UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1PRKAG2-AS2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr7 151,808,655PRKAG2 antisense RNA 2 (from RefSeq NR_171033.1)
2LINC02294n/a
    
    
     
n/achr14 26,798,801long intergenic non-protein coding RNA 2294 (from RefSeq NR_110033.1)
3FCAMRn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 206,964,213Fc alpha and mu receptor, transcript variant 3 (from RefSeq NM_001170631.2)
4LINC02274n/a
    
    
     
n/achr14 73,826,347long intergenic non-protein coding RNA 2274 (from RefSeq NR_135238.1)
5SULT1C5Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 108,327,355SULT1C5P (from geneSymbol)
6SULT1C5Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 108,338,018sulfotransferase family 1C member 5, pseudogene (from RefSeq NR_037191.1)
7PDZK1P1n/a
    
    
     
n/achr1 148,001,946PDZ domain containing 1 pseudogene 1 (from HGNC PDZK1P1)
8ENSG00000248635n/a
    
    
     
n/achr4 68,708,549ENSG00000248635 (from geneSymbol)
9CTSL3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 87,773,376cathepsin L family member 3, pseudogene (from HGNC CTSL3P)
10CTSL3Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr9 87,779,899cathepsin L family member 3, pseudogene (from RefSeq NR_027917.1)
11ENSG00000251599n/a
    
    
     
n/achr5 73,141,300uncharacterized LOC105379030 (from RefSeq NR_134252.1)
12LINC02303n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 45,711,112long intergenic non-protein coding RNA 2303, transcript variant 1 (from RefSeq NR_146546.1)
13LINC01762n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 116,451,266long intergenic non-protein coding RNA 1762, transcript variant 1 (from RefSeq NR_125972.1)
14ENSG00000224417n/a
    
    
     
n/achr6 168,300,091ENSG00000224417 (from geneSymbol)
15TMEM252-DTn/a
    
    
     
n/achr9 68,592,739TMEM252 divergent transcript (from RefSeq NR_187592.1)
16ENSG00000230118n/a
    
    
     
n/achr2 30,746,572ENSG00000230118 (from geneSymbol)
17SLC6A18n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 1,235,785solute carrier family 6 member 18 (from RefSeq NM_182632.3)
18ENSG00000248763n/a
    
    
     
n/achr4 69,068,141ENSG00000248763 (from geneSymbol)
19ENSG00000257035n/a
    
    
     
n/achr12 127,625,210ENSG00000257035 (from geneSymbol)
20LINC01788n/a
    
    
     
n/achr1 70,746,460long intergenic non-protein coding RNA 1788 (from RefSeq NR_125938.1)
21ENSG00000257241n/a
    
    
     
n/achr12 69,946,812ENSG00000257241 (from geneSymbol)
22NCOA7-AS1n/a
    
    
     
n/achr6 125,808,357NCOA7 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_126386.1)
23UBE2V2P1n/a
    
    
     
n/achr10 19,051,812ubiquitin conjugating enzyme E2 V2 pseudogene 1 (from HGNC UBE2V2P1)
24ENSG00000226733n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 50,137,311ENSG00000226733 (from geneSymbol)
25TRAV30n/a
    
    
     
n/achr14 22,168,708V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A087WSZ9)
26LINC00974n/a
    
    
     
n/achr17 41,552,050long intergenic non-protein coding RNA 974 (from RefSeq NR_038442.1)
27LINC02938n/a
    
    
     
n/achr13 44,248,883LINC02938 (from geneSymbol)
28HAVCR1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 157,044,264hepatitis A virus cellular receptor 1, transcript variant 3 (from RefSeq NM_001173393.3)
29LINC02041n/a
    
    
     
n/achr3 187,449,147long intergenic non-protein coding RNA 2041 (from HGNC LINC02041)
30ENSG00000250376n/a
    
    
     
n/achr4 68,786,046ENSG00000250376 (from geneSymbol)
31LINC01648n/a
    
    
     
n/achr1 30,025,782long intergenic non-protein coding RNA 1648 (from RefSeq NR_110790.1)
32LINC01593n/a
    
    
     
n/achr2 108,050,977long intergenic non-protein coding RNA 1593 (from RefSeq NR_135071.1)
33RNU1-14Pn/a
    
    
     
n/achr7 53,366,133RNA, U1 small nuclear 14, pseudogene (from HGNC RNU1-14P)
34ENSG00000225457n/a
    
    
     
n/achr7 113,123,351ENSG00000225457 (from geneSymbol)
35SLC22A24n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 63,112,080solute carrier family 22 member 24, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001136506.2)
36ENSG00000196893n/a
    
    
     
n/achr17 18,952,887ENSG00000196893 (from geneSymbol)
37ENSG00000250781n/a
    
    
     
n/achr4 42,336,531ENSG00000250781 (from geneSymbol)
38BASP1P1n/a
    
    
     
n/achr13 22,897,673brain abundant, membrane attached signal protein 1 pseudogene 1 (from HGNC BASP1P1)
39HMGN1P17n/a
    
    
     
n/achr5 56,381,928high mobility group nucleosome binding domain 1 pseudogene 17 (from HGNC HMGN1P17)
40ENSG00000223728n/a
    
    
     
n/achr1 147,841,660ENSG00000223728 (from geneSymbol)
41RPL7AP52n/a
    
    
     
n/achr10 94,882,948ribosomal protein L7a pseudogene 52 (from HGNC RPL7AP52)
42ACSM5P1n/a
    
    
     
n/achr16 20,596,828acyl-CoA synthetase medium chain family member 5 pseudogene 1 (from HGNC ACSM5P1)
43LIPC-AS1n/a
    
    
     
n/achr15 58,466,812LIPC antisense RNA 1 (from RefSeq NR_120338.1)
44CLYBL-AS2n/a
    
    
     
n/achr13 99,690,526CLYBL antisense RNA 2 (from RefSeq NR_046526.1)
45ENSG00000267624n/a
    
    
     
n/achr17 78,211,763ENSG00000267624 (from geneSymbol)
46UGT2B26Pn/a
    
    
     
n/achr4 69,036,204UDP glucuronosyltransferase family 2 member B26, pseudogene (from HGNC UGT2B26P)
47HMGB3P27n/a
    
    
     
n/achr17 42,648,458high mobility group box 3 pseudogene 27 (from HGNC HMGB3P27)
48ENSG00000254246n/a
    
    
     
n/achr5 157,109,844ENSG00000254246 (from geneSymbol)
49RNA5SP434n/a
    
    
     
n/achr17 4,056,816RNA, 5S ribosomal pseudogene 434 (from HGNC RNA5SP434)
50ENSG00000250979n/a
    
    
     
n/achr8 72,227,158transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 pseudogene (from RefSeq NR_033867.2)