UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ATP5MC2P3n/a
    
    
     
n/achr2 197,263,323ATP synthase membrane subunit c locus 2 pseudogene 3 (from HGNC ATP5MC2P3)
2TPM3P8n/a
    
    
     
n/achr2 230,573,488tropomyosin 3 pseudogene 8 (from HGNC TPM3P8)
3RN7SL337Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 14,584,245RNA, 7SL, cytoplasmic 337, pseudogene (from HGNC RN7SL337P)
4ENSG00000262703n/a
    
    
     
n/achr16 11,348,732ENSG00000262703 (from geneSymbol)
5CCL3L3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 36,195,813C-C motif chemokine ligand 3 like 3 (from RefSeq NM_001001437.4)
6RNU2-6Pn/a
    
    
     
n/achr13 46,374,495RNA, U2 small nuclear 6, pseudogene (from HGNC RNU2-6P)
7TRGV1n/a
    
    
     
n/achr7 38,367,877Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0A0MS02)
8ENSG00000267312n/a
    
    
     
n/achr17 35,460,015ENSG00000267312 (from geneSymbol)
9ENSG00000258760n/a
    
    
     
n/achr14 65,269,580ENSG00000258760 (from geneSymbol)
10ENSG00000256988n/a
    
    
     
n/achr12 4,817,638ENSG00000256988 (from geneSymbol)
11RNA5SP69n/a
    
    
     
n/achr1 178,560,971RNA, 5S ribosomal pseudogene 69 (from HGNC RNA5SP69)
12LINC01934n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 181,266,579long intergenic non-protein coding RNA 1934 (from RefSeq NR_130784.1)
13RN7SL211Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 64,907,000RNA, 7SL, cytoplasmic 211, pseudogene (from HGNC RN7SL211P)
14ENSG00000227055n/a
    
    
     
n/achr2 159,813,121ENSG00000227055 (from geneSymbol)
15RN7SL793Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 102,217,465RNA, 7SL, cytoplasmic 793, pseudogene (from HGNC RN7SL793P)
16CCR12Pn/a
    
    
     
n/achr13 99,408,375C-C motif chemokine receptor 12, pseudogene (from HGNC CCR12P)
17ENSG00000290577n/a
    
    
     
n/achr13 99,410,954ENSG00000290577 (from geneSymbol)
18ARB2BPn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 101,522,435ARB2BP (from geneSymbol)
19FAM32BPn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 17,213,835family with sequence similarity 32 member B, pseudogene (from HGNC FAM32BP)
20ENSG00000233290n/a
    
    
     
n/achr1 82,530,309ENSG00000233290 (from geneSymbol)
21SNORD13n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 33,513,526small nucleolar RNA, C/D box 13 (from RefSeq NR_003041.1)
22OR5H7Pn/a
    
    
     
n/achr3 98,238,816olfactory receptor family 5 subfamily H member 7 pseudogene (from HGNC OR5H7P)
23RNA5SP323n/a
    
    
     
n/achr10 93,510,614RNA, 5S ribosomal pseudogene 323 (from HGNC RNA5SP323)
24NIFKP6n/a
    
    
     
n/achr19 51,400,140nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67 pseudogene 6 (from HGNC NIFKP6)
25RNU1-11Pn/a
    
    
     
n/achr6 13,214,137RNA, U1 small nuclear 11, pseudogene (from HGNC RNU1-11P)
26LINC03089n/a
    
    
     
n/achr10 44,260,707LINC03089 (from geneSymbol)
27RAB1AP1n/a
    
    
     
n/achr2 190,993,103RAB1AP1 (from geneSymbol)
28ENSG00000236800n/a
    
    
     
n/achr10 48,668,311ENSG00000236800 (from geneSymbol)
29ENSG00000262408n/a
    
    
     
n/achr17 56,884,729ENSG00000262408 (from geneSymbol)
30EIF5AP2n/a
    
    
     
n/achr17 78,158,269eukaryotic translation initiation factor 5A pseudogene 2 (from HGNC EIF5AP2)
31ENSG00000261030n/a
    
    
     
n/achrX 13,094,116ENSG00000261030 (from geneSymbol)
32TP73-AS2n/a
    
    
     
n/achr1 3,713,249TP73 antisense RNA 2 (from RefSeq NR_185884.1)
33OR6S1n/a
    
    
     
n/achr14 20,641,193olfactory receptor family 6 subfamily S member 1 (from RefSeq NM_001001968.1)
34RPSAP50n/a
    
    
     
n/achr11 109,982,617ribosomal protein SA pseudogene 50 (from HGNC RPSAP50)
35ENSG00000251922n/a
    
    
     
n/achr10 6,017,124ENSG00000251922 (from geneSymbol)
36OR2T3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 248,473,829olfactory receptor family 2 subfamily T member 3 (from RefSeq NM_001005495.1)
37RPL13AP19n/a
    
    
     
n/achr10 48,745,836ribosomal protein L13a pseudogene 19 (from HGNC RPL13AP19)
38ENSG00000267766n/a
    
    
     
n/achr18 63,151,217ENSG00000267766 (from geneSymbol)
39RN7SL19Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 70,654,730RNA, 7SL, cytoplasmic 19, pseudogene (from HGNC RN7SL19P)
40ENSG00000258560n/a
    
    
     
n/achr14 100,063,840ENSG00000258560 (from geneSymbol)
41VTRNA1-3n/a
    
    
     
n/achr5 140,726,202vault RNA 1-3 (from RefSeq NR_026705.1)
42SNORD67n/a
    
    
     
n/achr11 46,762,444small nucleolar RNA, C/D box 67 (from RefSeq NR_003056.1)
43ENSG00000229405n/a
    
    
     
n/achr2 7,736,766ENSG00000229405 (from geneSymbol)
44ENSG00000206647n/a
    
    
     
n/achr2 10,155,139ENSG00000206647 (from geneSymbol)
45IGHEP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,722,160immunoglobulin heavy constant epsilon P1 (pseudogene) (from HGNC IGHEP1)
46MIR589n/a
    
    
     
n/achr7 5,495,868microRNA 589 (from RefSeq NR_030318.1)
47LINC02092n/a
    
    
     
n/achr17 73,747,205uncharacterized LOC100134391 (from RefSeq NR_164140.1)
48ENSG00000268289n/a
    
    
     
n/achr19 17,053,540ENSG00000268289 (from geneSymbol)
49RPL22P12n/a
    
    
     
n/achr2 110,634,140ribosomal protein L22 pseudogene 12 (from HGNC RPL22P12)
50MIR34An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 9,151,722microRNA 34a (from RefSeq NR_029610.1)