UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000238015n/a
    
    
     
n/achr1 78,666,483ENSG00000238015 (from geneSymbol)
2TPM3P8n/a
    
    
     
n/achr2 230,573,488tropomyosin 3 pseudogene 8 (from HGNC TPM3P8)
3ENSG00000267312n/a
    
    
     
n/achr17 35,460,015ENSG00000267312 (from geneSymbol)
4ATP5MC2P3n/a
    
    
     
n/achr2 197,263,323ATP synthase membrane subunit c locus 2 pseudogene 3 (from HGNC ATP5MC2P3)
5TRGV1n/a
    
    
     
n/achr7 38,367,877Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0A0MS02)
6ENSG00000258760n/a
    
    
     
n/achr14 65,269,580ENSG00000258760 (from geneSymbol)
7CCL3L3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 36,195,813C-C motif chemokine ligand 3 like 3 (from RefSeq NM_001001437.4)
8RN7SL337Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 14,584,245RNA, 7SL, cytoplasmic 337, pseudogene (from HGNC RN7SL337P)
9COX6CP2n/a
    
    
     
n/achr20 50,479,879cytochrome c oxidase subunit 6C pseudogene 2 (from HGNC COX6CP2)
10MIR589n/a
    
    
     
n/achr7 5,495,868microRNA 589 (from RefSeq NR_030318.1)
11RNA5SP323n/a
    
    
     
n/achr10 93,510,614RNA, 5S ribosomal pseudogene 323 (from HGNC RNA5SP323)
12ENSG00000262703n/a
    
    
     
n/achr16 11,348,732ENSG00000262703 (from geneSymbol)
13RNA5SP69n/a
    
    
     
n/achr1 178,560,971RNA, 5S ribosomal pseudogene 69 (from HGNC RNA5SP69)
14ENSG00000236800n/a
    
    
     
n/achr10 48,668,311ENSG00000236800 (from geneSymbol)
15OR52P1n/a
    
    
     
n/achr11 5,726,983olfactory receptor family 52 subfamily P member 1 (gene/pseudogene) (from RefSeq NR_172915.1)
16GAPDHP70n/a
    
    
     
n/achr11 88,408,701glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 70 (from HGNC GAPDHP70)
17ENSG00000262810n/a
    
    
     
n/achr17 2,095,620ENSG00000262810 (from geneSymbol)
18ENSG00000279040n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 2,101,604ENSG00000279040 (from geneSymbol)
19MCCD1P1n/a
    
    
     
n/achr6 29,908,214mitochondrial coiled-coil domain 1 pseudogene 1 (from HGNC MCCD1P1)
20ENSG00000233290n/a
    
    
     
n/achr1 82,530,309ENSG00000233290 (from geneSymbol)
21SNORD13n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 33,513,526small nucleolar RNA, C/D box 13 (from RefSeq NR_003041.1)
22ENSG00000227055n/a
    
    
     
n/achr2 159,813,121ENSG00000227055 (from geneSymbol)
23VTRNA1-3n/a
    
    
     
n/achr5 140,726,202vault RNA 1-3 (from RefSeq NR_026705.1)
24LINC03089n/a
    
    
     
n/achr10 44,260,707LINC03089 (from geneSymbol)
25IGHEP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,722,160immunoglobulin heavy constant epsilon P1 (pseudogene) (from HGNC IGHEP1)
26ENSG00000234513n/a
    
    
     
n/achr7 22,773,819ENSG00000234513 (from geneSymbol)
27BNIP3P4n/a
    
    
     
n/achr9 64,811,147BCL2 interacting protein 3 pseudogene 4 (from HGNC BNIP3P4)
28SNORA74Bn/a
    
    
     
n/achr5 173,020,828small nucleolar RNA, H/ACA box 74B (from RefSeq NR_002988.1)
29EIF5AP2n/a
    
    
     
n/achr17 78,158,269eukaryotic translation initiation factor 5A pseudogene 2 (from HGNC EIF5AP2)
30RPSAP50n/a
    
    
     
n/achr11 109,982,617ribosomal protein SA pseudogene 50 (from HGNC RPSAP50)
31OR2T3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 248,473,829olfactory receptor family 2 subfamily T member 3 (from RefSeq NM_001005495.1)
32ENSG00000267766n/a
    
    
     
n/achr18 63,151,217ENSG00000267766 (from geneSymbol)
33ENSG00000253754n/a
    
    
     
n/achr8 108,226,872ENSG00000253754 (from geneSymbol)
34RPL31P11n/a
    
    
     
n/achr1 161,685,023ribosomal protein L31 pseudogene 11 (from HGNC RPL31P11)
35IGHV1-17n/a
    
    
     
n/achr14 106,174,551immunoglobulin heavy variable 1-17 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-17)
36ENSG00000249148n/a
    
    
     
n/achr4 13,632,209ENSG00000249148 (from geneSymbol)
37RN7SL753Pn/a
    
    
     
n/achr2 202,333,583RNA, 7SL, cytoplasmic 753, pseudogene (from HGNC RN7SL753P)
38FAM32BPn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 17,213,835family with sequence similarity 32 member B, pseudogene (from HGNC FAM32BP)
39RN7SL629Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 87,294,331RNA, 7SL, cytoplasmic 629, pseudogene (from HGNC RN7SL629P)
40GIMAP3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 150,747,310GTPase, IMAP family member 3 pseudogene (from HGNC GIMAP3P)
41RN7SL211Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 64,907,000RNA, 7SL, cytoplasmic 211, pseudogene (from HGNC RN7SL211P)
42ENSG00000275773n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 60,723,523ENSG00000275773 (from geneSymbol)
43TILRLSn/a
    
    
     
n/achr5 67,269,102TCL1A interacting lncRNA, retroperitoneal liposarcoma associated (from RefSeq NR_186086.1)
44MIR34An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 9,151,722microRNA 34a (from RefSeq NR_029610.1)
45Y_RNAn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 47,820,244Y_RNA (from geneSymbol)
46RPL21P40n/a
    
    
     
n/achr3 32,030,437ribosomal protein L21 pseudogene 40 (from HGNC RPL21P40)
47RN7SL793Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 102,217,465RNA, 7SL, cytoplasmic 793, pseudogene (from HGNC RN7SL793P)
48IGLV1-62n/a
    
    
     
n/achr22 22,086,835immunoglobulin lambda variable 1-62 (pseudogene) (from HGNC IGLV1-62)
49LINC02642n/a
    
    
     
n/achr10 7,458,100long intergenic non-protein coding RNA 2642, transcript variant 12 (from RefSeq NR_184124.1)
50ENSG00000226918n/a
    
    
     
n/achrY 21,315,081ENSG00000226918 (from geneSymbol)