UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1RNU6-1n/a
    
    
     
n/achr15 67,839,992RNA, U6 small nuclear 1 (from RefSeq NR_004394.1)
2Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr1 111,446,853Y_RNA (from geneSymbol)
3ENSG00000251858n/a
    
    
     
n/achr14 41,594,527ENSG00000251858 (from geneSymbol)
4MIR5091n/a
    
    
     
n/achr4 13,627,911microRNA 5091 (from RefSeq NR_049814.1)
5ATP6V0CP2n/a
    
    
     
n/achr3 111,478,840ATPase H+ transporting V0 subunit c pseudogene 2 (from HGNC ATP6V0CP2)
6MIR3972n/a
    
    
     
n/achr1 17,277,932microRNA 3972 (from RefSeq NR_039768.1)
7RPS18P8n/a
    
    
     
n/achr6 4,979,283ribosomal protein S18 pseudogene 8 (from HGNC RPS18P8)
8ENSG00000251691n/a
    
    
     
n/achr4 69,306,821ENSG00000251691 (from geneSymbol)
9AKIRIN1P1n/a
    
    
     
n/achr12 80,561,288akirin 1 pseudogene 1 (from HGNC AKIRIN1P1)
10RN7SKP140n/a
    
    
     
n/achr20 21,424,899RNA, 7SK small nuclear pseudogene 140 (from HGNC RN7SKP140)
11ENSG00000282610n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 511,206V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0J9YX75)
12APOOP2n/a
    
    
     
n/achr3 87,595,107apolipoprotein O pseudogene 2 (from HGNC APOOP2)
13ENSG00000268209n/a
    
    
     
n/achr4 69,387,943ENSG00000268209 (from geneSymbol)
14RN7SL246Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 45,874,182RNA, 7SL, cytoplasmic 246, pseudogene (from HGNC RN7SL246P)
15BRWD1P3n/a
    
    
     
n/achr7 17,033,283bromodomain and WD repeat domain containing 1 pseudogene 3 (from HGNC BRWD1P3)
16RN7SL865Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 115,717,869RNA, 7SL, cytoplasmic 865, pseudogene (from HGNC RN7SL865P)
17ENSG00000261627n/a
    
    
     
n/achr18 6,642,224ENSG00000261627 (from geneSymbol)
18Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr12 32,705,454Y_RNA (from geneSymbol)
19CYP4A26Pn/a
    
    
     
n/achr1 46,967,776cytochrome P450 family 4 subfamily A member 26, pseudogene (from HGNC CYP4A26P)
20SPINT4n/a
    
    
     
n/achr20 45,724,088serine peptidase inhibitor, Kunitz type 4 (from RefSeq NM_178455.3)
21OR1L1n/a
    
    
     
n/achr9 122,662,182olfactory receptor family 1 subfamily L member 1 (from RefSeq NM_001005236.3)
22ENSG00000236231n/a
    
    
     
n/achr2 176,528,281ENSG00000236231 (from geneSymbol)
23SNORA74Dn/a
    
    
     
n/achr5 139,276,250small nucleolar RNA, H/ACA box 74D (from RefSeq NR_145749.2)
24ENSG00000249878n/a
    
    
     
n/achr5 61,832,485ENSG00000249878 (from geneSymbol)
25ENSG00000223946n/a
    
    
     
n/achr6 42,030,717ENSG00000223946 (from geneSymbol)
26ENSG00000260600n/a
    
    
     
n/achr16 61,692,753ENSG00000260600 (from geneSymbol)
27TJAP1P1n/a
    
    
     
n/achrX 129,042,359TJAP1P1 (from geneSymbol)
28FMO8Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 166,573,441flavin containing monooxygenase 8 pseudogene (from HGNC FMO8P)
29ENSG00000268931n/a
    
    
     
n/achr19 8,425,591ENSG00000268931 (from geneSymbol)
30ENSG00000232337n/a
    
    
     
n/achr2 161,049,576ENSG00000232337 (from geneSymbol)
31RNU6-1278Pn/a
    
    
     
n/achr18 46,121,668RNA, U6 small nuclear 1278, pseudogene (from HGNC RNU6-1278P)
32RPL36AP11n/a
    
    
     
n/achr1 93,190,900ribosomal protein L36a pseudogene 11 (from HGNC RPL36AP11)
33ENSG00000250315n/a
    
    
     
n/achr4 75,101,676ENSG00000250315 (from geneSymbol)
34ENSG00000293020n/a
    
    
     
n/achr4 75,101,710ENSG00000293020 (from geneSymbol)
35MAPK6P1n/a
    
    
     
n/achr8 53,538,680MAPK6P1 (from geneSymbol)
36ENSG00000279859n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 6,692,482ENSG00000279859 (from geneSymbol)
37COX7BP3n/a
    
    
     
n/achr1 54,089,974COX7BP3 (from geneSymbol)
38DNAJC6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 65,362,707DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C6, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001256864.2)
39PLEKHM2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 15,709,544pleckstrin homology and RUN domain containing M2, transcript variant 1 (from RefSeq NM_015164.4)
40DNAJC8n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 28,216,653DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C8, transcript variant 1 (from RefSeq NM_014280.3)
41NACC2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 136,050,913NACC family member 2 (from RefSeq NM_144653.5)
42ENSG00000150732n/a
    
    
     
n/achr1 188,067,411ENSG00000150732 (from geneSymbol)
43OR10K1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 158,464,646olfactory receptor family 10 subfamily K member 1 (from RefSeq NM_001004473.2)
44PPIAP7n/a
    
    
     
n/achr1 101,271,119peptidylprolyl isomerase A pseudogene 7 (from HGNC PPIAP7)
45ENSG00000177452n/a
    
    
     
n/achr1 63,789,012ENSG00000177452 (from geneSymbol)
46CDKN2AIPNLP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 226,493,338CDKN2A interacting protein N-terminal like pseudogene 1 (from HGNC CDKN2AIPNLP1)
47RCC2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 17,423,218regulator of chromosome condensation 2, transcript variant 1 (from RefSeq NM_018715.4)
48OR10AA1Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 158,808,867olfactory receptor family 10 subfamily AA member 1 pseudogene (from HGNC OR10AA1P)
49OR6K6n/a
    
    
     
n/achr1 158,755,305olfactory receptor family 6 subfamily K member 6 (from RefSeq NM_001005184.2)
50OR10K2n/a
    
    
     
n/achr1 158,422,223olfactory receptor family 10 subfamily K member 2 (from RefSeq NM_001004476.2)