UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C19orf48Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 50,798,552C19orf48P (from geneSymbol)
2SNORD88Cn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 50,802,373small nucleolar RNA, C/D box 88C (from RefSeq NR_003069.1)
3SNORD88Bn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 50,799,077small nucleolar RNA, C/D box 88B (from RefSeq NR_003068.1)
4C19orf48Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 50,800,789C19orf48P (from geneSymbol)
5ENSG00000227718n/a
    
    
     
n/achr2 13,740,600ENSG00000227718 (from geneSymbol)
6ENSG00000237581n/a
    
    
     
n/achr2 233,950,790ENSG00000237581 (from geneSymbol)
7CYCSP38n/a
    
    
     
n/achr15 60,558,240cytochrome c, somatic pseudogene 38 (from HGNC CYCSP38)
8ENSG00000262703n/a
    
    
     
n/achr16 11,348,732ENSG00000262703 (from geneSymbol)
9IKBKE-AS1n/a
    
    
     
n/achr1 206,494,422IKBKE antisense RNA 1 (from RefSeq NR_172918.1)
10ENSG00000279846n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 99,498,093ENSG00000279846 (from geneSymbol)
11MIR4273n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 75,738,321microRNA 4273 (from RefSeq NR_036235.1)
12GLYATL1Bn/a
    
    
     
n/achr11 59,090,546glycine-N-acyltransferase like 1B (from RefSeq NM_001355566.1)
13TPM3P8n/a
    
    
     
n/achr2 230,573,488tropomyosin 3 pseudogene 8 (from HGNC TPM3P8)
14Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr17 40,391,285Y_RNA (from geneSymbol)
15LINC02909n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 25,000,733LINC02909 (from geneSymbol)
16ENSG00000236941n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 164,948,758ENSG00000236941 (from geneSymbol)
17NCR2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 41,343,248natural cytotoxicity triggering receptor 2, transcript variant 1 (from RefSeq NM_004828.4)
18KRTAP3-2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 40,999,549keratin associated protein 3-2 (from RefSeq NM_031959.3)
19ENSG00000224988n/a
    
    
     
n/achr9 129,883,931ENSG00000224988 (from geneSymbol)
20RPL23AP95n/a
    
    
     
n/achr7 103,152,166ribosomal protein L23a pseudogene 95 (from HGNC RPL23AP95)
21ENSG00000233953n/a
    
    
     
n/achr2 60,497,825ENSG00000233953 (from geneSymbol)
22Y_RNAn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 107,650,840Y_RNA (from geneSymbol)
23ARB2BPn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 101,522,435ARB2BP (from geneSymbol)
24MTRF1LP2n/a
    
    
     
n/achr8 129,729,594mitochondrial translational release factor 1 like pseudogene 2 (from HGNC MTRF1LP2)
25ENSG00000258760n/a
    
    
     
n/achr14 65,269,580ENSG00000258760 (from geneSymbol)
26RNU1-11Pn/a
    
    
     
n/achr6 13,214,137RNA, U1 small nuclear 11, pseudogene (from HGNC RNU1-11P)
27RNU6-834Pn/a
    
    
     
n/achr12 49,593,158RNA, U6 small nuclear 834, pseudogene (from HGNC RNU6-834P)
28GRAMD4P3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 19,372,656GRAM domain containing 4 pseudogene 3 (from HGNC GRAMD4P3)
29MIR320B2n/a
    
    
     
n/achr1 224,257,072microRNA 320b-2 (from RefSeq NR_031574.2)
30RNU6-1099Pn/a
    
    
     
n/achr1 19,305,129RNA, U6 small nuclear 1099, pseudogene (from HGNC RNU6-1099P)
31ZNF736P9Yn/a
    
    
     
n/achrY 8,069,809zinc finger protein 736 pseudogene 9, Y-linked (from HGNC ZNF736P9Y)
32ENSG00000293305n/a
    
    
     
n/achrY 8,097,369ENSG00000293305 (from geneSymbol)
33VTRNA1-3n/a
    
    
     
n/achr5 140,726,202vault RNA 1-3 (from RefSeq NR_026705.1)
34ENSG00000233755n/a
    
    
     
n/achr1 25,078,413ENSG00000233755 (from geneSymbol)
35TRGV1n/a
    
    
     
n/achr7 38,367,877Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0A0MS02)
36HLA-DRB9n/a
    
    
     
n/achr6 32,466,660major histocompatibility complex, class II, DR beta 9 (pseudogene) (from HGNC HLA-DRB9)
37Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr3 193,624,245Y_RNA (from geneSymbol)
38ENSG00000236391n/a
    
    
     
n/achr2 173,338,340ENSG00000236391 (from geneSymbol)
39OR2B6n/a
    
    
     
n/achr6 27,957,711olfactory receptor family 2 subfamily B member 6 (from RefSeq NM_012367.1)
40ATP5MC2P3n/a
    
    
     
n/achr2 197,263,323ATP synthase membrane subunit c locus 2 pseudogene 3 (from HGNC ATP5MC2P3)
41IGKV1OR2-108n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 113,406,634immunoglobulin kappa variable 1/OR2-108 (non-functional) (from HGNC IGKV1OR2-108)
42ENSG00000229699n/a
    
    
     
n/achr1 153,183,097uncharacterized LOC101928009 (from RefSeq NR_110685.1)
43OR2W6Pn/a
    
    
     
n/achr6 27,937,934olfactory receptor family 2 subfamily W member 6 pseudogene (from HGNC OR2W6P)
44ENSG00000225885n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 118,345,906ENSG00000225885 (from geneSymbol)
45NHEG1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 136,987,699neuroblastoma highly expressed DDX5 stabilizing lncRNA 1 (from RefSeq NR_027994.1)
46ENSG00000236800n/a
    
    
     
n/achr10 48,668,311ENSG00000236800 (from geneSymbol)
47PMS2P11n/a
    
    
     
n/achr7 77,013,702PMS1 homolog 2, mismatch repair system component pseudogene 11 (from HGNC PMS2P11)
48ENSG00000260303n/a
    
    
     
n/achr4 146,054,683ENSG00000260303 (from geneSymbol)
49OR5H7Pn/a
    
    
     
n/achr3 98,238,816olfactory receptor family 5 subfamily H member 7 pseudogene (from HGNC OR5H7P)
50RN7SL337Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 14,584,245RNA, 7SL, cytoplasmic 337, pseudogene (from HGNC RN7SL337P)