UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1RPL21P94n/a
    
    
     
n/achr11 6,686,130ribosomal protein L21 pseudogene 94 (from HGNC RPL21P94)
2ENSG00000267359n/a
    
    
     
n/achr17 35,553,986uncharacterized LOC107985033, transcript variant 2 (from RefSeq NR_138032.1)
3PLCB2-AS1n/a
    
    
     
n/achr15 40,301,245PLCB2 antisense RNA 1 (from HGNC PLCB2-AS1)
4LINC02390n/a
    
    
     
n/achr12 9,706,713long intergenic non-protein coding RNA 2390 (from HGNC LINC02390)
5KLRC4-KLRK1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 10,391,227Membrane ; Single-  pass type II membrane protein (from UniProt H3BQV0)
6ENSG00000243304n/a
    
    
     
n/achr5 115,265,066ENSG00000243304 (from geneSymbol)
7ENSG00000270802n/a
    
    
     
n/achr19 15,339,092ENSG00000270802 (from geneSymbol)
8ENSG00000262488n/a
    
    
     
n/achr16 10,840,964ENSG00000262488 (from geneSymbol)
9ENSG00000241490n/a
    
    
     
n/achr3 114,225,297ENSG00000241490 (from geneSymbol)
10TRPM2-ASn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr21 44,419,930TRPM2 antisense RNA (from RefSeq NR_109964.1)
11EEF1E1P1n/a
    
    
     
n/achr2 111,888,327eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon 1 pseudogene 1 (from HGNC EEF1E1P1)
12TRAPPC3Ln/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 116,520,336trafficking protein particle complex subunit 3L (from RefSeq NM_001139444.3)
13ENSG00000261588n/a
    
    
     
n/achr16 30,587,791ENSG00000261588 (from geneSymbol)
14TNIP3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 121,147,864TNFAIP3 interacting protein 3, transcript variant 1 (from RefSeq NM_024873.6)
15CDC6n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 40,296,268cell division cycle 6 (from RefSeq NM_001254.4)
16HSPB1P2n/a
    
    
     
n/achrX 49,234,228heat shock protein family B (small) member 1 pseudogene 2 (from HGNC HSPB1P2)
17IGLC5n/a
    
    
     
n/achr22 22,915,781immunoglobulin lambda constant 5 (pseudogene) (from HGNC IGLC5)
18ENSG00000226571n/a
    
    
     
n/achr6 139,389,480ENSG00000226571 (from geneSymbol)
19ENSG00000262319n/a
    
    
     
n/achr17 19,142,353ENSG00000262319 (from geneSymbol)
20TRBV23-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,646,214Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) beta chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0A0MS06)
21IL9RP3n/a
    
    
     
n/achr16 33,828interleukin 9 receptor pseudogene 3 (from HGNC IL9RP3)
22TGFBRAP1-AS1n/a
    
    
     
n/achr2 105,327,369TGFBRAP1-AS1 (from geneSymbol)
23IGLV4-3n/a
    
    
     
n/achr22 22,871,771V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:17576170, PubMed:20176268). (from UniProt A0A075B6K6)
24RN7SL32Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 233,205,339RNA, 7SL, cytoplasmic 32, pseudogene (from HGNC RN7SL32P)
25HMGN2P40n/a
    
    
     
n/achr15 68,254,744high mobility group nucleosomal binding domain 2 pseudogene 40 (from HGNC HMGN2P40)
26FTH1P22n/a
    
    
     
n/achr1 116,775,363ferritin heavy chain 1 pseudogene 22 (from HGNC FTH1P22)
27E2F3P1n/a
    
    
     
n/achr17 35,490,623E2F transcription factor 3 pseudogene 1 (from HGNC E2F3P1)
28ENSG00000272472n/a
    
    
     
n/achr6 122,644,079ENSG00000272472 (from geneSymbol)
29SUB1P3n/a
    
    
     
n/achr16 4,562,971SUB1 homolog, transcriptional regulator pseudogene 3 (from HGNC SUB1P3)
30LIX1-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 97,263,146LIX1 and RIOK2 antisense RNA 1 (from HGNC LIX1-AS1)
31ENSG00000235419n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 230,550,300ENSG00000235419 (from geneSymbol)
32ADAMTS7P4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 85,263,130ADAMTS7 pseudogene 4 (from HGNC ADAMTS7P4)
33ENSG00000291212n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 85,300,266ENSG00000291212 (from geneSymbol)
34TRGV8n/a
    
    
     
n/achr7 38,330,639V region of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0C4DH27)
35ENSG00000224478n/a
    
    
     
n/achr6 159,110,289ENSG00000224478 (from geneSymbol)
36IGLV1-50n/a
    
    
     
n/achr22 22,327,557Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin light chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A075B6I6)
37HNRNPA1P70n/a
    
    
     
n/achr12 68,036,310heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 70 (from HGNC HNRNPA1P70)
38GTF3C6P2n/a
    
    
     
n/achrX 107,131,964GTF3C6P2 (from geneSymbol)
39NT5C3AP2n/a
    
    
     
n/achr3 111,634,380NT5C3AP2 (from geneSymbol)
40RPS3AP43n/a
    
    
     
n/achr12 8,359,444ribosomal protein S3a pseudogene 43 (from HGNC RPS3AP43)
41ENSG00000272839n/a
    
    
     
n/achr7 157,868,846ENSG00000272839 (from geneSymbol)
42IGLJ2n/a
    
    
     
n/achr22 22,899,568immunoglobulin lambda joining 2 (from HGNC IGLJ2)
43ENSG00000255621n/a
    
    
     
n/achr12 13,020,565ENSG00000255621 (from geneSymbol)
44HTR7P1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 13,002,6255-hydroxytryptamine receptor 7 pseudogene 1 (from RefSeq NR_002774.3)
45USP41Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 20,370,436USP41P (from geneSymbol)
46KRT8P52n/a
    
    
     
n/achr2 202,925,256KRT8P52 (from geneSymbol)
47ENSG00000272908n/a
    
    
     
n/achr7 38,327,856ENSG00000272908 (from geneSymbol)
48ENSG00000234117n/a
    
    
     
n/achr6 116,494,698ENSG00000234117 (from geneSymbol)
49KIAA0895LP1n/a
    
    
     
n/achr18 10,725,777KIAA0895LP1 (from geneSymbol)
50ENSG00000293180n/a
    
    
     
n/achr18 10,727,585ENSG00000293180 (from geneSymbol)