UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1GAPDHP14n/a
    
    
     
n/achr21 29,222,789glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase pseudogene 14 (from HGNC GAPDHP14)
2MRPL53P1n/a
    
    
     
n/achr1 112,626,065mitochondrial ribosomal protein L53 pseudogene 1 (from HGNC MRPL53P1)
3SDR42E1P5n/a
    
    
     
n/achr2 102,411,675short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 pseudogene 5 (from HGNC SDR42E1P5)
4GOLGA5P1n/a
    
    
     
n/achr5 39,169,772golgin A5 pseudogene 1 (from HGNC GOLGA5P1)
5ENSG00000269385n/a
    
    
     
n/achr19 6,898,492ENSG00000269385 (from geneSymbol)
6CLEC6An/a
    
    
     
n/achr12 8,467,146C-type lectin domain containing 6A, transcript variant 2 (from RefSeq NM_001317999.2)
7MTCO2P33n/a
    
    
     
n/achr6 24,948,112mitochondrially encoded cytochrome c oxidase II pseudogene 33 (from HGNC MTCO2P33)
8MTND5P32n/a
    
    
     
n/achr15 58,153,506mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 5 pseudogene 32 (from HGNC MTND5P32)
9ENSG00000259600n/a
    
    
     
n/achr15 58,151,773ENSG00000259600 (from geneSymbol)
10SEPTIN7P8n/a
    
    
     
n/achr19 53,772,893SEPTIN7P8 (from geneSymbol)
11MTCO3P23n/a
    
    
     
n/achr15 58,150,419mitochondrially encoded cytochrome c oxidase III pseudogene 23 (from HGNC MTCO3P23)
12MTCO3P5n/a
    
    
     
n/achr2 143,099,415mitochondrially encoded cytochrome c oxidase III pseudogene 5 (from HGNC MTCO3P5)
13TRBV10-1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 383,711V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0K0K1A3)
14TAF11L2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 17,498,529TATA-box binding protein associated factor 11 like 2 (from RefSeq NM_001401696.1)
15TRGVAn/a
    
    
     
n/achr7 38,322,588T cell receptor gamma variable A (pseudogene) (from HGNC TRGVA)
16RN7SL587Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 77,547,706RNA, 7SL, cytoplasmic 587, pseudogene (from HGNC RN7SL587P)
17MTCYBP23n/a
    
    
     
n/achr15 58,155,510mitochondrially encoded cytochrome b pseudogene 23 (from HGNC MTCYBP23)
18RPS23P10n/a
    
    
     
n/achr1 161,537,364ribosomal protein S23 pseudogene 10 (from HGNC RPS23P10)
19RCBTB2P1n/a
    
    
     
n/achr10 88,786,330RCC1 and BTB domain containing protein 2 pseudogene 1 (from HGNC RCBTB2P1)
20ENSG00000240669n/a
    
    
     
n/achr4 152,614,104ENSG00000240669 (from geneSymbol)
21TREML5Pn/a
    
    
     
n/achr6 41,248,509triggering receptor expressed on myeloid cells like 5, pseudogene (from HGNC TREML5P)
22ENSG00000232696n/a
    
    
     
n/achr2 46,078,421ENSG00000232696 (from geneSymbol)
23TRAV34n/a
    
    
     
n/achr14 22,207,825V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J273)
24ENSG00000238150n/a
    
    
     
n/achr19 53,775,740ENSG00000238150 (from geneSymbol)
25ENSG00000254325n/a
    
    
     
n/achr8 55,894,667ENSG00000254325 (from geneSymbol)
26TPRKBP2n/a
    
    
     
n/achr16 28,111,410TP53RK binding protein pseudogene 2 (from HGNC TPRKBP2)
27ENSG00000259962n/a
    
    
     
n/achr16 53,362,848ENSG00000259962 (from geneSymbol)
28TRBV7-7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 495,472V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0K0K1E9)
29RPL21P123n/a
    
    
     
n/achr17 29,716,482ribosomal protein L21 pseudogene 123 (from HGNC RPL21P123)
30ENSG00000226134n/a
    
    
     
n/achr13 97,676,487ENSG00000226134 (from geneSymbol)
31MIR144n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 28,861,575microRNA 144 (from RefSeq NR_029685.1)
32MIR4732n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 28,861,692microRNA 4732 (from RefSeq NR_039885.1)
33MIR451An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 28,861,404microRNA 451a (from RefSeq NR_029970.1)
34ENSG00000243797n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 106,552,350ENSG00000243797 (from geneSymbol)
35ENSG00000218682n/a
    
    
     
n/achr2 25,856,713ENSG00000218682 (from geneSymbol)
36RN7SKP169n/a
    
    
     
n/achr22 25,964,128RNA, 7SK small nuclear pseudogene 169 (from HGNC RN7SKP169)
37ENSG00000225402n/a
    
    
     
n/achr2 37,817,438ENSG00000225402 (from geneSymbol)
38RPL7AP53n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 33,058,011ribosomal protein L7a pseudogene 53 (from HGNC RPL7AP53)
39TNFRSF10B-AS1n/a
    
    
     
n/achr8 23,075,924TNF receptor superfamily member 10d pseudogene (from RefSeq NR_038873.1)
40ENSG00000247925n/a
    
    
     
n/achr6 11,216,275ENSG00000247925 (from geneSymbol)
41RN7SL634Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 104,013,787RNA, 7SL, cytoplasmic 634, pseudogene (from HGNC RN7SL634P)
42HNRNPA1P52n/a
    
    
     
n/achr19 41,830,315heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 52 (from HGNC HNRNPA1P52)
43DPPA2P2n/a
    
    
     
n/achr1 26,519,802developmental pluripotency associated 2 pseudogene 2 (from HGNC DPPA2P2)
44Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr10 6,245,781Y_RNA (from geneSymbol)
45ENSG00000260256n/a
    
    
     
n/achr21 44,348,031ENSG00000260256 (from geneSymbol)
46IFNL1n/a
    
    
     
n/achr19 39,297,540interferon lambda 1 (from RefSeq NM_172140.2)
47LINC02598n/a
    
    
     
n/achr12 10,359,754LINC02598 (from geneSymbol)
48CR1Ln/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 207,684,418complement C3b/C4b receptor 1 like (from RefSeq NM_175710.2)
49RN7SL825Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 31,992,234RNA, 7SL, cytoplasmic 825, pseudogene (from HGNC RN7SL825P)
50RN7SL105Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 1,604,523RNA, 7SL, cytoplasmic 105, pseudogene (from HGNC RN7SL105P)