UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1LINC01342n/a
    
    
     
n/achr1 1,140,536long intergenic non-protein coding RNA 1342 (from RefSeq NR_038869.1)
2ERVH-1n/a
    
    
     
n/achr4 23,728,420endogenous retrovirus group H member 1 (from HGNC ERVH-1)
3ENSG00000248635n/a
    
    
     
n/achr4 68,708,549ENSG00000248635 (from geneSymbol)
4RNU6-1065Pn/a
    
    
     
n/achr17 10,857,951RNA, U6 small nuclear 1065, pseudogene (from HGNC RNU6-1065P)
5RPL15P21n/a
    
    
     
n/achr17 10,860,998ribosomal protein L15 pseudogene 21 (from HGNC RPL15P21)
6RN7SL541Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 134,517,951RNA, 7SL, cytoplasmic 541, pseudogene (from HGNC RN7SL541P)
7ENSG00000227050n/a
    
    
     
n/achr1 27,949,534ENSG00000227050 (from geneSymbol)
8ENSG00000267968n/a
    
    
     
n/achr19 50,840,809uncharacterized LOC105372441, transcript variant 1 (from RefSeq NR_131205.1)
9ENSG00000232175n/a
    
    
     
n/achr1 232,917,626ENSG00000232175 (from geneSymbol)
10ENSG00000270182n/a
    
    
     
n/achr7 27,158,660ENSG00000270182 (from geneSymbol)
11MIR1227n/a
    
    
     
n/achr19 2,234,105microRNA 1227 (from RefSeq NR_031596.1)
12ENSG00000225356n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 181,522,833ENSG00000225356 (from geneSymbol)
13RAD17P1n/a
    
    
     
n/achr7 16,865,287RAD17 checkpoint clamp loader component pseudogene 1 (from HGNC RAD17P1)
14IGHV7-81n/a
    
    
     
n/achr14 106,874,827Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin heavy chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0B4J1V7)
15ENSG00000232806n/a
    
    
     
n/achr21 41,561,041ENSG00000232806 (from geneSymbol)
16RNU2-51Pn/a
    
    
     
n/achr14 70,360,990RNA, U2 small nuclear 51, pseudogene (from HGNC RNU2-51P)
17PLA2G10BPn/a
    
    
     
n/achr16 14,730,314PLA2G10BP (from geneSymbol)
18RN7SL619Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 13,815,190RNA, 7SL, cytoplasmic 619, pseudogene (from HGNC RN7SL619P)
19HTR3En/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 184,102,0295-hydroxytryptamine receptor 3E, transcript variant 4 (from RefSeq NM_001256613.2)
20RPL21P7n/a
    
    
     
n/achr14 65,267,164ribosomal protein L21 pseudogene 7 (from HGNC RPL21P7)
21BOLA3P3n/a
    
    
     
n/achr5 126,663,452bolA family member 3 pseudogene 3 (from HGNC BOLA3P3)
22ENSG00000230118n/a
    
    
     
n/achr2 30,746,572ENSG00000230118 (from geneSymbol)
23ENSG00000250376n/a
    
    
     
n/achr4 68,786,046ENSG00000250376 (from geneSymbol)
24ENSG00000224417n/a
    
    
     
n/achr6 168,300,091ENSG00000224417 (from geneSymbol)
25RPL37P1n/a
    
    
     
n/achr20 35,588,465ribosomal protein L37 pseudogene 1 (from HGNC RPL37P1)
26RNA5SP301n/a
    
    
     
n/achr10 13,727,856RNA, 5S ribosomal pseudogene 301 (from HGNC RNA5SP301)
27LINC00974n/a
    
    
     
n/achr17 41,552,050long intergenic non-protein coding RNA 974 (from RefSeq NR_038442.1)
28TMEM236n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 17,776,534transmembrane protein 236 (from RefSeq NM_001098844.3)
29IGHV1-45n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 106,507,243V region of the variable domain of immunoglobulin heavy  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0A0MS14)
30LINC02512n/a
    
    
     
n/achr4 170,357,700long intergenic non-protein coding RNA 2512 (from HGNC LINC02512)
31TRAV30n/a
    
    
     
n/achr14 22,168,708V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A087WSZ9)
32ENSG00000235721n/a
    
    
     
n/achr2 110,009,229ENSG00000235721 (from geneSymbol)
33LINC02023n/a
    
    
     
n/achr3 165,154,034long intergenic non-protein coding RNA 2023 (from HGNC LINC02023)
34RPL7AP77n/a
    
    
     
n/achr7 73,314,660RPL7AP77 (from geneSymbol)
35MIR559n/a
    
    
     
n/achr2 47,377,722microRNA 559 (from RefSeq NR_030286.1)
36IGHVII-78-1n/a
    
    
     
n/achr14 106,865,761immunoglobulin heavy variable (II)-78-1 (pseudogene) (from HGNC IGHVII-78-1)
37ENSG00000239096n/a
    
    
     
n/achr3 179,614,826ENSG00000239096 (from geneSymbol)
38Y_RNAn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr20 44,344,886Y_RNA (from geneSymbol)
39TIFABn/a
    
    
     
n/achr5 135,448,288TIFA inhibitor (from RefSeq NM_001099221.2)
40RPL4P1n/a
    
    
     
n/achr14 21,750,907ribosomal protein L4 pseudogene 1 (from HGNC RPL4P1)
41IGKV2D-30n/a
    
    
     
n/achr2 89,937,269V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A075B6S6)
42HNRNPA1P26n/a
    
    
     
n/achrX 100,855,833heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 26 (from HGNC HNRNPA1P26)
43ENSG00000250137n/a
    
    
     
n/achr4 23,765,776ENSG00000250137 (from geneSymbol)
44LINC02041n/a
    
    
     
n/achr3 187,449,147long intergenic non-protein coding RNA 2041 (from HGNC LINC02041)
45IGKV3D-7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 90,235,091V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0C4DH55)
46ENSG00000227131n/a
    
    
     
n/achr6 40,273,901ENSG00000227131 (from geneSymbol)
47IGKV2D-28n/a
    
    
     
n/achr2 89,960,363V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt P01615)
48POU5F1P4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 155,433,720POU class 5 homeobox 1 pseudogene 4 (from RefSeq NR_034180.1)
49ABCC13n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 14,318,423ATP binding cassette subfamily C member 13 (pseudogene) (from HGNC ABCC13)
50ABCC13n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 14,305,908ATP binding cassette subfamily C member 13 (pseudogene) (from HGNC ABCC13)