UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1LINC01993n/a
    
    
     
n/achr17 78,269,920long intergenic non-protein coding RNA 1993 (from RefSeq NR_073178.1)
2ENSG00000179253n/a
    
    
     
n/achr20 61,718,627uncharacterized LOC100128310 (from RefSeq NR_147702.1)
3ENSG00000229405n/a
    
    
     
n/achr2 7,736,766ENSG00000229405 (from geneSymbol)
4LINC02092n/a
    
    
     
n/achr17 73,747,205uncharacterized LOC100134391 (from RefSeq NR_164140.1)
5MRPL42P2n/a
    
    
     
n/achr6 16,171,818mitochondrial ribosomal protein L42 pseudogene 2 (from HGNC MRPL42P2)
6SDR42E1P5n/a
    
    
     
n/achr2 102,411,675short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 pseudogene 5 (from HGNC SDR42E1P5)
7RPL21P123n/a
    
    
     
n/achr17 29,716,482ribosomal protein L21 pseudogene 123 (from HGNC RPL21P123)
8CFAP69P1n/a
    
    
     
n/achr16 57,013,585CFAP69P1 (from geneSymbol)
9AMZ2P2n/a
    
    
     
n/achr6 158,726,275archaelysin family metallopeptidase 2 pseudogene 2 (from HGNC AMZ2P2)
10RAB1AP1n/a
    
    
     
n/achr2 190,993,103RAB1AP1 (from geneSymbol)
11ENSG00000249189n/a
    
    
     
n/achr19 54,246,711ENSG00000249189 (from geneSymbol)
12ENSG00000225741n/a
    
    
     
n/achr22 22,104,038ENSG00000225741 (from geneSymbol)
13ATOSBP1n/a
    
    
     
n/achr3 114,232,209ATOSBP1 (from geneSymbol)
14RN7SL105Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 1,604,523RNA, 7SL, cytoplasmic 105, pseudogene (from HGNC RN7SL105P)
15LINC01281n/a
    
    
     
n/achrX 39,316,159long intergenic non-protein coding RNA 1281 (from RefSeq NR_038968.1)
16OR5G1Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 56,775,733olfactory receptor family 5 subfamily G member 1 pseudogene (from HGNC OR5G1P)
17ENSG00000231392n/a
    
    
     
n/achr22 22,774,610ENSG00000231392 (from geneSymbol)
18RN7SL301Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 36,110,298RNA, 7SL, cytoplasmic 301, pseudogene (from HGNC RN7SL301P)
19IGLV2-33n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 22,588,421Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin light chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A075B6J2)
20ENSG00000259962n/a
    
    
     
n/achr16 53,362,848ENSG00000259962 (from geneSymbol)
21TLR8-AS1n/a
    
    
     
n/achrX 12,905,575TLR8 antisense RNA 1 (from HGNC TLR8-AS1)
22TRAV34n/a
    
    
     
n/achr14 22,207,825V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J273)
23ENSG00000261030n/a
    
    
     
n/achrX 13,094,116ENSG00000261030 (from geneSymbol)
24CEACAMP3n/a
    
    
     
n/achr19 41,602,478carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule pseudogene 3 (from HGNC CEACAMP3)
25ENSG00000291001n/a
    
    
     
n/achr19 41,604,113ENSG00000291001 (from geneSymbol)
26IGHV1-17n/a
    
    
     
n/achr14 106,174,551immunoglobulin heavy variable 1-17 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-17)
27IGLVI-63n/a
    
    
     
n/achr22 22,080,016immunoglobulin lambda variable (I)-63 (pseudogene) (from HGNC IGLVI-63)
28ENSG00000226484n/a
    
    
     
n/achrX 36,402,959uncharacterized LOC101928627 (from RefSeq NR_110412.1)
29ENSG00000233372n/a
    
    
     
n/achr1 30,140,935ENSG00000233372 (from geneSymbol)
30GOLGA5P1n/a
    
    
     
n/achr5 39,169,772golgin A5 pseudogene 1 (from HGNC GOLGA5P1)
31KIR2DL1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,777,057killer cell immunoglobulin like receptor, two Ig domains and long cytoplasmic tail 1 (from RefSeq NM_014218.3)
32RNA5SP260n/a
    
    
     
n/achr8 29,048,549RNA, 5S ribosomal pseudogene 260 (from HGNC RNA5SP260)
33ENSG00000215765n/a
    
    
     
n/achr19 54,761,390ENSG00000215765 (from geneSymbol)
34RPL21P40n/a
    
    
     
n/achr3 32,030,437ribosomal protein L21 pseudogene 40 (from HGNC RPL21P40)
35IGLV2-34n/a
    
    
     
n/achr22 22,580,155immunoglobulin lambda variable 2-34 (pseudogene) (from HGNC IGLV2-34)
36IGHV3-32n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 106,331,334immunoglobulin heavy variable 3-32 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-32)
37SLX1B-SULT1A4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 29,459,939SLX1B-SULT1A4 readthrough (NMD candidate) (from HGNC SLX1B-SULT1A4)
38ENSG00000243038n/a
    
    
     
n/achr14 50,053,213ENSG00000243038 (from geneSymbol)
39IGHV1-12n/a
    
    
     
n/achr14 106,122,564immunoglobulin heavy variable 1-12 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-12)
40ENSG00000257094n/a
    
    
     
n/achr12 32,007,281ENSG00000257094 (from geneSymbol)
41ENSG00000229495n/a
    
    
     
n/achr6 78,811,509ENSG00000229495 (from geneSymbol)
42ENSG00000226987n/a
    
    
     
n/achr9 131,241,205ENSG00000226987 (from geneSymbol)
43IGKV2D-23n/a
    
    
     
n/achr2 90,009,664immunoglobulin kappa variable 2D-23 (pseudogene) (from HGNC IGKV2D-23)
44IFNL1n/a
    
    
     
n/achr19 39,297,540interferon lambda 1 (from RefSeq NM_172140.2)
45LINC00824n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 128,490,919long intergenic non-protein coding RNA 824 (from HGNC LINC00824)
46IGLV3-13n/a
    
    
     
n/achr22 22,762,405immunoglobulin lambda variable 3-13 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-13)
47ENSG00000263098n/a
    
    
     
n/achr17 82,795,790ENSG00000263098 (from geneSymbol)
48EPS15P1n/a
    
    
     
n/achr7 46,782,967epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 pseudogene 1 (from HGNC EPS15P1)
49IGKV2-18n/a
    
    
     
n/achr2 89,129,103immunoglobulin kappa variable 2-18 (pseudogene) (from HGNC IGKV2-18)
50ENSG00000293095n/a
    
    
     
n/achr7 46,782,408ENSG00000293095 (from geneSymbol)