UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1RPL37P1n/a
    
    
     
n/achr20 35,588,465ribosomal protein L37 pseudogene 1 (from HGNC RPL37P1)
2IGKV3OR2-268n/a
    
    
     
n/achr2 87,338,773immunoglobulin kappa variable 3/OR2-268 (non-functional) (from HGNC IGKV3OR2-268)
3IGLC4n/a
    
    
     
n/achr22 22,910,951immunoglobulin lambda constant 4 (pseudogene) (from HGNC IGLC4)
4IGKV1D-37n/a
    
    
     
n/achr2 89,884,978Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin light chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt P0DSN7)
5IGHV3-41n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 106,443,358immunoglobulin heavy variable 3-41 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-41)
6UGT2B28n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 69,287,762UDP glucuronosyltransferase family 2 member B28, transcript variant 1 (from RefSeq NM_053039.2)
7COX6CP2n/a
    
    
     
n/achr20 50,479,879cytochrome c oxidase subunit 6C pseudogene 2 (from HGNC COX6CP2)
8TIFABn/a
    
    
     
n/achr5 135,448,288TIFA inhibitor (from RefSeq NM_001099221.2)
9C8orf44-SGK3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 66,764,044C8orf44-SGK3 readthrough (from RefSeq NM_001204173.2)
10ENSG00000223946n/a
    
    
     
n/achr6 42,030,717ENSG00000223946 (from geneSymbol)
11IGLV1-62n/a
    
    
     
n/achr22 22,086,835immunoglobulin lambda variable 1-62 (pseudogene) (from HGNC IGLV1-62)
12IGKV1D-43n/a
    
    
     
n/achr2 90,210,201V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0B4J1Z2)
13IGKV2OR2-2n/a
    
    
     
n/achr2 97,050,878immunoglobulin kappa variable 2/OR2-2 (pseudogene) (from HGNC IGKV2OR2-2)
14IGHV1-17n/a
    
    
     
n/achr14 106,174,551immunoglobulin heavy variable 1-17 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-17)
15RPL21P7n/a
    
    
     
n/achr14 65,267,164ribosomal protein L21 pseudogene 7 (from HGNC RPL21P7)
16IGKV7-3n/a
    
    
     
n/achr2 88,915,229immunoglobulin kappa variable 7-3 (pseudogene) (from HGNC IGKV7-3)
17RPL4P1n/a
    
    
     
n/achr14 21,750,907ribosomal protein L4 pseudogene 1 (from HGNC RPL4P1)
18IGKV3D-7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 90,235,091V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0C4DH55)
19RPL34P17n/a
    
    
     
n/achr8 52,313,327ribosomal protein L34 pseudogene 17 (from HGNC RPL34P17)
20MIR3972n/a
    
    
     
n/achr1 17,277,932microRNA 3972 (from RefSeq NR_039768.1)
21EIF4A1P1n/a
    
    
     
n/achr21 27,367,480eukaryotic translation initiation factor 4A1 pseudogene 1 (from HGNC EIF4A1P1)
22LINC02260n/a
    
    
     
n/achr4 54,605,171long intergenic non-protein coding RNA 2260 (from RefSeq NR_134657.1)
23ENSG00000257737n/a
    
    
     
n/achr12 103,656,387ENSG00000257737 (from geneSymbol)
24IGHEn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,599,709Constant region of immunoglobulin heavy chains.  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:17576170, PubMed:20176268). (from UniProt P01854)
25ATP6V0CP2n/a
    
    
     
n/achr3 111,478,840ATPase H+ transporting V0 subunit c pseudogene 2 (from HGNC ATP6V0CP2)
26IGLV3-6n/a
    
    
     
n/achr22 22,850,499immunoglobulin lambda variable 3-6 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-6)
27RPS29P19n/a
    
    
     
n/achr11 113,751,201ribosomal protein S29 pseudogene 19 (from HGNC RPS29P19)
28SCUBE1-AS1n/a
    
    
     
n/achr22 43,279,892SCUBE1 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_134582.1)
29NBPF17Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 143,615,428NBPF member 17, pseudogene (from HGNC NBPF17P)
30RNU6-1065Pn/a
    
    
     
n/achr17 10,857,951RNA, U6 small nuclear 1065, pseudogene (from HGNC RNU6-1065P)
31IGKV2D-26n/a
    
    
     
n/achr2 89,986,312V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0A0MRZ7)
32IGHV4-80n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 106,872,984immunoglobulin heavy variable 4-80 (pseudogene) (from HGNC IGHV4-80)
33RPS12P2n/a
    
    
     
n/achr10 80,215,985ribosomal protein S12 pseudogene 2 (from HGNC RPS12P2)
34OR5AO1Pn/a
    
    
     
n/achr11 57,045,240olfactory receptor family 5 subfamily AO member 1 pseudogene (from HGNC OR5AO1P)
35RN7SL250Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 54,420,596RNA, 7SL, cytoplasmic 250, pseudogene (from HGNC RN7SL250P)
36RPL21P40n/a
    
    
     
n/achr3 32,030,437ribosomal protein L21 pseudogene 40 (from HGNC RPL21P40)
37MIR5091n/a
    
    
     
n/achr4 13,627,911microRNA 5091 (from RefSeq NR_049814.1)
38Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr12 32,705,454Y_RNA (from geneSymbol)
39ENSG00000256176n/a
    
    
     
n/achr12 31,311,823ENSG00000256176 (from geneSymbol)
40ENSG00000257726n/a
    
    
     
n/achr12 115,363,878ENSG00000257726 (from geneSymbol)
41ENSG00000226918n/a
    
    
     
n/achrY 21,315,081ENSG00000226918 (from geneSymbol)
42NEFLP1n/a
    
    
     
n/achrY 21,221,597neurofilament light pseudogene 1 (from HGNC NEFLP1)
43MRPL42P2n/a
    
    
     
n/achr6 16,171,818mitochondrial ribosomal protein L42 pseudogene 2 (from HGNC MRPL42P2)
44RN7SL619Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 13,815,190RNA, 7SL, cytoplasmic 619, pseudogene (from HGNC RN7SL619P)
45OR5BQ1Pn/a
    
    
     
n/achr11 57,029,565olfactory receptor family 5 subfamily BQ member 1 pseudogene (from HGNC OR5BQ1P)
46BBLNP2n/a
    
    
     
n/achr22 28,836,015BBLNP2 (from geneSymbol)
47MARCOLn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 148,241,052MARCO like (from RefSeq NM_001363511.2)
48RNU6-1278Pn/a
    
    
     
n/achr18 46,121,668RNA, U6 small nuclear 1278, pseudogene (from HGNC RNU6-1278P)
49RN7SL706Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 68,149,762RNA, 7SL, cytoplasmic 706, pseudogene (from HGNC RN7SL706P)
50Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr1 111,446,853Y_RNA (from geneSymbol)