UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000231102n/a
    
    
     
n/achr6 41,727,214ENSG00000231102 (from geneSymbol)
2PA2G4P6n/a
    
    
     
n/achr9 89,450,156proliferation-associated 2G4 pseudogene 6 (from HGNC PA2G4P6)
3POLR2CP1n/a
    
    
     
n/achr21 14,757,970RNA polymerase II subunit C pseudogene 1 (from HGNC POLR2CP1)
4ENSG00000230322n/a
    
    
     
n/achr10 11,170,149ENSG00000230322 (from geneSymbol)
5CCL3L3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 36,195,813C-C motif chemokine ligand 3 like 3 (from RefSeq NM_001001437.4)
6HNRNPA3P2n/a
    
    
     
n/achr20 36,620,913heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 pseudogene 2 (from HGNC HNRNPA3P2)
7ENSG00000267312n/a
    
    
     
n/achr17 35,460,015ENSG00000267312 (from geneSymbol)
8HNRNPA3P15n/a
    
    
     
n/achr2 197,015,502heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 pseudogene 15 (from HGNC HNRNPA3P15)
9TRDV3n/a
    
    
     
n/achr14 22,469,369V region of the variable domain of T cell receptor (TR) delta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:28920588, PubMed:23348415). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0JD37)
10RAB1AP1n/a
    
    
     
n/achr2 190,993,103RAB1AP1 (from geneSymbol)
11CR1Ln/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 207,684,418complement C3b/C4b receptor 1 like (from RefSeq NM_175710.2)
12CD46P1n/a
    
    
     
n/achr1 207,651,322CD46 molecule pseudogene 1 (from HGNC CD46P1)
13HMGB1P13n/a
    
    
     
n/achr6 132,868,538high mobility group box 1 pseudogene 13 (from HGNC HMGB1P13)
14ENSG00000254263n/a
    
    
     
n/achr8 129,896,111ENSG00000254263 (from geneSymbol)
15GOLGA5P1n/a
    
    
     
n/achr5 39,169,772golgin A5 pseudogene 1 (from HGNC GOLGA5P1)
16ENSG00000262408n/a
    
    
     
n/achr17 56,884,729ENSG00000262408 (from geneSymbol)
17IGHEP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,722,160immunoglobulin heavy constant epsilon P1 (pseudogene) (from HGNC IGHEP1)
18FAM32BPn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 17,213,835family with sequence similarity 32 member B, pseudogene (from HGNC FAM32BP)
19RPL21P123n/a
    
    
     
n/achr17 29,716,482ribosomal protein L21 pseudogene 123 (from HGNC RPL21P123)
20EIF4A1P5n/a
    
    
     
n/achr13 36,938,947eukaryotic translation initiation factor 4A1 pseudogene 5 (from HGNC EIF4A1P5)
21CFAP69P1n/a
    
    
     
n/achr16 57,013,585CFAP69P1 (from geneSymbol)
22ATP5MC2P3n/a
    
    
     
n/achr2 197,263,323ATP synthase membrane subunit c locus 2 pseudogene 3 (from HGNC ATP5MC2P3)
23ENSG00000213045n/a
    
    
     
n/achr1 200,329,419ENSG00000213045 (from geneSymbol)
24CCNL2P1n/a
    
    
     
n/achr4 42,561,941cyclin L2 pseudogene 1 (from HGNC CCNL2P1)
25ENSG00000270218n/a
    
    
     
n/achr15 65,026,382ENSG00000270218 (from geneSymbol)
26ENSG00000271172n/a
    
    
     
n/achr4 25,220,658ENSG00000271172 (from geneSymbol)
27UNC93B6n/a
    
    
     
n/achr11 71,605,426unc-93 homolog B6, pseudogene (from HGNC UNC93B6)
28ENSG00000293238n/a
    
    
     
n/achr11 71,605,650ENSG00000293238 (from geneSymbol)
29RN7SL753Pn/a
    
    
     
n/achr2 202,333,583RNA, 7SL, cytoplasmic 753, pseudogene (from HGNC RN7SL753P)
30RNA5SP69n/a
    
    
     
n/achr1 178,560,971RNA, 5S ribosomal pseudogene 69 (from HGNC RNA5SP69)
31ENSG00000273093n/a
    
    
     
n/achr1 200,315,701ENSG00000273093 (from geneSymbol)
32LNCARODn/a
    
    
     
n/achr10 52,603,360LNCAROD (from geneSymbol)
33SDR42E1P5n/a
    
    
     
n/achr2 102,411,675short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 pseudogene 5 (from HGNC SDR42E1P5)
34SCARNA18n/a
    
    
     
n/achr5 83,064,270small Cajal body-specific RNA 18 (from RefSeq NR_003139.1)
35ENSG00000259962n/a
    
    
     
n/achr16 53,362,848ENSG00000259962 (from geneSymbol)
36C11orf98P3n/a
    
    
     
n/achr3 23,389,785C11orf98P3 (from geneSymbol)
37MIR589n/a
    
    
     
n/achr7 5,495,868microRNA 589 (from RefSeq NR_030318.1)
38RPL21P49n/a
    
    
     
n/achr4 102,662,842ribosomal protein L21 pseudogene 49 (from HGNC RPL21P49)
39TGIF2P1n/a
    
    
     
n/achr1 244,395,318TGFB induced factor homeobox 2 pseudogene 1 (from HGNC TGIF2P1)
40MTCO3P5n/a
    
    
     
n/achr2 143,099,415mitochondrially encoded cytochrome c oxidase III pseudogene 5 (from HGNC MTCO3P5)
41ENSG00000249189n/a
    
    
     
n/achr19 54,246,711ENSG00000249189 (from geneSymbol)
42OR7E100Pn/a
    
    
     
n/achr3 112,524,694olfactory receptor family 7 subfamily E member 100 pseudogene (from HGNC OR7E100P)
43RPS23P9n/a
    
    
     
n/achr1 161,618,788ribosomal protein S23 pseudogene 9 (from HGNC RPS23P9)
44RPL31P49n/a
    
    
     
n/achr12 110,461,175ribosomal protein L31 pseudogene 49 (from HGNC RPL31P49)
45RPS29P14n/a
    
    
     
n/achr7 33,036,297ribosomal protein S29 pseudogene 14 (from HGNC RPS29P14)
46ENSG00000266598n/a
    
    
     
n/achr17 65,052,608ENSG00000266598 (from geneSymbol)
47RN7SL587Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 77,547,706RNA, 7SL, cytoplasmic 587, pseudogene (from HGNC RN7SL587P)
48RPS23P10n/a
    
    
     
n/achr1 161,537,364ribosomal protein S23 pseudogene 10 (from HGNC RPS23P10)
49WARS1P1n/a
    
    
     
n/achr11 59,257,423WARS1P1 (from geneSymbol)
50EEF1B2P1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 52,505,526eukaryotic translation elongation factor 1 beta 2 pseudogene 1 (from HGNC EEF1B2P1)