UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1RPL7AP77n/a
    
    
     
n/achr7 73,314,660RPL7AP77 (from geneSymbol)
2ATP5MGP7n/a
    
    
     
n/achr17 42,647,988ATP synthase membrane subunit g pseudogene 7 (from HGNC ATP5MGP7)
3KMT2CP3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 143,479,994KMT2CP3 (from geneSymbol)
4PMM2P2n/a
    
    
     
n/achr18 12,192,568phosphomannomutase 2 pseudogene 2 (from HGNC PMM2P2)
5RPS20P1n/a
    
    
     
n/achr21 35,724,923ribosomal protein S20 pseudogene 1 (from HGNC RPS20P1)
6NCOA7-AS1n/a
    
    
     
n/achr6 125,808,357NCOA7 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_126386.1)
7MIX23P3n/a
    
    
     
n/achr18 12,211,592MIX23P3 (from geneSymbol)
8ENSG00000267478n/a
    
    
     
n/achr18 12,092,407ENSG00000267478 (from geneSymbol)
9LINC00332n/a
    
    
     
n/achr13 40,180,766long intergenic non-protein coding RNA 332 (from RefSeq NR_046870.1)
10OR10G4n/a
    
    
     
n/achr11 124,015,864olfactory receptor family 10 subfamily G member 4 (from RefSeq NM_001004462.2)
11CFTR-AS1n/a
    
    
     
n/achr7 117,562,704CFTR antisense RNA 1 (from RefSeq NR_149084.1)
12ENSG00000226535n/a
    
    
     
n/achr9 107,170,358ENSG00000226535 (from geneSymbol)
13ENSG00000227301n/a
    
    
     
n/achr9 33,721,122ENSG00000227301 (from geneSymbol)
14RN7SKP259n/a
    
    
     
n/achr11 57,451,856RNA, 7SK small nuclear pseudogene 259 (from HGNC RN7SKP259)
15TRBV6-7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 471,654Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) beta chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0A0MS04)
16ENSG00000258507n/a
    
    
     
n/achr4 8,859,771ENSG00000258507 (from geneSymbol)
17ENSG00000213087n/a
    
    
     
n/achr6 151,225,748ENSG00000213087 (from geneSymbol)
18GACAT1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 107,788,120gastric cancer associated transcript 1, transcript variant 2 (from RefSeq NR_126370.1)
19ENSG00000234597n/a
    
    
     
n/achr2 19,463,648uncharacterized LOC101928196 (from RefSeq NR_187653.1)
20CDCA7P2n/a
    
    
     
n/achr9 75,402,440CDCA7P2 (from geneSymbol)
21ENSG00000238079n/a
    
    
     
n/achr6 108,372,849ENSG00000238079 (from geneSymbol)
22ENSG00000241011n/a
    
    
     
n/achr4 188,106,736ENSG00000241011 (from geneSymbol)
23HNRNPH1P3n/a
    
    
     
n/achr5 55,839,413heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1 pseudogene 3 (from HGNC HNRNPH1P3)
24ENSG00000250347n/a
    
    
     
n/achr5 142,036,916ENSG00000250347 (from geneSymbol)
25NUP58P1n/a
    
    
     
n/achr4 125,682,422nucleoporin 58 pseudogene 1 (from HGNC NUP58P1)
26BORCS8P1n/a
    
    
     
n/achr12 19,108,018BORCS8P1 (from geneSymbol)
27ENSG00000257472n/a
    
    
     
n/achr14 31,927,973ENSG00000257472 (from geneSymbol)
28ENSG00000258272n/a
    
    
     
n/achr12 96,453,884ENSG00000258272 (from geneSymbol)
29ENSG00000259266n/a
    
    
     
n/achr15 98,118,245ENSG00000259266 (from geneSymbol)
30ENSG00000293331n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 612,701ENSG00000293331 (from geneSymbol)
31TTTY13n/a
    
    
     
n/achrY 21,585,086testis-specific transcript, Y-linked 13 (non-protein coding) (from HGNC TTTY13)
32RPL13Pn/a
    
    
     
n/achr6 28,861,731ribosomal protein L13 pseudogene (from HGNC RPL13P)
33ENSG00000231866n/a
    
    
     
n/achr1 52,925,336ENSG00000231866 (from geneSymbol)
34RPL21P131n/a
    
    
     
n/achr19 33,589,447ribosomal protein L21 pseudogene 131 (from HGNC RPL21P131)
35MRPS36P2n/a
    
    
     
n/achr4 186,900,689mitochondrial ribosomal protein S36 pseudogene 2 (from HGNC MRPS36P2)
36ENSG00000253564n/a
    
    
     
n/achr8 73,216,278ENSG00000253564 (from geneSymbol)
37ENSG00000255060n/a
    
    
     
n/achr11 36,425,784ENSG00000255060 (from geneSymbol)
38ENSG00000270712n/a
    
    
     
n/achr9 19,957,770ENSG00000270712 (from geneSymbol)
39MAGEA9n/a
    
    
     
n/achrX 149,784,833MAGE family member A9 (from RefSeq NM_005365.5)
40VN1R40Pn/a
    
    
     
n/achr7 64,444,272vomeronasal 1 receptor 40 pseudogene (from HGNC VN1R40P)
41LINC00307n/a
    
    
     
n/achr21 30,210,467long intergenic non-protein coding RNA 307 (from RefSeq NR_038855.1)
42ENSG00000232971n/a
    
    
     
n/achr1 108,734,490ENSG00000232971 (from geneSymbol)
43RPS16P9n/a
    
    
     
n/achr19 45,332,911ribosomal protein S16 pseudogene 9 (from HGNC RPS16P9)
44C1QL1P1n/a
    
    
     
n/achr16 35,575,164complement C1q like 1 pseudogene 1 (from HGNC C1QL1P1)
45ENSG00000261561n/a
    
    
     
n/achr15 28,346,568ENSG00000261561 (from geneSymbol)
46OR1AB1Pn/a
    
    
     
n/achr19 16,052,309olfactory receptor family 1 subfamily AB member 1 pseudogene (from HGNC OR1AB1P)
47ENSG00000269796n/a
    
    
     
n/achr19 22,424,279ENSG00000269796 (from geneSymbol)
48PTHn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 13,494,025parathyroid hormone, transcript variant 1 (from RefSeq NM_000315.4)
49RNU6-799Pn/a
    
    
     
n/achr17 15,311,398RNA, U6 small nuclear 799, pseudogene (from HGNC RNU6-799P)
50SNORA71n/a
    
    
     
n/achr20 38,442,102SNORA71 (from geneSymbol)