UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1MTHFD2P1n/a
    
    
     
n/achr3 95,655,403methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase pseudogene 1 (from HGNC MTHFD2P1)
2PTGER4P3n/a
    
    
     
n/achr9 63,776,017prostaglandin E receptor 4 pseudogene 3 (from HGNC PTGER4P3)
3OR5AK4Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 57,037,985olfactory receptor family 5 subfamily AK member 4 pseudogene (from RefSeq NR_036445.1)
4SDAD1-AS1n/a
    
    
     
n/achr4 75,993,366SDAD1 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_125906.1)
5LINC02461n/a
    
    
     
n/achr12 43,159,212long intergenic non-protein coding RNA 2461 (from RefSeq NR_146866.1)
6OR5AK1Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 57,018,560olfactory receptor family 5 subfamily AK member 1 pseudogene (from HGNC OR5AK1P)
7RNU6-967Pn/a
    
    
     
n/achr19 31,787,201RNA, U6 small nuclear 967, pseudogene (from HGNC RNU6-967P)
8IGLV5-48n/a
    
    
     
n/achr22 22,353,186Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin light chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A075B6I7)
9MYO5BP3n/a
    
    
     
n/achr9 63,762,185myosin VB pseudogene 3 (from HGNC MYO5BP3)
10IGLJ3n/a
    
    
     
n/achr22 22,904,937immunoglobulin lambda joining 3 (from HGNC IGLJ3)
11RPL7AP33n/a
    
    
     
n/achr5 173,226,129ribosomal protein L7a pseudogene 33 (from HGNC RPL7AP33)
12IGKV2D-26n/a
    
    
     
n/achr2 89,986,312V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0A0MRZ7)
13IGKV7-3n/a
    
    
     
n/achr2 88,915,229immunoglobulin kappa variable 7-3 (pseudogene) (from HGNC IGKV7-3)
14SCUBE1-AS1n/a
    
    
     
n/achr22 43,279,892SCUBE1 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_134582.1)
15LINC02260n/a
    
    
     
n/achr4 54,605,171long intergenic non-protein coding RNA 2260 (from RefSeq NR_134657.1)
16EIF4A1P1n/a
    
    
     
n/achr21 27,367,480eukaryotic translation initiation factor 4A1 pseudogene 1 (from HGNC EIF4A1P1)
17ENSG00000250507n/a
    
    
     
n/achr19 54,329,853ENSG00000250507 (from geneSymbol)
18IGKV1-37n/a
    
    
     
n/achr2 89,297,524Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin light chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A075B6S9)
19ENSG00000257925n/a
    
    
     
n/achr12 47,258,377ENSG00000257925 (from geneSymbol)
20CXCR5n/a
    
    
     
n/achr11 118,890,839C-X-C motif chemokine receptor 5, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001716.5)
21ENSG00000257737n/a
    
    
     
n/achr12 103,656,387ENSG00000257737 (from geneSymbol)
22OR5AO1Pn/a
    
    
     
n/achr11 57,045,240olfactory receptor family 5 subfamily AO member 1 pseudogene (from HGNC OR5AO1P)
23HMGN1P37n/a
    
    
     
n/achrX 154,817,250high mobility group nucleosome binding domain 1 pseudogene 37 (from HGNC HMGN1P37)
24LINC01470n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 152,801,935long intergenic non-protein coding RNA 1470 (from HGNC LINC01470)
25IGKV2OR2-2n/a
    
    
     
n/achr2 97,050,878immunoglobulin kappa variable 2/OR2-2 (pseudogene) (from HGNC IGKV2OR2-2)
26ITGADn/a
    
    
     
n/achr16 31,409,920integrin subunit alpha D, transcript variant 2 (from RefSeq NM_005353.3)
27ENSG00000260757n/a
    
    
     
n/achr16 31,403,632ENSG00000260757 (from geneSymbol)
28GTF2IP6n/a
    
    
     
n/achr17 27,033,730general transcription factor IIi pseudogene 6 (from HGNC GTF2IP6)
29HSPA8P14n/a
    
    
     
n/achr12 111,383,752heat shock protein family A (Hsp70) member 8 pseudogene 14 (from HGNC HSPA8P14)
30HTN3n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 70,032,498histatin 3 (from RefSeq NM_000200.3)
31RPS3AP16n/a
    
    
     
n/achr4 4,077,101ribosomal protein S3a pseudogene 16 (from HGNC RPS3AP16)
32ENSG00000255186n/a
    
    
     
n/achr11 36,387,385ENSG00000255186 (from geneSymbol)
33IGHV3-41n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 106,443,358immunoglobulin heavy variable 3-41 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-41)
34IGLV3-6n/a
    
    
     
n/achr22 22,850,499immunoglobulin lambda variable 3-6 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-6)
35ENSG00000250642n/a
    
    
     
n/achr4 68,284,210ENSG00000250642 (from geneSymbol)
36ENSG00000261552n/a
    
    
     
n/achr16 28,989,959ENSG00000261552 (from geneSymbol)
37ENSG00000229313n/a
    
    
     
n/achr6 25,049,251ENSG00000229313 (from geneSymbol)
38RPL21P25n/a
    
    
     
n/achr1 48,497,499ribosomal protein L21 pseudogene 25 (from HGNC RPL21P25)
39IGKV1D-43n/a
    
    
     
n/achr2 90,210,201V region of the variable domain of immunoglobulin light  chains that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:20176268, PubMed:22158414). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A0B4J1Z2)
40IGKV3OR2-268n/a
    
    
     
n/achr2 87,338,773immunoglobulin kappa variable 3/OR2-268 (non-functional) (from HGNC IGKV3OR2-268)
41IGLV1-62n/a
    
    
     
n/achr22 22,086,835immunoglobulin lambda variable 1-62 (pseudogene) (from HGNC IGLV1-62)
42BETALINC1n/a
    
    
     
n/achr20 21,532,893BETALINC1 (from geneSymbol)
43LINC00242n/a
    
    
     
n/achr6 169,793,807long intergenic non-protein coding RNA 242 (from RefSeq NR_026781.1)
44LINC01565n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 128,574,043long intergenic non-protein coding RNA 1565 (from RefSeq NR_125802.1)
45IGLV2-34n/a
    
    
     
n/achr22 22,580,155immunoglobulin lambda variable 2-34 (pseudogene) (from HGNC IGLV2-34)
46ENSG00000234117n/a
    
    
     
n/achr6 116,494,698ENSG00000234117 (from geneSymbol)
47MIR208An/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 23,388,631microRNA 208a (from RefSeq NR_029595.1)
48ENSG00000218565n/a
    
    
     
n/achr6 139,338,799ENSG00000218565 (from geneSymbol)
49MIR1179n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 88,608,152microRNA 1179 (from RefSeq NR_031590.1)
50RPL31P11n/a
    
    
     
n/achr1 161,685,023ribosomal protein L31 pseudogene 11 (from HGNC RPL31P11)