UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1RNF216-IT1n/a
    
    
     
n/achr7 5,671,446RNF216 intronic transcript 1 (from RefSeq NR_046834.1)
2MYL6P3n/a
    
    
     
n/achr10 65,169,653myosin light chain 6 pseudogene 3 (from HGNC MYL6P3)
3ENSG00000257943n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 95,363,705ENSG00000257943 (from geneSymbol)
4ENSG00000255342n/a
    
    
     
n/achr11 123,136,149ENSG00000255342 (from geneSymbol)
5Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr1 8,328,123Y_RNA (from geneSymbol)
6RPL7L1P9n/a
    
    
     
n/achr2 217,760,919ribosomal protein L7 like 1 pseudogene 9 (from HGNC RPL7L1P9)
7ENSG00000237073n/a
    
    
     
n/achr9 113,580,104ENSG00000237073 (from geneSymbol)
8CLIC4P3n/a
    
    
     
n/achrX 41,077,374chloride intracellular channel 4 pseudogene 3 (from HGNC CLIC4P3)
9ENSG00000249002n/a
    
    
     
n/achr4 119,006,216ENSG00000249002 (from geneSymbol)
10EEF1A1P18n/a
    
    
     
n/achr11 65,025,952eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 pseudogene 18 (from HGNC EEF1A1P18)
11TRAV18n/a
    
    
     
n/achr14 22,003,389V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A075B6X5)
12ENSG00000218682n/a
    
    
     
n/achr2 25,856,713ENSG00000218682 (from geneSymbol)
13MRGPRDn/a
    
    
     
n/achr11 68,980,503MAS related GPR family member D (from RefSeq NM_198923.2)
14ENSG00000268473n/a
    
    
     
n/achr16 86,435,357ENSG00000268473 (from geneSymbol)
15ENSG00000255583n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 63,704,841ENSG00000255583 (from geneSymbol)
16ENSG00000206776n/a
    
    
     
n/achr8 119,388,408ENSG00000206776 (from geneSymbol)
17BLZF2Pn/a
    
    
     
n/achr14 68,868,904basic leucine zipper nuclear factor 2 pseudogene (from HGNC BLZF2P)
18PHOX2An/a
    
    
     
n/achr11 72,241,626paired like homeobox 2A (from RefSeq NM_005169.4)
19ENSG00000270897n/a
    
    
     
n/achr11 11,182,260ENSG00000270897 (from geneSymbol)
20ENSG00000260530n/a
    
    
     
n/achr16 84,296,241ENSG00000260530 (from geneSymbol)
21LINC01695n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 28,172,380long intergenic non-protein coding RNA 1695 (from RefSeq NR_126012.1)
22PSME2P4n/a
    
    
     
n/achr4 37,995,848proteasome activator subunit 2 pseudogene 4 (from HGNC PSME2P4)
23ENSG00000270281n/a
    
    
     
n/achr19 34,779,716ENSG00000270281 (from geneSymbol)
24FOLR1P1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 72,159,278folate receptor 1 pseudogene 1 (from HGNC FOLR1P1)
25RN7SKP293n/a
    
    
     
n/achr6 12,406,633RNA, 7SK small nuclear pseudogene 293 (from HGNC RN7SKP293)
26ENSG00000224844n/a
    
    
     
n/achr2 237,123,503ENSG00000224844 (from geneSymbol)
27ENSG00000257178n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 48,580,944ENSG00000257178 (from geneSymbol)
28MIR10An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 48,579,892microRNA 10a (from RefSeq NR_029608.1)
29ENSG00000268505n/a
    
    
     
n/achr16 86,195,853ENSG00000268505 (from geneSymbol)
30RPL7P15n/a
    
    
     
n/achr3 124,152,511ribosomal protein L7 pseudogene 15 (from HGNC RPL7P15)
31RN7SKP208n/a
    
    
     
n/achr2 55,951,834RNA, 7SK small nuclear pseudogene 208 (from HGNC RN7SKP208)
32MIR3164n/a
    
    
     
n/achr11 69,083,217microRNA 3164 (from RefSeq NR_036122.1)
33HMGB1P21n/a
    
    
     
n/achr5 78,644,555high mobility group box 1 pseudogene 21 (from HGNC HMGB1P21)
34PPIAP16n/a
    
    
     
n/achr3 57,942,061peptidylprolyl isomerase A pseudogene 16 (from HGNC PPIAP16)
35ENSG00000251031n/a
    
    
     
n/achr5 145,042,864ENSG00000251031 (from geneSymbol)
36HMGB1P39n/a
    
    
     
n/achr6 75,319,540high mobility group box 1 pseudogene 39 (from HGNC HMGB1P39)
37RN7SL665Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 130,400,415RNA, 7SL, cytoplasmic 665, pseudogene (from HGNC RN7SL665P)
38ZCRB1P1n/a
    
    
     
n/achrX 71,315,395ZCRB1P1 (from geneSymbol)
39RPLP1P13n/a
    
    
     
n/achr13 23,373,742ribosomal protein lateral stalk subunit P1 pseudogene 13 (from HGNC RPLP1P13)
40ENSG00000253373n/a
    
    
     
n/achr8 69,176,884ENSG00000253373 (from geneSymbol)
41LINC02557n/a
    
    
     
n/achr22 23,513,048long intergenic non-protein coding RNA 2557 (from HGNC LINC02557)
42BANF1P1n/a
    
    
     
n/achr14 68,936,733barrier to autointegration factor 1 pseudogene 1 (from HGNC BANF1P1)
43ENSG00000262662n/a
    
    
     
n/achr17 80,961,239ENSG00000262662 (from geneSymbol)
44KRT18P57n/a
    
    
     
n/achr1 111,648,917keratin 18 pseudogene 57 (from HGNC KRT18P57)
45ENSG00000253630n/a
    
    
     
n/achr5 157,747,605ENSG00000253630 (from geneSymbol)
46ENSG00000212939n/a
    
    
     
n/achr22 49,552,577ENSG00000212939 (from geneSymbol)
47ENSG00000271021n/a
    
    
     
n/achrX 115,454,963ENSG00000271021 (from geneSymbol)
48LINC01581n/a
    
    
     
n/achr15 94,006,671long intergenic non-protein coding RNA 1581 (from RefSeq NR_120320.1)
49ENSG00000233625n/a
    
    
     
n/achr20 17,887,761ENSG00000233625 (from geneSymbol)
50LINC02279n/a
    
    
     
n/achr14 94,961,626long intergenic non-protein coding RNA 2279 (from HGNC LINC02279)