UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1MRPL53P1n/a
    
    
     
n/achr1 112,626,065mitochondrial ribosomal protein L53 pseudogene 1 (from HGNC MRPL53P1)
2ENSG00000269385n/a
    
    
     
n/achr19 6,898,492ENSG00000269385 (from geneSymbol)
3MTCO2P33n/a
    
    
     
n/achr6 24,948,112mitochondrially encoded cytochrome c oxidase II pseudogene 33 (from HGNC MTCO2P33)
4RN7SL634Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 104,013,787RNA, 7SL, cytoplasmic 634, pseudogene (from HGNC RN7SL634P)
5TAF11L2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 17,498,529TATA-box binding protein associated factor 11 like 2 (from RefSeq NM_001401696.1)
6MTCO3P23n/a
    
    
     
n/achr15 58,150,419mitochondrially encoded cytochrome c oxidase III pseudogene 23 (from HGNC MTCO3P23)
7SEPTIN7P8n/a
    
    
     
n/achr19 53,772,893SEPTIN7P8 (from geneSymbol)
8IGHV3-29n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 106,356,368immunoglobulin heavy variable 3-29 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-29)
9TRBV7-7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 495,472V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0K0K1E9)
10IGLV7-35n/a
    
    
     
n/achr22 22,450,427immunoglobulin lambda variable 7-35 (pseudogene) (from HGNC IGLV7-35)
11ENSG00000271482n/a
    
    
     
n/achr7 105,204,729ENSG00000271482 (from geneSymbol)
12RN7SL587Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 77,547,706RNA, 7SL, cytoplasmic 587, pseudogene (from HGNC RN7SL587P)
13TRBV10-1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 383,711V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0K0K1A3)
14ENSG00000254325n/a
    
    
     
n/achr8 55,894,667ENSG00000254325 (from geneSymbol)
15RPL21P123n/a
    
    
     
n/achr17 29,716,482ribosomal protein L21 pseudogene 123 (from HGNC RPL21P123)
16H2BP6n/a
    
    
     
n/achr13 21,484,004H2BP6 (from geneSymbol)
17RN7SL28Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 184,279,084RNA, 7SL, cytoplasmic 28, pseudogene (from HGNC RN7SL28P)
18MIR144n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 28,861,575microRNA 144 (from RefSeq NR_029685.1)
19MIR4732n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 28,861,692microRNA 4732 (from RefSeq NR_039885.1)
20MIR451An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 28,861,404microRNA 451a (from RefSeq NR_029970.1)
21ENSG00000230379n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 24,965,624ENSG00000230379 (from geneSymbol)
22RPS23P10n/a
    
    
     
n/achr1 161,537,364ribosomal protein S23 pseudogene 10 (from HGNC RPS23P10)
23ENSG00000255094n/a
    
    
     
n/achr11 27,999,122ENSG00000255094 (from geneSymbol)
24FOLR1P1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 72,159,278folate receptor 1 pseudogene 1 (from HGNC FOLR1P1)
25ENSG00000261430n/a
    
    
     
n/achr16 1,470,178ENSG00000261430 (from geneSymbol)
26RCBTB2P1n/a
    
    
     
n/achr10 88,786,330RCC1 and BTB domain containing protein 2 pseudogene 1 (from HGNC RCBTB2P1)
27ZNHIT1P1n/a
    
    
     
n/achr8 142,858,575zinc finger HIT-type containing 1 pseudogene 1 (from HGNC ZNHIT1P1)
28MTCO3P5n/a
    
    
     
n/achr2 143,099,415mitochondrially encoded cytochrome c oxidase III pseudogene 5 (from HGNC MTCO3P5)
29DPPA2P2n/a
    
    
     
n/achr1 26,519,802developmental pluripotency associated 2 pseudogene 2 (from HGNC DPPA2P2)
30ENSG00000237444n/a
    
    
     
n/achr21 25,031,267ENSG00000237444 (from geneSymbol)
31TRAV34n/a
    
    
     
n/achr14 22,207,825V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J273)
32ENSG00000227710n/a
    
    
     
n/achr22 22,168,461ENSG00000227710 (from geneSymbol)
33SAMD7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 169,925,373sterile alpha motif domain containing 7, transcript variant 3 (from RefSeq NR_130713.2)
34ENSG00000248645n/a
    
    
     
n/achr4 164,939,156ENSG00000248645 (from geneSymbol)
35GOLGA5P1n/a
    
    
     
n/achr5 39,169,772golgin A5 pseudogene 1 (from HGNC GOLGA5P1)
36CYCSP32n/a
    
    
     
n/achr13 19,458,558cytochrome c, somatic pseudogene 32 (from HGNC CYCSP32)
37SOD1P1n/a
    
    
     
n/achr6 53,196,939superoxide dismutase 1 pseudogene 1 (from HGNC SOD1P1)
38ENSG00000259962n/a
    
    
     
n/achr16 53,362,848ENSG00000259962 (from geneSymbol)
39RPS6P8n/a
    
    
     
n/achr6 73,391,402ribosomal protein S6 pseudogene 8 (from HGNC RPS6P8)
40ENSG00000262408n/a
    
    
     
n/achr17 56,884,729ENSG00000262408 (from geneSymbol)
41HBZP1n/a
    
    
     
n/achr16 164,139hemoglobin subunit zeta pseudogene 1 (from HGNC HBZP1)
42IGHV3-32n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 106,331,334immunoglobulin heavy variable 3-32 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-32)
43PARP1P1n/a
    
    
     
n/achr13 110,938,271poly(ADP-ribose) polymerase 1 pseudogene 1 (from HGNC PARP1P1)
44RPS20P10n/a
    
    
     
n/achr2 71,984,308ribosomal protein S20 pseudogene 10 (from HGNC RPS20P10)
45ENSG00000261030n/a
    
    
     
n/achrX 13,094,116ENSG00000261030 (from geneSymbol)
46CR1Ln/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 207,684,418complement C3b/C4b receptor 1 like (from RefSeq NM_175710.2)
47CD46P1n/a
    
    
     
n/achr1 207,651,322CD46 molecule pseudogene 1 (from HGNC CD46P1)
48BOLA2P3n/a
    
    
     
n/achr6 21,602,255bolA family member 2 pseudogene 3 (from HGNC BOLA2P3)
49RN7SL288Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 46,169,603RNA, 7SL, cytoplasmic 288, pseudogene (from HGNC RN7SL288P)
50ENSG00000253749n/a
    
    
     
n/achr8 92,421,324ENSG00000253749 (from geneSymbol)