UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1RN7SL494Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 50,244,779RNA, 7SL, cytoplasmic 494, pseudogene (from HGNC RN7SL494P)
2ENSG00000227307n/a
    
    
     
n/achr10 120,953,123ENSG00000227307 (from geneSymbol)
3ATP5MGP7n/a
    
    
     
n/achr17 42,647,988ATP synthase membrane subunit g pseudogene 7 (from HGNC ATP5MGP7)
4RNU1-38Pn/a
    
    
     
n/achr2 85,728,265RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene (from HGNC RNU1-38P)
5ENSG00000236168n/a
    
    
     
n/achr20 23,980,659ENSG00000236168 (from geneSymbol)
6PTHn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 13,494,025parathyroid hormone, transcript variant 1 (from RefSeq NM_000315.4)
7RN7SKP18n/a
    
    
     
n/achr6 117,299,501RNA, 7SK small nuclear pseudogene 18 (from HGNC RN7SKP18)
8ENSG00000257604n/a
    
    
     
n/achr12 79,500,403ENSG00000257604 (from geneSymbol)
9ENSG00000264236n/a
    
    
     
n/achr18 68,993,046ENSG00000264236 (from geneSymbol)
10ENSG00000261627n/a
    
    
     
n/achr18 6,642,224ENSG00000261627 (from geneSymbol)
11BRWD1P3n/a
    
    
     
n/achr7 17,033,283bromodomain and WD repeat domain containing 1 pseudogene 3 (from HGNC BRWD1P3)
12RN7SL865Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 115,717,869RNA, 7SL, cytoplasmic 865, pseudogene (from HGNC RN7SL865P)
13RN7SL246Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 45,874,182RNA, 7SL, cytoplasmic 246, pseudogene (from HGNC RN7SL246P)
14APOOP2n/a
    
    
     
n/achr3 87,595,107apolipoprotein O pseudogene 2 (from HGNC APOOP2)
15ENSG00000268209n/a
    
    
     
n/achr4 69,387,943ENSG00000268209 (from geneSymbol)
16ENSG00000282610n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7_KI270803v1_alt 511,206V region of the variable domain of T cell receptor (TR) beta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0J9YX75)
17SDHCP1n/a
    
    
     
n/achr18 68,866,772succinate dehydrogenase complex subunit C pseudogene 1 (from HGNC SDHCP1)
18OR6K3n/a
    
    
     
n/achr1 158,718,523olfactory receptor family 6 subfamily K member 3 (from RefSeq NM_001005327.3)
19ENSG00000273877n/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 153,228,008ENSG00000273877 (from geneSymbol)
20SPINT4n/a
    
    
     
n/achr20 45,724,088serine peptidase inhibitor, Kunitz type 4 (from RefSeq NM_178455.3)
21AKIRIN1P1n/a
    
    
     
n/achr12 80,561,288akirin 1 pseudogene 1 (from HGNC AKIRIN1P1)
22OR1L1n/a
    
    
     
n/achr9 122,662,182olfactory receptor family 1 subfamily L member 1 (from RefSeq NM_001005236.3)
23DEFB130Cn/a
    
    
     
n/achr11 71,859,965defensin beta 130C (pseudogene) (from HGNC DEFB130C)
24BNIP3P45n/a
    
    
     
n/achr2 61,250,200BNIP3P45 (from geneSymbol)
25ENSG00000290736n/a
    
    
     
n/achr11 71,859,967ENSG00000290736 (from geneSymbol)
26RN7SL220Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr10 68,007,867RNA, 7SL, cytoplasmic 220, pseudogene (from HGNC RN7SL220P)
27RN7SL827Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 73,487,733RNA, 7SL, cytoplasmic 827, pseudogene (from HGNC RN7SL827P)
28RBMX2P3n/a
    
    
     
n/achr1 119,085,476RNA binding motif protein, X-linked 2 pseudogene 3 (from HGNC RBMX2P3)
29HIGD2AP2n/a
    
    
     
n/achr3 47,663,780HIGD2AP2 (from geneSymbol)
30KCTD9P5n/a
    
    
     
n/achr5 37,506,272potassium channel tetramerization domain containing 9 pseudogene 5 (from HGNC KCTD9P5)
31ATG10-AS1n/a
    
    
     
n/achr5 82,073,378ATG10 antisense RNA 1 (from HGNC ATG10-AS1)
32ENSG00000269635n/a
    
    
     
n/achr19 15,221,656ENSG00000269635 (from geneSymbol)
33ENSG00000251691n/a
    
    
     
n/achr4 69,306,821ENSG00000251691 (from geneSymbol)
34SUMO2P16n/a
    
    
     
n/achr8 31,131,670SUMO2 pseudogene 16 (from HGNC SUMO2P16)
35ENSG00000254972n/a
    
    
     
n/achr11 71,703,336ENSG00000254972 (from geneSymbol)
36ENSG00000255780n/a
    
    
     
n/achr12 64,032,538ENSG00000255780 (from geneSymbol)
37ENSG00000251648n/a
    
    
     
n/achr5 65,733,313ENSG00000251648 (from geneSymbol)
38ENSG00000270549n/a
    
    
     
n/achr1 62,530,754ENSG00000270549 (from geneSymbol)
39RPS18P8n/a
    
    
     
n/achr6 4,979,283ribosomal protein S18 pseudogene 8 (from HGNC RPS18P8)
40PDHA1P1n/a
    
    
     
n/achr3 57,800,752pyruvate dehydrogenase alpha 1 pseudogene 1 (from HGNC PDHA1P1)
41MTATP6P15n/a
    
    
     
n/achr11 103,403,005mitochondrially encoded ATP synthase 6 pseudogene 15 (from HGNC MTATP6P15)
42NPM1P3n/a
    
    
     
n/achr16 5,366,242nucleophosmin 1 pseudogene 3 (from HGNC NPM1P3)
43NOP56P2n/a
    
    
     
n/achr9 23,682,278NOP56 ribonucleoprotein pseudogene 2 (from HGNC NOP56P2)
44DNAJC8P4n/a
    
    
     
n/achr1 28,453,737DNAJC8P4 (from geneSymbol)
45CHCHD2P11n/a
    
    
     
n/achr13 42,181,693coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2 pseudogene 11 (from HGNC CHCHD2P11)
46OR2M5n/a
    
    
     
n/achr1 248,145,617olfactory receptor family 2 subfamily M member 5 (from RefSeq NM_001004690.1)
47OR5AS1n/a
    
    
     
n/achr11 56,032,922olfactory receptor family 5 subfamily AS member 1 (from RefSeq NM_001001921.2)
48ENSG00000233710n/a
    
    
     
n/achrX 67,533,575ENSG00000233710 (from geneSymbol)
49OR4F28Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 101,876,432olfactory receptor family 4 subfamily F member 28 pseudogene (from HGNC OR4F28P)
50ENSG00000267240n/a
    
    
     
n/achr19 28,962,724ENSG00000267240 (from geneSymbol)