UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1PEBP1P3n/a
    
    
     
n/achr1 198,679,586phosphatidylethanolamine binding protein 1 pseudogene 3 (from HGNC PEBP1P3)
2ENSG00000253269n/a
    
    
     
n/achr5 169,776,165ENSG00000253269 (from geneSymbol)
3SSX6Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 48,114,805SSX6P (from geneSymbol)
4ENSG00000291285n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 48,111,151ENSG00000291285 (from geneSymbol)
5BNIP3P41n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 49,839BCL2 interacting protein 3 pseudogene 41 (from HGNC BNIP3P41)
6ENSG00000292991n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 49,526ENSG00000292991 (from geneSymbol)
7ENSG00000260303n/a
    
    
     
n/achr4 146,054,683ENSG00000260303 (from geneSymbol)
8CR1-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 207,588,261CR1-AS1 (from geneSymbol)
9ANTXRLP1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 46,253,721anthrax toxin receptor-like pseudogene 1 (from HGNC ANTXRLP1)
10TRBV21-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,637,154T cell receptor beta variable 21-1 (pseudogene) (from HGNC TRBV21-1)
11ENSG00000255229n/a
    
    
     
n/achr11 157,707ENSG00000255229 (from geneSymbol)
12ENSG00000236452n/a
    
    
     
n/achr3 34,236,027ENSG00000236452 (from geneSymbol)
13LINC00544n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 29,943,196long intergenic non-protein coding RNA 544 (from RefSeq NR_033889.1)
14RRN3P4n/a
    
    
     
n/achr2 142,855,046RRN3P4 (from geneSymbol)
15TRDV2n/a
    
    
     
n/achr14 22,422,706V region of the variable domain of T cell receptor (TR) delta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:28920588, PubMed:23348415). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0JD36)
16ENSG00000226952n/a
    
    
     
n/achr1 100,099,364ENSG00000226952 (from geneSymbol)
17ENSG00000258993n/a
    
    
     
n/achr14 53,023,326ENSG00000258993 (from geneSymbol)
18NENFP2n/a
    
    
     
n/achr12 101,964,120neudesin neurotrophic factor pseudogene 2 (from HGNC NENFP2)
19ENSG00000235880n/a
    
    
     
n/achr9 270,484ENSG00000235880 (from geneSymbol)
20KAZN-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 14,379,399KAZN antisense RNA 1 (from HGNC KAZN-AS1)
21MIR371Bn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 53,787,709microRNA 371b (from RefSeq NR_039909.1)
22ENSG00000261293n/a
    
    
     
n/achr16 12,094,467ENSG00000261293 (from geneSymbol)
23LINC02548n/a
    
    
     
n/achr11 13,816,009long intergenic non-protein coding RNA 2548 (from HGNC LINC02548)
24ELOCP29n/a
    
    
     
n/achr19 9,182,708elongin C pseudogene 29 (from HGNC ELOCP29)
25ENSG00000225122n/a
    
    
     
n/achr1 163,422,784ENSG00000225122 (from geneSymbol)
26PDE4B-AS1n/a
    
    
     
n/achr1 66,046,609PDE4B antisense RNA 1 (from RefSeq NR_123718.1)
27OR9H1Pn/a
    
    
     
n/achr1 247,774,846olfactory receptor family 9 subfamily H member 1 pseudogene (from RefSeq NR_172917.1)
28WEE1P2n/a
    
    
     
n/achr17 22,705,050WEE1P2 (from geneSymbol)
29DBIP2n/a
    
    
     
n/achr5 80,603,513diazepam binding inhibitor, acyl-CoA binding protein pseudogene 2 (from HGNC DBIP2)
30ENSG00000230803n/a
    
    
     
n/achr2 132,290,086ENSG00000230803 (from geneSymbol)
31ENSG00000223660n/a
    
    
     
n/achr19 54,199,712ENSG00000223660 (from geneSymbol)
32SPECC1P1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 15,869,000SPECC1P1 (from geneSymbol)
33SDR16C6Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 56,384,214short chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, pseudogene (from HGNC SDR16C6P)
34SDR16C6Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 56,382,788short chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, pseudogene (from RefSeq NR_103832.1)
35ENSG00000229345n/a
    
    
     
n/achr9 95,602,882ENSG00000229345 (from geneSymbol)
36EEF1B2P8n/a
    
    
     
n/achr3 175,059,696eukaryotic translation elongation factor 1 beta 2 pseudogene 8 (from HGNC EEF1B2P8)
37SRSF3P6n/a
    
    
     
n/achr2 109,732,933SRSF3P6 (from geneSymbol)
38PGBD4P1n/a
    
    
     
n/achr7 142,722,561piggyBac transposable element derived 4 pseudogene 1 (from HGNC PGBD4P1)
39RAD54L2P1n/a
    
    
     
n/achr19 22,610,103RAD54L2P1 (from geneSymbol)
40OR2J2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 29,173,359olfactory receptor family 2 subfamily J member 2 (from RefSeq NM_030905.3)
41ENSG00000218713n/a
    
    
     
n/achr6 53,207,647ENSG00000218713 (from geneSymbol)
42HNRNPFP1n/a
    
    
     
n/achr1 42,041,163heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F pseudogene 1 (from HGNC HNRNPFP1)
43POTEB2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 20,850,843POTE ankyrin domain family member B2, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001277303.1)
44ENSG00000227531n/a
    
    
     
n/achr9 111,212,041ENSG00000227531 (from geneSymbol)
45ENSG00000236118n/a
    
    
     
n/achr22 22,155,762ENSG00000236118 (from geneSymbol)
46ENSG00000241505n/a
    
    
     
n/achr1 190,487,338ENSG00000241505 (from geneSymbol)
47ENSG00000249259n/a
    
    
     
n/achr4 116,096,088ENSG00000249259 (from geneSymbol)
48ZNF474-AS1n/a
    
    
     
n/achr5 122,155,255ZNF474-AS1 (from geneSymbol)
49OR5AC4Pn/a
    
    
     
n/achr3 98,105,213olfactory receptor family 5 subfamily AC member 4 pseudogene (from HGNC OR5AC4P)
50ENSG00000265484n/a
    
    
     
n/achr18 71,226,388uncharacterized LOC105372187 (from RefSeq NR_188047.1)