UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000217644n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 32,980,209ENSG00000217644 (from geneSymbol)
2RN7SKP269n/a
    
    
     
n/achr1 9,947,477RNA, 7SK small nuclear pseudogene 269 (from HGNC RN7SKP269)
3PLEKHA3P1n/a
    
    
     
n/achr19 41,521,516pleckstrin homology domain containing A3 pseudogene 1 (from HGNC PLEKHA3P1)
4BACH1-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 29,373,199BACH1 antisense RNA 1 (from HGNC BACH1-AS1)
5NARF-AS1n/a
    
    
     
n/achr17 82,477,260NARF antisense RNA 1 (from HGNC NARF-AS1)
6TATDN2P3n/a
    
    
     
n/achr13 23,245,352TatD DNase domain containing 2 pseudogene 3 (from HGNC TATDN2P3)
7ENSG00000256913n/a
    
    
     
n/achr12 6,478,960ENSG00000256913 (from geneSymbol)
8ENSG00000234337n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 52,655,676ENSG00000234337 (from geneSymbol)
9ENSG00000234937n/a
    
    
     
n/achr1 155,845,995ENSG00000234937 (from geneSymbol)
10ENSG00000269653n/a
    
    
     
n/achr19 38,185,320ENSG00000269653 (from geneSymbol)
11ENSG00000254328n/a
    
    
     
n/achr5 172,986,939ENSG00000254328 (from geneSymbol)
12RPSAP22n/a
    
    
     
n/achr2 85,491,355ribosomal protein SA pseudogene 22 (from HGNC RPSAP22)
13AK4P4n/a
    
    
     
n/achr9 5,856,103adenylate kinase 4 pseudogene 4 (from HGNC AK4P4)
14ENSG00000228366n/a
    
    
     
n/achr9 105,710,535ENSG00000228366 (from geneSymbol)
15DIP2A-IT1n/a
    
    
     
n/achr21 46,465,888DIP2A intronic transcript 1 (from RefSeq NR_046400.1)
16RPS16P5n/a
    
    
     
n/achr6 53,337,144ribosomal protein S16 pseudogene 5 (from HGNC RPS16P5)
17MRPL40P1n/a
    
    
     
n/achr12 67,351,737mitochondrial ribosomal protein L40 pseudogene 1 (from HGNC MRPL40P1)
18BNIP3P43n/a
    
    
     
n/achr21 13,120,525BNIP3P43 (from geneSymbol)
19ENSG00000266126n/a
    
    
     
n/achr17 19,929,554ENSG00000266126 (from geneSymbol)
20ENSG00000225411n/a
    
    
     
n/achr9 63,808,151ENSG00000225411 (from geneSymbol)
21RPSAP16n/a
    
    
     
n/achr1 179,969,096ribosomal protein SA pseudogene 16 (from HGNC RPSAP16)
22PA2G4P6n/a
    
    
     
n/achr9 89,450,156proliferation-associated 2G4 pseudogene 6 (from HGNC PA2G4P6)
23YBX1P4n/a
    
    
     
n/achr7 152,129,282Y-box binding protein 1 pseudogene 4 (from HGNC YBX1P4)
24H2AZP3n/a
    
    
     
n/achr13 99,215,565H2AZP3 (from geneSymbol)
25RPL7AP82n/a
    
    
     
n/achr1 246,632,364RPL7AP82 (from geneSymbol)
26ENSG00000187904n/a
    
    
     
n/achr4 6,997,149ENSG00000187904 (from geneSymbol)
27ENSG00000223599n/a
    
    
     
n/achr1 153,852,760ENSG00000223599 (from geneSymbol)
28BACH1-IT2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 29,372,328BACH1 intronic transcript 2 (from HGNC BACH1-IT2)
29E2F3P1n/a
    
    
     
n/achr17 35,490,623E2F transcription factor 3 pseudogene 1 (from HGNC E2F3P1)
30ENSG00000270733n/a
    
    
     
n/achr1 26,263,219ENSG00000270733 (from geneSymbol)
31MRS2P2n/a
    
    
     
n/achr12 71,849,828MRS2 pseudogene 2 (from HGNC MRS2P2)
32STRADBP1n/a
    
    
     
n/achr7 150,513,199STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1 (from HGNC STRADBP1)
33ENSG00000228399n/a
    
    
     
n/achr1 101,256,445ENSG00000228399 (from geneSymbol)
34ENSG00000269085n/a
    
    
     
n/achr19 16,565,940ENSG00000269085 (from geneSymbol)
35PPIAP51n/a
    
    
     
n/achr16 81,476,271peptidylprolyl isomerase A pseudogene 51 (from HGNC PPIAP51)
36IFITM3P3n/a
    
    
     
n/achr6 34,576,457IFITM3P3 (from geneSymbol)
37MTCYBP18n/a
    
    
     
n/achr5 134,923,676mitochondrially encoded cytochrome b pseudogene 18 (from HGNC MTCYBP18)
38EIF3EP4n/a
    
    
     
n/achr3 182,844,070eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E pseudogene 4 (from HGNC EIF3EP4)
39ENSG00000238140n/a
    
    
     
n/achr1 51,462,568ENSG00000238140 (from geneSymbol)
40TMEM14EPn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 152,340,715transmembrane protein 14E, pseudogene (from HGNC TMEM14EP)
41TMEM14EPn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 152,340,342transmembrane protein 14E, pseudogene (from RefSeq NR_132656.1)
42TRGV1n/a
    
    
     
n/achr7 38,367,877Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0A0MS02)
43ENSG00000205537n/a
    
    
     
n/achr12 47,892,087ENSG00000205537 (from geneSymbol)
44ENSG00000259810n/a
    
    
     
n/achr16 31,789,597ENSG00000259810 (from geneSymbol)
45ENSG00000263644n/a
    
    
     
n/achr17 63,411,140ENSG00000263644 (from geneSymbol)
46ENSG00000241490n/a
    
    
     
n/achr3 114,225,297ENSG00000241490 (from geneSymbol)
47NASPP1n/a
    
    
     
n/achr8 60,938,788nuclear autoantigenic sperm protein pseudogene 1 (from HGNC NASPP1)
48ENSG00000268316n/a
    
    
     
n/achr19 51,840,358ENSG00000268316 (from geneSymbol)
49GAPDHP14n/a
    
    
     
n/achr21 29,222,789glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase pseudogene 14 (from HGNC GAPDHP14)
50ENSG00000277589n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 36,999,316ENSG00000277589 (from geneSymbol)