UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1RPL21P35n/a
    
    
     
n/achr2 231,560,133ribosomal protein L21 pseudogene 35 (from HGNC RPL21P35)
2UBE2Q2P12n/a
    
    
     
n/achr15 84,496,039ubiquitin conjugating enzyme E2 Q2 pseudogene 12 (from HGNC UBE2Q2P12)
3ENSG00000239920n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 5,466,413ENSG00000239920 (from geneSymbol)
4SEPTIN14P8n/a
    
    
     
n/achr8 200,473SEPTIN14P8 (from geneSymbol)
5ENSG00000236990n/a
    
    
     
n/achr10 4,070,369ENSG00000236990 (from geneSymbol)
6ENSG00000233625n/a
    
    
     
n/achr20 17,887,761ENSG00000233625 (from geneSymbol)
7BNIP3P41n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 49,839BCL2 interacting protein 3 pseudogene 41 (from HGNC BNIP3P41)
8ENSG00000292991n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 49,526ENSG00000292991 (from geneSymbol)
9OR52V1Pn/a
    
    
     
n/achr11 5,527,725olfactory receptor family 52 subfamily V member 1 pseudogene (from HGNC OR52V1P)
10ENSG00000267055n/a
    
    
     
n/achr7 20,113,306ENSG00000267055 (from geneSymbol)
11ENSG00000260303n/a
    
    
     
n/achr4 146,054,683ENSG00000260303 (from geneSymbol)
12H2BP9n/a
    
    
     
n/achrX 103,904,538H2BP9 (from geneSymbol)
13ENSG00000237445n/a
    
    
     
n/achr1 13,658,610ENSG00000237445 (from geneSymbol)
14RNU1-2n/a
    
    
     
n/achr1 16,896,061RNA, U1 small nuclear 2 (from RefSeq NR_004427.1)
15PEBP1P3n/a
    
    
     
n/achr1 198,679,586phosphatidylethanolamine binding protein 1 pseudogene 3 (from HGNC PEBP1P3)
16MTCO2P11n/a
    
    
     
n/achr9 5,098,833mitochondrially encoded cytochrome c oxidase II pseudogene 11 (from HGNC MTCO2P11)
17FIGLAn/a
    
    
     
n/achr2 70,783,976folliculogenesis specific bHLH transcription factor (from RefSeq NM_001004311.3)
18MTND1P11n/a
    
    
     
n/achr9 5,094,576mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 1 pseudogene 11 (from HGNC MTND1P11)
19ENSG00000226576n/a
    
    
     
n/achr10 49,001,730ENSG00000226576 (from geneSymbol)
20RNU6-834Pn/a
    
    
     
n/achr12 49,593,158RNA, U6 small nuclear 834, pseudogene (from HGNC RNU6-834P)
21G3BP1P1n/a
    
    
     
n/achr2 135,511,244G3BP1P1 (from geneSymbol)
22RN7SL34Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 41,286,558RNA, 7SL, cytoplasmic 34, pseudogene (from HGNC RN7SL34P)
23OR52B3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 4,378,745olfactory receptor family 52 subfamily B member 3 pseudogene (from HGNC OR52B3P)
24ENSG00000236452n/a
    
    
     
n/achr3 34,236,027ENSG00000236452 (from geneSymbol)
25COX6CP2n/a
    
    
     
n/achr20 50,479,879cytochrome c oxidase subunit 6C pseudogene 2 (from HGNC COX6CP2)
26RPL12P42n/a
    
    
     
n/achr19 13,158,373ribosomal protein L12 pseudogene 42 (from HGNC RPL12P42)
27HNRNPA1P53n/a
    
    
     
n/achr11 5,571,719heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 53 (from HGNC HNRNPA1P53)
28RPS27P7n/a
    
    
     
n/achr1 173,741,801ribosomal protein S27 pseudogene 7 (from HGNC RPS27P7)
29PRICKLE2-AS2n/a
    
    
     
n/achr3 64,104,763PRICKLE2 antisense RNA 2 (from RefSeq NR_046701.1)
30ENSG00000261070n/a
    
    
     
n/achr11 69,159,396uncharacterized LOC338694 (from RefSeq NR_104161.1)
31RPL12P15n/a
    
    
     
n/achr2 121,658,724ribosomal protein L12 pseudogene 15 (from HGNC RPL12P15)
32VN2R10Pn/a
    
    
     
n/achr16 77,220,832vomeronasal 2 receptor 10, pseudogene (from HGNC VN2R10P)
33DDX39BP2n/a
    
    
     
n/achr6 29,993,407DEAD-box helicase 39B pseudogene 2 (from HGNC DDX39BP2)
34RPL31P11n/a
    
    
     
n/achr1 161,685,023ribosomal protein L31 pseudogene 11 (from HGNC RPL31P11)
35PPP1R2P6n/a
    
    
     
n/achr7 140,293,045protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 2 pseudogene 6 (from HGNC PPP1R2P6)
36TRGV1n/a
    
    
     
n/achr7 38,367,877Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0A0MS02)
37ENSG00000220702n/a
    
    
     
n/achr22 44,365,917ENSG00000220702 (from geneSymbol)
38RPS10P20n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 48,488,177ribosomal protein S10 pseudogene 20 (from HGNC RPS10P20)
39ASH2LP1n/a
    
    
     
n/achr22 22,420,818ASH2 like histone lysine methyltransferase complex subunit pseudogene 1 (from HGNC ASH2LP1)
40CALM2P3n/a
    
    
     
n/achr13 41,170,924calmodulin 2 pseudogene 3 (from HGNC CALM2P3)
41EIF5A2P1n/a
    
    
     
n/achr15 72,041,423eukaryotic translation initiation factor 5A2 pseudogene 1 (from HGNC EIF5A2P1)
42ENSG00000271587n/a
    
    
     
n/achr17 65,644,462ENSG00000271587 (from geneSymbol)
43MTCO1P11n/a
    
    
     
n/achr9 5,097,429mitochondrially encoded cytochrome c oxidase I pseudogene 11 (from HGNC MTCO1P11)
44ENSG00000260601n/a
    
    
     
n/achr16 12,546,083ENSG00000260601 (from geneSymbol)
45ENSG00000269802n/a
    
    
     
n/achr19 6,352,955ENSG00000269802 (from geneSymbol)
46SCAT1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 78,620,016SCAT1 (from geneSymbol)
47MTCO3P11n/a
    
    
     
n/achr9 5,100,622mitochondrially encoded cytochrome c oxidase III pseudogene 11 (from HGNC MTCO3P11)
48ENSG00000258234n/a
    
    
     
n/achr12 48,257,654ENSG00000258234 (from geneSymbol)
49TILAMn/a
    
    
     
n/achr17 50,212,433TILAM (from geneSymbol)
50ENSG00000227531n/a
    
    
     
n/achr9 111,212,041ENSG00000227531 (from geneSymbol)