UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1MDS2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 23,611,031myelodysplastic syndrome 2 translocation associated (from HGNC MDS2)
2ENSG00000267214n/a
    
    
     
n/achr19 2,632,401ENSG00000267214 (from geneSymbol)
3IGHEn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 105,599,709Constant region of immunoglobulin heavy chains.  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:17576170, PubMed:20176268). (from UniProt P01854)
4LINC01934n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 181,266,579long intergenic non-protein coding RNA 1934 (from RefSeq NR_130784.1)
5ENSG00000225411n/a
    
    
     
n/achr9 63,808,151ENSG00000225411 (from geneSymbol)
6RPL7AP19n/a
    
    
     
n/achr1 168,543,045ribosomal protein L7a pseudogene 19 (from HGNC RPL7AP19)
7RPL31P11n/a
    
    
     
n/achr1 161,685,023ribosomal protein L31 pseudogene 11 (from HGNC RPL31P11)
8RPL7AP21n/a
    
    
     
n/achr1 168,579,046ribosomal protein L7a pseudogene 21 (from HGNC RPL7AP21)
9ENSG00000255860n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 72,175,204ENSG00000255860 (from geneSymbol)
10ENSG00000262319n/a
    
    
     
n/achr17 19,142,353ENSG00000262319 (from geneSymbol)
11SCAT1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 78,620,016SCAT1 (from geneSymbol)
12MAPK6P5n/a
    
    
     
n/achr8 109,470,624MAPK6P5 (from geneSymbol)
13ENSG00000270190n/a
    
    
     
n/achr2 111,267,170ENSG00000270190 (from geneSymbol)
14SSX20Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achrX 48,215,400SSX20P (from geneSymbol)
15ENSG00000256988n/a
    
    
     
n/achr12 4,817,638ENSG00000256988 (from geneSymbol)
16ENSG00000268289n/a
    
    
     
n/achr19 17,053,540ENSG00000268289 (from geneSymbol)
17TTC4P1n/a
    
    
     
n/achr7 46,000,199tetratricopeptide repeat domain 4 pseudogene 1 (from HGNC TTC4P1)
18RPL4P1n/a
    
    
     
n/achr14 21,750,907ribosomal protein L4 pseudogene 1 (from HGNC RPL4P1)
19ENSG00000225588n/a
    
    
     
n/achr2 107,384,824ENSG00000225588 (from geneSymbol)
20PLEKHA3P1n/a
    
    
     
n/achr19 41,521,516pleckstrin homology domain containing A3 pseudogene 1 (from HGNC PLEKHA3P1)
21RNU6-1069Pn/a
    
    
     
n/achr12 31,803,024RNA, U6 small nuclear 1069, pseudogene (from HGNC RNU6-1069P)
22TRAV36DV7n/a
    
    
     
n/achr14 22,227,000V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A075B6V5)
23CR1-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 207,588,261CR1-AS1 (from geneSymbol)
24ENSG00000236332n/a
    
    
     
n/achr21 27,378,475ENSG00000236332 (from geneSymbol)
25RTEL1P1n/a
    
    
     
n/achr4 112,357,977regulator of telomere elongation helicase 1 pseudogene 1 (from HGNC RTEL1P1)
26ENSG00000293208n/a
    
    
     
n/achr4 112,365,372ENSG00000293208 (from geneSymbol)
27EEF1A1P10n/a
    
    
     
n/achr7 144,647,880eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 pseudogene 10 (from HGNC EEF1A1P10)
28LINC01993n/a
    
    
     
n/achr17 78,269,920long intergenic non-protein coding RNA 1993 (from RefSeq NR_073178.1)
29RPL23AP95n/a
    
    
     
n/achr7 103,152,166ribosomal protein L23a pseudogene 95 (from HGNC RPL23AP95)
30ENSG00000263821n/a
    
    
     
n/achr18 14,979,289ENSG00000263821 (from geneSymbol)
31ENSG00000228650n/a
    
    
     
n/achr5 56,771,551ENSG00000228650 (from geneSymbol)
32ZSCAN5DPn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 56,245,762zinc finger and SCAN domain containing 5D pseudogene (from HGNC ZSCAN5DP)
33TRBV21-1n/a
    
