UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000234211n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 161,673,401ENSG00000234211 (from geneSymbol)
2ENSG00000267349n/a
    
    
     
n/achr17 35,478,219ENSG00000267349 (from geneSymbol)
3ENSG00000267359n/a
    
    
     
n/achr17 35,553,986uncharacterized LOC107985033, transcript variant 2 (from RefSeq NR_138032.1)
4LINC02812n/a
    
    
     
n/achr1 53,367,389LINC02812 (from geneSymbol)
5IFNG-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 68,112,107IFNG antisense RNA 1 (from HGNC IFNG-AS1)
6ENSG00000228081n/a
    
    
     
n/achr1 209,173,194ENSG00000228081 (from geneSymbol)
7IL9RP3n/a
    
    
     
n/achr16 33,828interleukin 9 receptor pseudogene 3 (from HGNC IL9RP3)
8MIR378In/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 41,923,259microRNA 378i (from RefSeq NR_039760.1)
9MIR4538n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,858,203microRNA 4538 (from RefSeq NR_130467.1)
10MIR4507n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,858,149microRNA 4507 (from RefSeq NR_039730.1)
11FCRL4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 157,585,916Fc receptor like 4 (from RefSeq NM_031282.3)
12E2F3P1n/a
    
    
     
n/achr17 35,490,623E2F transcription factor 3 pseudogene 1 (from HGNC E2F3P1)
13IGLC5n/a
    
    
     
n/achr22 22,915,781immunoglobulin lambda constant 5 (pseudogene) (from HGNC IGLC5)
14RN7SL32Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 233,205,339RNA, 7SL, cytoplasmic 32, pseudogene (from HGNC RN7SL32P)
15LINC02390n/a
    
    
     
n/achr12 9,706,713long intergenic non-protein coding RNA 2390 (from HGNC LINC02390)
16BTBD6P1n/a
    
    
     
n/achr1 23,902,104BTB domain containing 6 pseudogene 1 (from HGNC BTBD6P1)
17ENSG00000241490n/a
    
    
     
n/achr3 114,225,297ENSG00000241490 (from geneSymbol)
18ENSG00000226571n/a
    
    
     
n/achr6 139,389,480ENSG00000226571 (from geneSymbol)
19ENSG00000266664n/a
    
    
     
n/achr17 19,150,782ENSG00000266664 (from geneSymbol)
20ENSG00000235419n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 230,550,300ENSG00000235419 (from geneSymbol)
21ENSG00000262151n/a
    
    
     
n/achr16 10,876,833ENSG00000262151 (from geneSymbol)
22PLCB2-AS1n/a
    
    
     
n/achr15 40,301,245PLCB2 antisense RNA 1 (from HGNC PLCB2-AS1)
23HNRNPA1P70n/a
    
    
     
n/achr12 68,036,310heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 70 (from HGNC HNRNPA1P70)
24TRGV5n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 38,349,688V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0B4J1U4)
25TRGV8n/a
    
    
     
n/achr7 38,330,639V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0C4DH27)
26RPL13AP8n/a
    
    
     
n/achr1 206,907,924ribosomal protein L13a pseudogene 8 (from HGNC RPL13AP8)
27RPL13AP15n/a
    
    
     
n/achr6 119,269,423ribosomal protein L13a pseudogene 15 (from HGNC RPL13AP15)
28HNRNPA1P21n/a
    
    
     
n/achr3 39,335,459heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 21 (from HGNC HNRNPA1P21)
29IGLJ2n/a
    
    
     
n/achr22 22,899,568immunoglobulin lambda joining 2 (from HGNC IGLJ2)
30RN7SL842Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 14,588,506RNA, 7SL, cytoplasmic 842, pseudogene (from HGNC RN7SL842P)
31IGHV3-22n/a
    
    
     
n/achr14 106,257,992immunoglobulin heavy variable 3-22 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-22)
32CCR8n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 39,331,694C-C motif chemokine receptor 8 (from RefSeq NM_005201.4)
33RNY1P11n/a
    
    
     
n/achr7 129,164,905RNA, Ro-associated Y1 pseudogene 11 (from HGNC RNY1P11)
34ENSG00000272719n/a
    
    
     
n/achr7 5,556,988ENSG00000272719 (from geneSymbol)
35ENSG00000230709n/a
    
    
     
n/achr17 16,978,676uncharacterized LOC284191 (from RefSeq NR_148948.1)
36LINC01393n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 115,078,249long intergenic non-protein coding RNA 1393 (from HGNC LINC01393)
37VN1R105Pn/a
    
    
     
n/achr19 54,648,398vomeronasal 1 receptor 105 pseudogene (from HGNC VN1R105P)
38RN7SL172Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 121,654,145RNA, 7SL, cytoplasmic 172, pseudogene (from HGNC RN7SL172P)
39ENSG00000268316n/a
    
    
     
n/achr19 51,840,358ENSG00000268316 (from geneSymbol)
40IGHV4OR15-8n/a
    
    
     
n/achr15 22,185,184Immunoglobulins are composed of two identical heavy chains and  two identical light chains; disulfide-linked. (from UniProt A0A075B7B6)
41ENSG00000225885n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 118,345,906ENSG00000225885 (from geneSymbol)
42RUNX3-AS1n/a
    
    
     
n/achr1 24,962,221RUNX3-AS1 (from geneSymbol)
43IGHV1OR15-3n/a
    
    
     
n/achr15 22,178,324immunoglobulin heavy variable 1/OR15-3 (pseudogene) (from HGNC IGHV1OR15-3)
44IGLV4-3n/a
    
    
     
n/achr22 22,871,771V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:17576170, PubMed:20176268). (from UniProt A0A075B6K6)
45ENSG00000224207n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 102,734,485ENSG00000224207 (from geneSymbol)
46RPS15AP24n/a
    
    
     
n/achr8 30,117,581ribosomal protein S15a pseudogene 24 (from HGNC RPS15AP24)
47NARF-AS1n/a
    
    
     
n/achr17 82,477,260NARF antisense RNA 1 (from HGNC NARF-AS1)
48ENSG00000267895n/a
    
    
     
n/achr19 51,144,011ENSG00000267895 (from geneSymbol)
49PLEKHA3P1n/a
    
    
     
n/achr19 41,521,516pleckstrin homology domain containing A3 pseudogene 1 (from HGNC PLEKHA3P1)
50OR2B6n/a
    
    
     
n/achr6 27,957,711olfactory receptor family 2 subfamily B member 6 (from RefSeq NM_012367.1)