UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1IPO7P1n/a
    
    
     
n/achrX 51,922,181importin 7 pseudogene 1 (from HGNC IPO7P1)
2ENSG00000257429n/a
    
    
     
n/achr12 80,588,692ENSG00000257429 (from geneSymbol)
3PHB1P21n/a
    
    
     
n/achr16 52,935,224PHB1P21 (from geneSymbol)
4RPL14P6n/a
    
    
     
n/achr2 128,203,568RPL14P6 (from geneSymbol)
5RN7SL505Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 33,045,944RNA, 7SL, cytoplasmic 505, pseudogene (from HGNC RN7SL505P)
6ENSG00000282610n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 511,206V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0J9YX75)
7APOOP2n/a
    
    
     
n/achr3 87,595,107apolipoprotein O pseudogene 2 (from HGNC APOOP2)
8ENSG00000268209n/a
    
    
     
n/achr4 69,387,943ENSG00000268209 (from geneSymbol)
9RN7SL246Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 45,874,182RNA, 7SL, cytoplasmic 246, pseudogene (from HGNC RN7SL246P)
10BRWD1P3n/a
    
    
     
n/achr7 17,033,283bromodomain and WD repeat domain containing 1 pseudogene 3 (from HGNC BRWD1P3)
11RN7SL865Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 115,717,869RNA, 7SL, cytoplasmic 865, pseudogene (from HGNC RN7SL865P)
12ENSG00000261627n/a
    
    
     
n/achr18 6,642,224ENSG00000261627 (from geneSymbol)
13LINC01787n/a
    
    
     
n/achr1 96,314,097long intergenic non-protein coding RNA 1787 (from RefSeq NR_110693.1)
14AKIRIN1P1n/a
    
    
     
n/achr12 80,561,288akirin 1 pseudogene 1 (from HGNC AKIRIN1P1)
15OR7E93Pn/a
    
    
     
n/achr3 125,724,992olfactory receptor family 7 subfamily E member 93 pseudogene (from HGNC OR7E93P)
16ENSG00000213560n/a
    
    
     
n/achr1 78,091,776ENSG00000213560 (from geneSymbol)
17ENSG00000261774n/a
    
    
     
n/achr16 72,278,418ENSG00000261774 (from geneSymbol)
18OR10J3n/a
    
    
     
n/achr1 159,314,189olfactory receptor family 10 subfamily J member 3 (from RefSeq NR_172557.1)
19MIR133Bn/a
    
    
     
n/achr6 52,148,982microRNA 133b (from RefSeq NR_029903.1)
20ENSG00000251691n/a
    
    
     
n/achr4 69,306,821ENSG00000251691 (from geneSymbol)
21ENSG00000212421n/a
    
    
     
n/achr9 87,260,517ENSG00000212421 (from geneSymbol)
22RPS18P8n/a
    
    
     
n/achr6 4,979,283ribosomal protein S18 pseudogene 8 (from HGNC RPS18P8)
23RN7SL744Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 54,344,743RNA, 7SL, cytoplasmic 744, pseudogene (from HGNC RN7SL744P)
24RN7SL668Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 234,904,337RNA, 7SL, cytoplasmic 668, pseudogene (from HGNC RN7SL668P)
25ENSG00000261191n/a
    
    
     
n/achr15 36,655,141ENSG00000261191 (from geneSymbol)
26SPINT4n/a
    
    
     
n/achr20 45,724,088serine peptidase inhibitor, Kunitz type 4 (from RefSeq NM_178455.3)
27ENSG00000258133n/a
    
    
     
n/achr12 58,394,867ENSG00000258133 (from geneSymbol)
28IGKV1OR-2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 64,765,294immunoglobulin kappa variable 1/OR-2 (pseudogene) (from HGNC IGKV1OR-2)
29OR1L1n/a
    
    
     
n/achr9 122,662,182olfactory receptor family 1 subfamily L member 1 (from RefSeq NM_001005236.3)
30LNCARODn/a
    
    
     
n/achr10 52,603,360LNCAROD (from geneSymbol)
31RPL21P69n/a
    
    
     
n/achr6 159,526,294ribosomal protein L21 pseudogene 69 (from HGNC RPL21P69)
32ENSG00000225869n/a
    
    
     
n/achr5 143,752,397ENSG00000225869 (from geneSymbol)
33PSG2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 43,073,455pregnancy specific beta-1-glycoprotein 2 (from RefSeq NM_031246.4)
34RABGAP1L-IT1n/a
    
    
     
n/achr1 174,897,477RABGAP1L intronic transcript 1 (from HGNC RABGAP1L-IT1)
35KLF4P1n/a
    
    
     
n/achr9 4,804,380Kruppel like factor 4 pseudogene 1 (from HGNC KLF4P1)
36SLC6A14P1n/a
    
    
     
n/achrX 116,675,056SLC6A14P1 (from geneSymbol)
37XGY1n/a
    
    
     
n/achrY 12,473,707Xg pseudogene, Y-linked 1 (from HGNC XGY1)
38MTHFD2P7n/a
    
    
     
n/achr3 179,464,837methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 7 (from HGNC MTHFD2P7)
39ESDP1n/a
    
    
     
n/achr6 17,381,743ESDP1 (from geneSymbol)
40NIPA2P1n/a
    
    
     
n/achr7 91,320,615NIPA magnesium transporter 2 pseudogene 1 (from HGNC NIPA2P1)
41ENSG00000259968n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 73,953,477ENSG00000259968 (from geneSymbol)
42ATF1P1n/a
    
    
     
n/achr6 92,887,916activating transcription factor 1 pseudogene 1 (from HGNC ATF1P1)
43RPL21P47n/a
    
    
     
n/achr4 62,248,532ribosomal protein L21 pseudogene 47 (from HGNC RPL21P47)
44CPMERn/a
    
    
     
n/achr22 27,695,764cytoplasmic mesoderm regulator (from RefSeq NR_186699.1)
45ENSG00000249000n/a
    
    
     
n/achr4 134,788,344ENSG00000249000 (from geneSymbol)
46ENSG00000253619n/a
    
    
     
n/achr8 121,016,409ENSG00000253619 (from geneSymbol)
47LINC02707n/a
    
    
     
n/achr11 34,572,429LINC02707 (from geneSymbol)
48LARP4Pn/a
    
    
     
n/achr15 36,618,177La ribonucleoprotein domain family member 4 pseudogene (from HGNC LARP4P)
49PAEPP1n/a
    
    
     
n/achr9 135,589,988progestagen associated endometrial protein pseudogene 1 (from HGNC PAEPP1)
50MRPS15P1n/a
    
    
     
n/achr15 73,483,569mitochondrial ribosomal protein S15 pseudogene 1 (from HGNC MRPS15P1)