    
     
n/achr7 142,637,154T cell receptor beta variable 21-1 (pseudogene) (from HGNC TRBV21-1)
34POLRMTP1n/a
    
    
     
n/achr17 62,138,805RNA polymerase mitochondrial pseudogene 1 (from HGNC POLRMTP1)
35ITGADn/a
    
    
     
n/achr16 31,409,920integrin subunit alpha D, transcript variant 2 (from RefSeq NM_005353.3)
36CICP6n/a
    
    
     
n/achr3 198,224,903capicua transcriptional repressor pseudogene 6 (from HGNC CICP6)
37TIFABn/a
    
    
     
n/achr5 135,448,288TIFA inhibitor (from RefSeq NM_001099221.2)
38ENSG00000260757n/a
    
    
     
n/achr16 31,403,632ENSG00000260757 (from geneSymbol)
39LINC01684n/a
    
    
     
n/achr21 24,418,852long intergenic non-protein coding RNA 1684 (from HGNC LINC01684)
40ATF4P3n/a
    
    
     
n/achr17 76,226,278activating transcription factor 4 pseudogene 3 (from HGNC ATF4P3)
41RPS27P28n/a
    
    
     
n/achr18 32,779,162ribosomal protein S27 pseudogene 28 (from HGNC RPS27P28)
42ENSG00000248571n/a
    
    
     
n/achr4 152,668,237ENSG00000248571 (from geneSymbol)
43RNU2-6Pn/a
    
    
     
n/achr13 46,374,495RNA, U2 small nuclear 6, pseudogene (from HGNC RNU2-6P)
44SLC25A15P3n/a
    
    
     
n/achr13 24,944,036solute carrier family 25 member 15 pseudogene 3 (from HGNC SLC25A15P3)
45IGLC4n/a
    
    
     
n/achr22 22,910,951immunoglobulin lambda constant 4 (pseudogene) (from HGNC IGLC4)
46ENSG00000249574n/a
    
    
     
n/achr7 381,035uncharacterized LOC442497 (from RefSeq NR_033960.1)
47ENSG00000225365n/a
    
    
     
n/achr7 158,538,687ENSG00000225365 (from geneSymbol)
48TRAV1-1n/a
    
    
     
n/achr14 21,622,202V region of the variable domain of T cell receptor (TR) alpha  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Alpha-beta T cell receptors are antigen specific receptors which are  essential to the immune response and are present on the cell surface of  T lymphocytes. Recognize peptide-major histocompatibility (MH) (pMH)  complexes that are displayed by antigen presenting cells (APC), a  prerequisite for efficient T cell adaptive immunity against pathogens  (PubMed:25493333). Binding of alpha-beta TR to pMH complex initiates  TR-CD3 clustering on the cell surface and intracellular activation of  LCK that phosphorylates the ITAM motifs of CD3G, CD3D, CD3E and CD247  enabling the recruitment of ZAP70. In turn ZAP70 phosphorylates LAT,  which recruits numerous signaling molecules to form the LAT  signalosome. The LAT signalosome propagates signal branching to three  major signaling pathways, the calcium, the mitogen-activated protein  kinase (MAPK) kinase and the nuclear factor NF-kappa-B (NF-kB)  pathways, leading to the mobilization of transcription factors that are  critical for gene expression and essential for T cell growth and  differentiation (PubMed:23524462). The T cell repertoire is generated  in the thymus, by V-(D)-J rearrangement. This repertoire is then shaped  by intrathymic selection events to generate a peripheral T cell pool of  self-MH restricted, non-autoaggressive T cells. Post-thymic interaction  of alpha-beta TR with the pMH complexes shapes TR structural and  functional avidity (PubMed:15040585). (from UniProt A0A0B4J248)
49ENSG00000238035n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 181,315,316ENSG00000238035 (from geneSymbol)
50ENSG00000250057n/a
    
    
     
n/achr4 83,240,362ENSG00000250057 (from geneSymbol)