UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1SAMD3n/a
n/a
n/a
n/a
0chr6 130,183,633sterile alpha motif domain containing 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001017373.4)
2ENSG00000227678n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 130,138,306ENSG00000227678 (from geneSymbol)
3PTPRN2-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 157,856,190PTPRN2 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_038966.1)
4SHISAL2An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 52,645,116shisa like 2A, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001042693.3)
5IFITM3P6n/a
    
    
     
n/achr12 47,135,699IFITM3P6 (from geneSymbol)
6XCL1n/a
    
    
     
n/achr1 168,579,337X-C motif chemokine ligand 1 (from RefSeq NM_002995.3)
7FASLGn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 172,662,989Fas ligand, transcript variant 1 (from RefSeq NM_000639.3)
8RPL12P27n/a
    
    
     
n/achr10 97,309,548ribosomal protein L12 pseudogene 27 (from HGNC RPL12P27)
9RPS12P20n/a
    
    
     
n/achr11 72,708,375ribosomal protein S12 pseudogene 20 (from HGNC RPS12P20)
10TRAT1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 108,838,895T cell receptor associated transmembrane adaptor 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_016388.4)
11ENSG00000255089n/a
    
    
     
n/achr11 322,208ENSG00000255089 (from geneSymbol)
12CCR4n/a
    
    
     
n/achr3 32,953,996C-C motif chemokine receptor 4 (from RefSeq NM_005508.5)
13HBE1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 5,269,145hemoglobin subunit epsilon 1 (from RefSeq NM_005330.4)
14C5AR2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 47,339,752complement C5a receptor 2, transcript variant 3 (from RefSeq NM_001271750.2)
15ENSG00000240535n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 55,034,261ENSG00000240535 (from geneSymbol)
16ECE1-AS1n/a
    
    
     
n/achr1 21,296,532ECE1 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_038404.1)
17S100Zn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 76,885,832S100 calcium binding protein Z (from RefSeq NM_130772.4)
18TRGV7n/a
    
    
     
n/achr7 38,335,277T cell receptor gamma variable 7 (pseudogene) (from HGNC TRGV7)
19ENSG00000272908n/a
    
    
     
n/achr7 38,327,856ENSG00000272908 (from geneSymbol)
20SETP20n/a
    
    
     
n/achr4 109,553,668SET pseudogene 20 (from HGNC SETP20)
21SIGLEC22Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 51,211,599sialic acid binding Ig like lectin 22, pseudogene (from HGNC SIGLEC22P)
22ENSG00000217078n/a
    
    
     
n/achr6 16,163,569ENSG00000217078 (from geneSymbol)
23ENSG00000225720n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 39,091,848ENSG00000225720 (from geneSymbol)
24CYP2F2Pn/a
    
    
     
n/achr19 40,822,746cytochrome P450 family 2 subfamily F member 2, pseudogene (from HGNC CYP2F2P)
25ENSG00000293114n/a
    
    
     
n/achr19 40,822,442ENSG00000293114 (from geneSymbol)
26ENSG00000236194n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 42,271,600ENSG00000236194 (from geneSymbol)
27LYNn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 55,947,002LYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase, transcript variant 1 (from RefSeq NM_002350.4)
28TRAV8-3n/a
    
    
     
n/achr14 21,852,782V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0A6YYJ7)
29ENSG00000223779n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 143,752,959ENSG00000223779 (from geneSymbol)
30FAM91A3Pn/a
    
    
     
n/achr1 143,767,811family with sequence similarity 91 member A3, pseudogene (from HGNC FAM91A3P)
31NAIPP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 70,476,014NAIPP1 (from geneSymbol)
32ENSG00000260989n/a
    
    
     
n/achr16 1,595,427uncharacterized LOC105371046 (from RefSeq NR_135176.1)
33ENSG00000268618n/a
    
    
     
n/achr19 8,549,822ENSG00000268618 (from geneSymbol)
34KLRC4-KLRK1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 10,391,227Membrane ; Single-  pass type II membrane protein (from UniProt H3BQV0)
35CHIT1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 203,222,876chitinase 1, transcript variant 1 (from RefSeq NM_003465.3)
36DOCK8-AS2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 473,276DOCK8-AS2 (from geneSymbol)
37ENSG00000254094n/a
    
    
     
n/achr4 1,357,328ENSG00000254094 (from geneSymbol)
38BTG1P1n/a
    
    
     
n/achr12 9,135,337BTG anti-proliferation factor 1 pseudogene 1 (from HGNC BTG1P1)
39ENSG00000272839n/a
    
    
     
n/achr7 157,868,846ENSG00000272839 (from geneSymbol)
40TMCO1-AS1n/a
    
    
     
n/achr1 165,772,052TMCO1 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_125374.1)
41SEPTIN14P3n/a
    
    
     
n/achr3 198,228,285SEPTIN14P3 (from geneSymbol)
42TRAV4n/a
    
    
     
n/achr14 21,736,567V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J268)
43FAM187B2Pn/a
    
    
     
n/achr19 35,232,647family with sequence similarity 187 member B2, pseudogene (from HGNC FAM187B2P)
44ENSG00000197149n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 17,228,715ENSG00000197149 (from geneSymbol)
45ENSG00000279742n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 85,853,750ENSG00000279742 (from geneSymbol)
46ENSG00000269924n/a
    
    
     
n/achr8 47,527,772ENSG00000269924 (from geneSymbol)
47TRGV2n/a
    
    
     
n/achr7 38,363,191V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A075B6R0)
48ENSG00000235081n/a
    
    
     
n/achr19 54,229,624ENSG00000235081 (from geneSymbol)
49OR11H7n/a
    
    
     
n/achr14 20,229,874olfactory receptor family 11 subfamily H member 7 (gene/pseudogene) (from HGNC OR11H7)
50ENSG00000213600n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 50,239,801ENSG00000213600 (from geneSymbol)