UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1IL10n/a
    
    
     
3e-83chr1 206,770,048interleukin 10, transcript variant 3 (from RefSeq NR_168466.1)
2ENSG00000267074n/a
    
    
     
n/achr17 35,504,980ENSG00000267074 (from geneSymbol)
3CD28n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 203,722,775CD28 molecule, transcript variant 1 (from RefSeq NM_006139.4)
4LAX1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 203,770,777lymphocyte transmembrane adaptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_017773.4)
5ENSG00000267554n/a
    
    
     
n/achr17 35,470,348ENSG00000267554 (from geneSymbol)
6CYLD-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr16 50,735,116CYLD antisense RNA 1, transcript variant 7 (from RefSeq NR_184279.1)
7PDE6Gn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 81,653,500phosphodiesterase 6G, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002602.4)
8GVINP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 6,718,245GTPase, very large interferon inducible pseudogene 1 (from RefSeq NR_003945.1)
9TRGV3n/a
    
    
     
n/achr7 38,358,837V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt P03979)
10ENSG00000269050n/a
    
    
     
n/achr19 38,871,961ENSG00000269050 (from geneSymbol)
11LAIR1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 54,358,157leukocyte associated immunoglobulin like receptor 1, transcript variant h (from RefSeq NR_110279.3)
12TRGV4n/a
    
    
     
n/achr7 38,354,116V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0C4DH28)
13ENSG00000237604n/a
    
    
     
n/achr21 44,175,971ENSG00000237604 (from geneSymbol)
14ENSG00000286030n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 35,522,624ENSG00000286030 (from geneSymbol)
15ENSG00000233665n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 48,984,800ENSG00000233665 (from geneSymbol)
16LINC00426n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 30,358,630long intergenic non-protein coding RNA 426 (from HGNC LINC00426)
17PIK3CGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 106,887,131phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma, transcript variant 3 (from RefSeq NM_001282427.2)
18CD160n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 145,729,393CD160 molecule, transcript variant 1 (from RefSeq NM_007053.4)
19TOMM20P2n/a
    
    
     
n/achr17 35,514,976TOMM20 pseudogene 2 (from HGNC TOMM20P2)
20TIGITn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 114,302,158T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (from RefSeq NM_173799.4)
21NAP1L4P1n/a
    
    
     
n/achr1 116,533,514nucleosome assembly protein 1 like 4 pseudogene 1 (from HGNC NAP1L4P1)
22MIR92A1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 91,351,352microRNA 92a-1 (from RefSeq NR_029508.1)
23MIR20An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 91,351,100microRNA 20a (from RefSeq NR_029492.1)
24MIR18An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 91,350,786microRNA 18a (from RefSeq NR_029488.1)
25MIR19An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 91,350,931microRNA 19a (from RefSeq NR_029489.1)
26MIR19B1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 91,351,235microRNA 19b-1 (from RefSeq NR_029490.1)
27MIR17n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 91,350,646microRNA 17 (from RefSeq NR_029487.1)
28ENSG00000232347n/a
    
    
     
n/achr1 247,226,257ENSG00000232347 (from geneSymbol)
29ENSG00000224950n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 116,496,114ENSG00000224950 (from geneSymbol)
30UBASH3An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 42,425,793ubiquitin associated and SH3 domain containing A, transcript variant 1 (from RefSeq NM_018961.4)
31ENSG00000240535n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 55,034,261ENSG00000240535 (from geneSymbol)
32CTLA4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 203,870,868cytotoxic T-lymphocyte associated protein 4, transcript variant 1 (from RefSeq NM_005214.5)
33CD200R1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 112,948,154CD200 receptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_138806.4)
34LINC02978n/a
    
    
     
n/achr17 30,965,217LINC02978 (from geneSymbol)
35GABRR2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 89,284,881gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit rho2 (from RefSeq NM_002043.5)
36KLHDC7Bn/a
    
    
     
n/achr22 50,548,461kelch domain containing 7B (from RefSeq NM_138433.5)
37ENSG00000187951n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 30,715,855OTU deubiquitinase 7A pseudogene, transcript variant 3 (from RefSeq NR_038255.1)
38ENSG00000290886n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 30,684,813ENSG00000290886 (from geneSymbol)
39ARL11n/a
    
    
     
n/achr13 49,631,189ADP ribosylation factor like GTPase 11 (from RefSeq NM_138450.6)
40ZDHHC20P1n/a
    
    
     
n/achr6 29,708,336zinc finger DHHC-type containing 20 pseudogene 1 (from HGNC ZDHHC20P1)
41XCL1n/a
    
    
     
n/achr1 168,579,337X-C motif chemokine ligand 1 (from RefSeq NM_002995.3)
42EGLN2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 40,803,812egl-9 family hypoxia inducible factor 2, transcript variant 3 (from RefSeq NM_080732.4)
43ENSG00000271554n/a
    
    
     
n/achr1 36,002,813ENSG00000271554 (from geneSymbol)
44SNORD17n/a
    
    
     
n/achr20 17,962,828small nucleolar RNA, C/D box 17 (from RefSeq NR_003045.1)
45CD180n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 67,188,206CD180 molecule (from RefSeq NM_005582.3)
46ENSG00000257452n/a
    
    
     
n/achr12 112,962,689ENSG00000257452 (from geneSymbol)
47ENSG00000272825n/a
    
    
     
n/achr21 44,936,628ENSG00000272825 (from geneSymbol)
48RN7SL138Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 30,959,707RNA, 7SL, cytoplasmic 138, pseudogene (from HGNC RN7SL138P)
49KCNA3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 110,673,702potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002232.5)
50GYPEn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 143,888,211glycophorin E (MNS blood group), transcript variant 2 (from RefSeq NM_198682.3)