UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1KCNA3n/a
n/a
n/a
n/a
0chr1 110,673,702potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002232.5)
2ENSG00000286030n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 35,522,624ENSG00000286030 (from geneSymbol)
3TRGV3n/a
    
    
     
n/achr7 38,358,837V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt P03979)
4TOMM20P2n/a
    
    
     
n/achr17 35,514,976TOMM20 pseudogene 2 (from HGNC TOMM20P2)
5ENSG00000269050n/a
    
    
     
n/achr19 38,871,961ENSG00000269050 (from geneSymbol)
6ENSG00000262312n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 3,544,126ENSG00000262312 (from geneSymbol)
7ENSG00000267074n/a
    
    
     
n/achr17 35,504,980ENSG00000267074 (from geneSymbol)
8LINC00426n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 30,358,630long intergenic non-protein coding RNA 426 (from HGNC LINC00426)
9CYLD-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 50,735,116CYLD antisense RNA 1, transcript variant 7 (from RefSeq NR_184279.1)
10TIGITn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 114,302,158T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (from RefSeq NM_173799.4)
11ENSG00000240710n/a
    
    
     
n/achr1 204,609,800ENSG00000240710 (from geneSymbol)
12ENSG00000225886n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 27,669,872ENSG00000225886 (from geneSymbol)
13TAS1R3n/a
    
    
     
n/achr1 1,333,297taste 1 receptor member 3 (from RefSeq NM_152228.3)
14ENSG00000223886n/a
    
    
     
n/achr7 105,530,440ENSG00000223886 (from geneSymbol)
15TRGV5Pn/a
    
    
     
n/achr7 38,345,264T cell receptor gamma variable 5P (pseudogene) (from HGNC TRGV5P)
16RAB39An/a
    
    
     
n/achr11 107,945,965RAB39A, member RAS oncogene family (from RefSeq NM_017516.3)
17ENSG00000217078n/a
    
    
     
n/achr6 16,163,569ENSG00000217078 (from geneSymbol)
18ENSG00000213976n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 21,385,021ENSG00000213976 (from geneSymbol)
19XCL1n/a
    
    
     
n/achr1 168,579,337X-C motif chemokine ligand 1 (from RefSeq NM_002995.3)
20SCARNA10n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 6,510,386small Cajal body-specific RNA 10 (from RefSeq NR_004387.1)
21ENSG00000276232n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 6,510,398ENSG00000276232 (from geneSymbol)
22LRRC37A15Pn/a
    
    
     
n/achr4 102,728,997leucine rich repeat containing 37 member A15, pseudogene (from HGNC LRRC37A15P)
23KLHDC7Bn/a
    
    
     
n/achr22 50,548,461kelch domain containing 7B (from RefSeq NM_138433.5)
24TRGV4n/a
    
    
     
n/achr7 38,354,116V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0C4DH28)
25ENSG00000273218n/a
    
    
     
n/achr19 15,347,242ENSG00000273218 (from geneSymbol)
26ENSG00000267554n/a
    
    
     
n/achr17 35,470,348ENSG00000267554 (from geneSymbol)
27SHISAL2An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 52,645,116shisa like 2A, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001042693.3)
28ENSG00000248559n/a
    
    
     
n/achr5 134,400,708ENSG00000248559 (from geneSymbol)
29ENSG00000233264n/a
    
    
     
n/achr7 7,981,270ENSG00000233264 (from geneSymbol)
30ENSG00000257452n/a
    
    
     
n/achr12 112,962,689ENSG00000257452 (from geneSymbol)
31SUMO2P19n/a
    
    
     
n/achr8 102,242,329SUMO2 pseudogene 19 (from HGNC SUMO2P19)
32PTPRN2-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 157,856,190PTPRN2 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_038966.1)
33ENPP7P5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 8,281,691ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 7 pseudogene 5 (from HGNC ENPP7P5)
34ENSG00000284673n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 8,396,532ENSG00000284673 (from geneSymbol)
35ENSG00000284687n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 8,390,379ENSG00000284687 (from geneSymbol)
36ENSG00000262151n/a
    
    
     
n/achr16 10,876,833ENSG00000262151 (from geneSymbol)
37ARID3BP1n/a
    
    
     
n/achr1 81,502,631ARID3BP1 (from geneSymbol)
38CCR4n/a
    
    
     
n/achr3 32,953,996C-C motif chemokine receptor 4 (from RefSeq NM_005508.5)
39RPL10P19n/a
    
    
     
n/achr8 8,961,907ribosomal protein L10 pseudogene 19 (from HGNC RPL10P19)
40PSIP1P1n/a
    
    
     
n/achr9 15,055,554PC4 and SFRS1 interacting protein 1 pseudogene 1 (from HGNC PSIP1P1)
41SNORA51n/a
    
    
     
n/achr20 2,655,132small nucleolar RNA, H/ACA box 51 (from RefSeq NR_002981.1)
42ENSG00000272334n/a
    
    
     
n/achr3 36,973,394ENSG00000272334 (from geneSymbol)
43PSME2P1n/a
    
    
     
n/achr5 98,213,761proteasome activator subunit 2 pseudogene 1 (from HGNC PSME2P1)
44CEP250n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 35,487,439centrosomal protein 250, transcript variant 1 (from RefSeq NM_007186.6)
45ENSG00000271396n/a
    
    
     
n/achr15 90,284,978ENSG00000271396 (from geneSymbol)
46KLRC4-KLRK1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 10,391,227Membrane ; Single-  pass type II membrane protein (from UniProt H3BQV0)
47RHDn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 25,301,477Rh blood group D antigen, transcript variant 1 (from RefSeq NM_016124.6)
48FLICRn/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 49,266,693FOXP3 regulating long intergenic non-coding RNA (from HGNC FLICR)
49ENSG00000269980n/a
    
    
     
n/achr12 123,262,231ENSG00000269980 (from geneSymbol)
50COMMD9n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 36,280,858COMM domain containing 9, transcript variant 1 (from RefSeq NM_014186.4)