UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1SLC31A1P1n/a
    
    
     
n/achr3 172,603,723solute carrier family 31 member 1 pseudogene 1 (from HGNC SLC31A1P1)
2LHFPL3-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 104,771,343LHFPL3 antisense RNA 1 (from HGNC LHFPL3-AS1)
3LINC02092n/a
    
    
     
n/achr17 73,747,205uncharacterized LOC100134391 (from RefSeq NR_164140.1)
4RPL7AP65n/a
    
    
     
n/achr17 18,312,277ribosomal protein L7a pseudogene 65 (from HGNC RPL7AP65)
5ENSG00000218682n/a
    
    
     
n/achr2 25,856,713ENSG00000218682 (from geneSymbol)
6RNA5SP357n/a
    
    
     
n/achr12 34,205,758RNA, 5S ribosomal pseudogene 357 (from HGNC RNA5SP357)
7POLR3DP1n/a
    
    
     
n/achr10 74,655,543RNA polymerase III subunit D pseudogene 1 (from HGNC POLR3DP1)
8IGLV3-24n/a
    
    
     
n/achr22 22,694,695immunoglobulin lambda variable 3-24 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-24)
9LINC02598n/a
    
    
     
n/achr12 10,359,754LINC02598 (from geneSymbol)
10IFNL1n/a
    
    
     
n/achr19 39,297,540interferon lambda 1 (from RefSeq NM_172140.2)
11TRGVAn/a
    
    
     
n/achr7 38,322,588T cell receptor gamma variable A (pseudogene) (from HGNC TRGVA)
12RPL13AP9n/a
    
    
     
n/achr1 62,641,394ribosomal protein L13a pseudogene 9 (from HGNC RPL13AP9)
13IGKV2-4n/a
    
    
     
n/achr2 88,932,023immunoglobulin kappa variable 2-4 (pseudogene) (from HGNC IGKV2-4)
14ENSG00000232696n/a
    
    
     
n/achr2 46,078,421ENSG00000232696 (from geneSymbol)
15ENSG00000250781n/a
    
    
     
n/achr4 42,336,531ENSG00000250781 (from geneSymbol)
16ENSG00000223728n/a
    
    
     
n/achr1 147,841,660ENSG00000223728 (from geneSymbol)
17ENSG00000254065n/a
    
    
     
n/achr8 47,592,378ENSG00000254065 (from geneSymbol)
18ENSG00000261030n/a
    
    
     
n/achrX 13,094,116ENSG00000261030 (from geneSymbol)
19VPS26AP1n/a
    
    
     
n/achr3 113,919,711VPS26A pseudogene 1 (from HGNC VPS26AP1)
20UGT2B26Pn/a
    
    
     
n/achr4 69,036,204UDP glucuronosyltransferase family 2 member B26, pseudogene (from HGNC UGT2B26P)
21Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr8 97,772,369Y_RNA (from geneSymbol)
22ENSG00000250057n/a
    
    
     
n/achr4 83,240,362ENSG00000250057 (from geneSymbol)
23IGLV7-35n/a
    
    
     
n/achr22 22,450,427immunoglobulin lambda variable 7-35 (pseudogene) (from HGNC IGLV7-35)
24CFAP69P1n/a
    
    
     
n/achr16 57,013,585CFAP69P1 (from geneSymbol)
25SLC7A13n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 86,222,222solute carrier family 7 member 13 (from RefSeq NM_138817.3)
26ENSG00000226772n/a
    
    
     
n/achr22 29,105,362ENSG00000226772 (from geneSymbol)
27IGLV3-22n/a
    
    
     
n/achr22 22,704,543V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:17576170, PubMed:20176268). (from UniProt A0A075B6J6)
28TRBV10-1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 383,711V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0K0K1A3)
29LINC02061n/a
    
    
     
n/achr5 32,649,270long intergenic non-protein coding RNA 2061 (from HGNC LINC02061)
30ENSG00000234943n/a
    
    
     
n/achr2 54,546,022ENSG00000234943 (from geneSymbol)
31ENSG00000256875n/a
    
    
     
n/achr12 132,462,549ENSG00000256875 (from geneSymbol)
32RN7SL28Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 184,279,084RNA, 7SL, cytoplasmic 28, pseudogene (from HGNC RN7SL28P)
33H2BP6n/a
    
    
     
n/achr13 21,484,004H2BP6 (from geneSymbol)
34SDR42E1P5n/a
    
    
     
n/achr2 102,411,675short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 pseudogene 5 (from HGNC SDR42E1P5)
35DYTNn/a
    
    
     
n/achr2 206,685,008dystrotelin (from RefSeq NM_001093730.1)
36MTCO2P33n/a
    
    
     
n/achr6 24,948,112mitochondrially encoded cytochrome c oxidase II pseudogene 33 (from HGNC MTCO2P33)
37ENSG00000254975n/a
    
    
     
n/achr11 76,689,137ENSG00000254975 (from geneSymbol)
38RNU1-14Pn/a
    
    
     
n/achr7 53,366,133RNA, U1 small nuclear 14, pseudogene (from HGNC RNU1-14P)
39ENSG00000230379n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 24,965,624ENSG00000230379 (from geneSymbol)
40ENSG00000259889n/a
    
    
     
n/achr2 239,735,247ENSG00000259889 (from geneSymbol)
41LINC01593n/a
    
    
     
n/achr2 108,050,977long intergenic non-protein coding RNA 1593 (from RefSeq NR_135071.1)
42MRPL53P1n/a
    
    
     
n/achr1 112,626,065mitochondrial ribosomal protein L53 pseudogene 1 (from HGNC MRPL53P1)
43ENSG00000227197n/a
    
    
     
n/achr7 132,840,143ENSG00000227197 (from geneSymbol)
44SAMD7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 169,925,373sterile alpha motif domain containing 7, transcript variant 3 (from RefSeq NR_130713.2)
45DPPA3P2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 36,371,650developmental pluripotency associated 3 pseudogene 2 (from HGNC DPPA3P2)
46GPCPD1P1n/a
    
    
     
n/achr7 57,149,166GPCPD1P1 (from geneSymbol)
47ENSG00000240418n/a
    
    
     
n/achr19 16,413,130ENSG00000240418 (from geneSymbol)
48CALHM6-AS1n/a
    
    
     
n/achr6 116,462,215CALHM6 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_174951.1)
49RPS6P8n/a
    
    
     
n/achr6 73,391,402ribosomal protein S6 pseudogene 8 (from HGNC RPS6P8)
50SLC25A48-AS1n/a
    
    
     
n/achr5 135,651,259SLC25A48 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_027127.1)