UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1RPSAP22n/a
    
    
     
n/achr2 85,491,355ribosomal protein SA pseudogene 22 (from HGNC RPSAP22)
2ENSG00000236332n/a
    
    
     
n/achr21 27,378,475ENSG00000236332 (from geneSymbol)
3RPL7AP33n/a
    
    
     
n/achr5 173,226,129ribosomal protein L7a pseudogene 33 (from HGNC RPL7AP33)
4IGLV3-22n/a
    
    
     
n/achr22 22,704,543V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:17576170, PubMed:20176268). (from UniProt A0A075B6J6)
5ASH2LP1n/a
    
    
     
n/achr22 22,420,818ASH2 like histone lysine methyltransferase complex subunit pseudogene 1 (from HGNC ASH2LP1)
6ENSG00000257737n/a
    
    
     
n/achr12 103,656,387ENSG00000257737 (from geneSymbol)
7TRGVAn/a
    
    
     
n/achr7 38,322,588T cell receptor gamma variable A (pseudogene) (from HGNC TRGVA)
8ITGADn/a
    
    
     
n/achr16 31,409,920integrin subunit alpha D, transcript variant 2 (from RefSeq NM_005353.3)
9ENSG00000260757n/a
    
    
     
n/achr16 31,403,632ENSG00000260757 (from geneSymbol)
10IGKV1D-43n/a
    
    
     
n/achr2 90,210,201V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0B4J1Z2)
11OR5AO1Pn/a
    
    
     
n/achr11 57,045,240olfactory receptor family 5 subfamily AO member 1 pseudogene (from HGNC OR5AO1P)
12ENSG00000254975n/a
    
    
     
n/achr11 76,689,137ENSG00000254975 (from geneSymbol)
13ENSG00000200235n/a
    
    
     
n/achr5 140,579,729ENSG00000200235 (from geneSymbol)
14RNA5SP357n/a
    
    
     
n/achr12 34,205,758RNA, 5S ribosomal pseudogene 357 (from HGNC RNA5SP357)
15H3P36n/a
    
    
     
n/achr13 71,675,268H3P36 (from geneSymbol)
16EIF4A1P1n/a
    
    
     
n/achr21 27,367,480eukaryotic translation initiation factor 4A1 pseudogene 1 (from HGNC EIF4A1P1)
17LINC02260n/a
    
    
     
n/achr4 54,605,171long intergenic non-protein coding RNA 2260 (from RefSeq NR_134657.1)
18ENSG00000255860n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 72,175,204ENSG00000255860 (from geneSymbol)
19RN7SL634Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 104,013,787RNA, 7SL, cytoplasmic 634, pseudogene (from HGNC RN7SL634P)
20ENSG00000245688n/a
    
    
     
n/achr5 178,440,887ENSG00000245688 (from geneSymbol)
21U3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 114,005,547U3 (from geneSymbol)
22ENSG00000269385n/a
    
    
     
n/achr19 6,898,492ENSG00000269385 (from geneSymbol)
23IGKV2OR2-2n/a
    
    
     
n/achr2 97,050,878immunoglobulin kappa variable 2/OR2-2 (pseudogene) (from HGNC IGKV2OR2-2)
24IGLV3-24n/a
    
    
     
n/achr22 22,694,695immunoglobulin lambda variable 3-24 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-24)
25SCUBE1-AS1n/a
    
    
     
n/achr22 43,279,892SCUBE1 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_134582.1)
26ENSG00000251459n/a
    
    
     
n/achr4 57,493,188ENSG00000251459 (from geneSymbol)
27IGKV2-4n/a
    
    
     
n/achr2 88,932,023immunoglobulin kappa variable 2-4 (pseudogene) (from HGNC IGKV2-4)
28IGLV11-55n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 22,201,912Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin light chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A075B6I3)
29MYO5BP3n/a
    
    
     
n/achr9 63,762,185myosin VB pseudogene 3 (from HGNC MYO5BP3)
30IGHV3-38n/a
    
    
     
n/achr14 106,410,757Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin heavy chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0C4DH36)
31ENSG00000247372n/a
    
    
     
n/achr5 75,328,534ENSG00000247372 (from geneSymbol)
32ARL8BP2n/a
    
    
     
n/achr1 28,120,885ARL8BP2 (from geneSymbol)
33SCN10An/a
    
    
     
n/achr3 38,756,512sodium voltage-gated channel alpha subunit 10, transcript variant 1 (from RefSeq NM_006514.4)
34LINC02755n/a
    
    
     
n/achr11 29,662,603LINC02755 (from geneSymbol)
35PHKA1-AS1n/a
    
    
     
n/achrX 72,700,649PHKA1 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_110391.1)
36ENSG00000236957n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 157,927,463ENSG00000236957 (from geneSymbol)
37RN7SL28Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 184,279,084RNA, 7SL, cytoplasmic 28, pseudogene (from HGNC RN7SL28P)
38SOCS2P2n/a
    
    
     
n/achr22 22,171,269suppressor of cytokine signaling 2 pseudogene 2 (from HGNC SOCS2P2)
39TRBV21-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,637,154T cell receptor beta variable 21-1 (pseudogene) (from HGNC TRBV21-1)
40ENSG00000205745n/a
    
    
     
n/achr7 36,082,410ENSG00000205745 (from geneSymbol)
41HBZP1n/a
    
    
     
n/achr16 164,139hemoglobin subunit zeta pseudogene 1 (from HGNC HBZP1)
42MTCO2P33n/a
    
    
     
n/achr6 24,948,112mitochondrially encoded cytochrome c oxidase II pseudogene 33 (from HGNC MTCO2P33)
43ENSG00000227710n/a
    
    
     
n/achr22 22,168,461ENSG00000227710 (from geneSymbol)
44GOLGA5P1n/a
    
    
     
n/achr5 39,169,772golgin A5 pseudogene 1 (from HGNC GOLGA5P1)
45LINC00485n/a
    
    
     
n/achr12 102,816,839long intergenic non-protein coding RNA 485 (from RefSeq NR_033855.1)
46IGLVIV-66-1n/a
    
    
     
n/achr22 22,058,662immunoglobulin lambda variable (IV)-66-1 (pseudogene) (from HGNC IGLVIV-66-1)
47ANKRD62P1n/a
    
    
     
n/achr22 16,675,291ankyrin repeat domain 62 pseudogene 1 (from HGNC ANKRD62P1)
48ENSG00000259962n/a
    
    
     
n/achr16 53,362,848ENSG00000259962 (from geneSymbol)
49SIGLEC18Pn/a
    
    
     
n/achr19 51,121,476sialic acid binding Ig like lectin 18, pseudogene (from HGNC SIGLEC18P)
50TAF11L2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 17,498,529TATA-box binding protein associated factor 11 like 2 (from RefSeq NM_001401696.1)