natural cytotoxicity triggering receptor 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_147130.3)
39ITGADn/a
    
    
     
n/achr16 31,409,920integrin subunit alpha D, transcript variant 2 (from RefSeq NM_005353.3)
40ENSG00000260757n/a
    
    
     
n/achr16 31,403,632ENSG00000260757 (from geneSymbol)
41CLEC4Dn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 8,517,934C-type lectin domain family 4 member D (from RefSeq NM_080387.5)
42CD28n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 203,722,775CD28 molecule, transcript variant 1 (from RefSeq NM_006139.4)
43UBASH3An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 42,425,793ubiquitin associated and SH3 domain containing A, transcript variant 1 (from RefSeq NM_018961.4)
44IFITM3P6n/a
    
    
     
n/achr12 47,135,699IFITM3P6 (from geneSymbol)
45TIGITn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 114,302,158T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (from RefSeq NM_173799.4)
46CNR2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 23,891,938cannabinoid receptor 2 (from RefSeq NM_001841.3)
47MPOn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 58,275,395myeloperoxidase (from RefSeq NM_000250.2)
48ENSG00000240535n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 55,034,261ENSG00000240535 (from geneSymbol)
49ENSG00000286030n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 35,522,624ENSG00000286030 (from geneSymbol)
50CD180n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 67,188,206CD180 molecule (from RefSeq NM_005582.3)