UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000217078n/a
    
    
     
n/achr6 16,163,569ENSG00000217078 (from geneSymbol)
2PERPP3n/a
    
    
     
n/achr6 16,161,168PERPP3 (from geneSymbol)
3UNC93B5n/a
    
    
     
n/achr11 67,713,853unc-93 homolog B5, pseudogene (from HGNC UNC93B5)
4ENSG00000262312n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 3,544,126ENSG00000262312 (from geneSymbol)
5PTPRN2-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 157,856,190PTPRN2 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_038966.1)
6LINC03058n/a
    
    
     
n/achr14 20,784,090LINC03058 (from geneSymbol)
7RPS12P20n/a
    
    
     
n/achr11 72,708,375ribosomal protein S12 pseudogene 20 (from HGNC RPS12P20)
8TRAV19n/a
    
    
     
n/achr14 22,007,846V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0A6YYK7)
9ENSG00000240710n/a
    
    
     
n/achr1 204,609,800ENSG00000240710 (from geneSymbol)
10XCL1n/a
    
    
     
n/achr1 168,579,337X-C motif chemokine ligand 1 (from RefSeq NM_002995.3)
11RPL17P28n/a
    
    
     
n/achr7 139,049,731ribosomal protein L17 pseudogene 28 (from HGNC RPL17P28)
12TRAV8-3n/a
    
    
     
n/achr14 21,852,782V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0A6YYJ7)
13ENSG00000272334n/a
    
    
     
n/achr3 36,973,394ENSG00000272334 (from geneSymbol)
14TRAV4n/a
    
    
     
n/achr14 21,736,567V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J268)
15ENSG00000237927n/a
    
    
     
n/achr6 159,588,062ENSG00000237927 (from geneSymbol)
16TRGV7n/a
    
    
     
n/achr7 38,335,277T cell receptor gamma variable 7 (pseudogene) (from HGNC TRGV7)
17S100Zn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 76,885,832S100 calcium binding protein Z (from RefSeq NM_130772.4)
18ENSG00000269161n/a
    
    
     
n/achr19 17,519,447ENSG00000269161 (from geneSymbol)
19TRAT1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 108,838,895T cell receptor associated transmembrane adaptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_016388.4)
20SUMO2P19n/a
    
    
     
n/achr8 102,242,329SUMO2 pseudogene 19 (from HGNC SUMO2P19)
21ENSG00000272908n/a
    
    
     
n/achr7 38,327,856ENSG00000272908 (from geneSymbol)
22SETP17n/a
    
    
     
n/achr11 86,295,168SET pseudogene 17 (from HGNC SETP17)
23TRGV2n/a
    
    
     
n/achr7 38,363,191V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A075B6R0)
24ENSG00000280387n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 56,522,875ENSG00000280387 (from geneSymbol)
25FTH1P22n/a
    
    
     
n/achr1 116,775,363ferritin heavy chain 1 pseudogene 22 (from HGNC FTH1P22)
26ENSG00000213600n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 50,239,801ENSG00000213600 (from geneSymbol)
27CCR4n/a
    
    
     
n/achr3 32,953,996C-C motif chemokine receptor 4 (from RefSeq NM_005508.5)
28SIGLEC22Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 51,211,599sialic acid binding Ig like lectin 22, pseudogene (from HGNC SIGLEC22P)
29IFITM3P6n/a
    
    
     
n/achr12 47,135,699IFITM3P6 (from geneSymbol)
30RN7SKP26n/a
    
    
     
n/achr18 45,989,799RNA, 7SK small nuclear pseudogene 26 (from HGNC RN7SKP26)
31FASLGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 172,662,989Fas ligand, transcript variant 1 (from RefSeq NM_000639.3)
32HSPE1P18n/a
    
    
     
n/achr11 118,209,071heat shock protein family E (Hsp10) member 1 pseudogene 18 (from HGNC HSPE1P18)
33RN7SL473Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 150,566,711RNA, 7SL, cytoplasmic 473, pseudogene (from HGNC RN7SL473P)
34ARPC3P1n/a
    
    
     
n/achr20 49,134,746actin related protein 2/3 complex subunit 3 pseudogene 1 (from HGNC ARPC3P1)
35ENSG00000269924n/a
    
    
     
n/achr8 47,527,772ENSG00000269924 (from geneSymbol)
36ENSG00000258439n/a
    
    
     
n/achr14 74,658,319ENSG00000258439 (from geneSymbol)
37PRADC1P1n/a
    
    
     
n/achr3 36,976,578protease associated domain containing 1 pseudogene 1 (from HGNC PRADC1P1)
38GPR82n/a
    
    
     
n/achrX 41,727,155G protein-coupled receptor 82 (from RefSeq NM_080817.5)
39HNRNPH1P1n/a
    
    
     
n/achr6 159,713,393heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1 pseudogene 1 (from HGNC HNRNPH1P1)
40ITPRID2-DTn/a
    
    
     
n/achr2 181,889,757ITPRID2-DT (from geneSymbol)
41ENSG00000267117n/a
    
    
     
n/achr19 55,694,338ENSG00000267117 (from geneSymbol)
42PLCB2-AS1n/a
    
    
     
n/achr15 40,301,245PLCB2 antisense RNA 1 (from HGNC PLCB2-AS1)
43ENSG00000267474n/a
    
    
     
n/achr19 14,458,883ENSG00000267474 (from geneSymbol)
44ENSG00000231393n/a
    
    
     
n/achr9 35,643,015ENSG00000231393 (from geneSymbol)
45TBCAP3n/a
    
    
     
n/achr4 98,909,692tubulin folding cofactor A pseudogene 3 (from HGNC TBCAP3)
46ENSG00000259677n/a
    
    
     
n/achr15 89,876,912ENSG00000259677 (from geneSymbol)
47HLA-Wn/a
    
    
     
n/achr6 29,957,583major histocompatibility complex, class I, W (pseudogene) (from HGNC HLA-W)
48ENSG00000269560n/a
    
    
     
n/achr19 12,531,370ENSG00000269560 (from geneSymbol)
49SMU1P1n/a
    
    
     
n/achr1 157,059,997SMU1P1 (from geneSymbol)
50TPT1P9n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 118,083,125tumor protein, translationally-controlled 1 pseudogene 9 (from HGNC TPT1P9)