UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ENSG00000227479n/a
    
    
     
n/achr2 240,241,797ENSG00000227479 (from geneSymbol)
2ENSG00000248802n/a
    
    
     
n/achr4 128,592,199ENSG00000248802 (from geneSymbol)
3RNY1P6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr13 51,586,478RNA, Ro-associated Y1 pseudogene 6 (from HGNC RNY1P6)
4ENSG00000236744n/a
    
    
     
n/achr10 55,422,494ENSG00000236744 (from geneSymbol)
5RPL13AP13n/a
    
    
     
n/achr5 53,206,868ribosomal protein L13a pseudogene 13 (from HGNC RPL13AP13)
6ENSG00000229976n/a
    
    
     
n/achr20 39,785,566ENSG00000229976 (from geneSymbol)
7ENSG00000199959n/a
    
    
     
n/achr1 84,277,389ENSG00000199959 (from geneSymbol)
8NDUFB5P1n/a
    
    
     
n/achr4 180,573,745NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B5 pseudogene 1 (from HGNC NDUFB5P1)
9ENSG00000248515n/a
    
    
     
n/achr4 19,682,564ENSG00000248515 (from geneSymbol)
10ENSG00000269043n/a
    
    
     
n/achr19 20,522,040ENSG00000269043 (from geneSymbol)
11LINC02755n/a
    
    
     
n/achr11 29,662,603LINC02755 (from geneSymbol)
12RNU6-481Pn/a
    
    
     
n/achr1 161,401,342RNA, U6 small nuclear 481, pseudogene (from HGNC RNU6-481P)
13ENSG00000288093n/a
    
    
     
n/achr1 161,400,933ENSG00000288093 (from geneSymbol)
14DDX18P3n/a
    
    
     
n/achr6 18,364,420DEAD-box helicase 18 pseudogene 3 (from HGNC DDX18P3)
15Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr8 97,772,369Y_RNA (from geneSymbol)
16TMEM212n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 171,851,333transmembrane protein 212 (from RefSeq NM_001164436.2)
17ENSG00000238054n/a
    
    
     
n/achr1 188,879,011ENSG00000238054 (from geneSymbol)
18ENSG00000254383n/a
    
    
     
n/achr8 40,900,935ENSG00000254383 (from geneSymbol)
19ENSG00000264825n/a
    
    
     
n/achr18 22,220,903ENSG00000264825 (from geneSymbol)
20TRBV6-7n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 471,654Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) beta chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0A0MS04)
21RPL36P3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 72,929,771ribosomal protein L36 pseudogene 3 (from HGNC RPL36P3)
22LINC00485n/a
    
    
     
n/achr12 102,816,839long intergenic non-protein coding RNA 485 (from RefSeq NR_033855.1)
23GGTLC3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 18,517,252gamma-glutamyltransferase light chain family member 3 (from RefSeq NM_001355479.1)
24ENSG00000258829n/a
    
    
     
n/achr14 79,073,447ENSG00000258829 (from geneSymbol)
25MIR4263n/a
    
    
     
n/achr2 27,996,408microRNA 4263 (from RefSeq NR_036230.1)
26RPL21P76n/a
    
    
     
n/achr7 158,719,945ribosomal protein L21 pseudogene 76 (from HGNC RPL21P76)
27ENSG00000249417n/a
    
    
     
n/achr3 141,317,245ENSG00000249417 (from geneSymbol)
28ENSG00000232762n/a
    
    
     
n/achr1 53,305,999ENSG00000232762 (from geneSymbol)
29ENSG00000225218n/a
    
    
     
n/achr21 42,833,758ENSG00000225218 (from geneSymbol)
30RN7SKP272n/a
    
    
     
n/achr1 89,987,828RNA, 7SK small nuclear pseudogene 272 (from HGNC RN7SKP272)
31RPL36AP46n/a
    
    
     
n/achr17 60,727,323ribosomal protein L36a pseudogene 46 (from HGNC RPL36AP46)
32DPPA3P2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 36,371,650developmental pluripotency associated 3 pseudogene 2 (from HGNC DPPA3P2)
33RPL31P57n/a
    
    
     
n/achr17 64,308,503ribosomal protein L31 pseudogene 57 (from HGNC RPL31P57)
34UQCRBP2n/a
    
    
     
n/achr1 162,541,480ubiquinol-cytochrome c reductase binding protein pseudogene 2 (from HGNC UQCRBP2)
35FAM224An/a
    
    
     
n/achrY 18,339,731family with sequence similarity 224 member A (non-protein coding) (from HGNC FAM224A)
36AGBL4-IT1n/a
    
    
     
n/achr1 49,423,143AGBL4 intronic transcript 1 (from RefSeq NR_046839.1)
37NOTCH2P1n/a
    
    
     
n/achr1 119,886,615notch 2 pseudogene 1 (from HGNC NOTCH2P1)
38IRX1P1n/a
    
    
     
n/achr13 24,744,430iroquois homeobox 1 pseudogene 1 (from HGNC IRX1P1)
39ENSG00000251413n/a
    
    
     
n/achr10 48,624,548ENSG00000251413 (from geneSymbol)
40RNU6-36Pn/a
    
    
     
n/achr12 97,721,769RNA, U6 small nuclear 36, pseudogene (from HGNC RNU6-36P)
41ENSG00000217139n/a
    
    
     
n/achr6 121,683,598ENSG00000217139 (from geneSymbol)
42RN7SKP68n/a
    
    
     
n/achr5 102,302,657RNA, 7SK small nuclear pseudogene 68 (from HGNC RN7SKP68)
43ENSG00000223492n/a
    
    
     
n/achr20 53,174,096ENSG00000223492 (from geneSymbol)
44ENSG00000226566n/a
    
    
     
n/achr9 103,395,922ENSG00000226566 (from geneSymbol)
45KRT18P1n/a
    
    
     
n/achr6 28,969,795keratin 18 pseudogene 1 (from HGNC KRT18P1)
46GNA14-AS1n/a
    
    
     
n/achr9 77,491,496GNA14 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_121184.1)
47TEDDM2Pn/a
    
    
     
n/achr1 182,441,969transmembrane epididymal protein 2, pseudogene (from HGNC TEDDM2P)
48ENSG00000234894n/a
    
    
     
n/achr13 19,151,930ENSG00000234894 (from geneSymbol)
49ENSG00000241667n/a
    
    
     
n/achr3 69,592,231ENSG00000241667 (from geneSymbol)
50TSEN2P1n/a
    
    
     
n/achr4 175,495,307tRNA splicing endonuclease subunit 2 pseudogene 1 (from HGNC TSEN2P1)