UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1RPL31P49n/a
    
    
     
n/achr12 110,461,175ribosomal protein L31 pseudogene 49 (from HGNC RPL31P49)
2RN7SL301Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr17 36,110,298RNA, 7SL, cytoplasmic 301, pseudogene (from HGNC RN7SL301P)
3OR5G1Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 56,775,733olfactory receptor family 5 subfamily G member 1 pseudogene (from HGNC OR5G1P)
4ENSG00000231392n/a
    
    
     
n/achr22 22,774,610ENSG00000231392 (from geneSymbol)
5RPL15P16n/a
    
    
     
n/achr11 72,940,805ribosomal protein L15 pseudogene 16 (from HGNC RPL15P16)
6FAM32BPn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr22 17,213,835family with sequence similarity 32 member B, pseudogene (from HGNC FAM32BP)
7ENSG00000253924n/a
    
    
     
n/achr8 52,296,790ENSG00000253924 (from geneSymbol)
8RNA5SP260n/a
    
    
     
n/achr8 29,048,549RNA, 5S ribosomal pseudogene 260 (from HGNC RNA5SP260)
9IGLVI-63n/a
    
    
     
n/achr22 22,080,016immunoglobulin lambda variable (I)-63 (pseudogene) (from HGNC IGLVI-63)
10IGKV2-18n/a
    
    
     
n/achr2 89,129,103immunoglobulin kappa variable 2-18 (pseudogene) (from HGNC IGKV2-18)
11IGHV1-12n/a
    
    
     
n/achr14 106,122,564immunoglobulin heavy variable 1-12 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-12)
12IGKV2D-23n/a
    
    
     
n/achr2 90,009,664immunoglobulin kappa variable 2D-23 (pseudogene) (from HGNC IGKV2D-23)
13ENSG00000265781n/a
    
    
     
n/achr18 71,005,983ENSG00000265781 (from geneSymbol)
14FAM20BP1n/a
    
    
     
n/achr3 169,932,613FAM20BP1 (from geneSymbol)
15CR1Ln/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 207,684,418complement C3b/C4b receptor 1 like (from RefSeq NM_175710.2)
16RPL36AP7n/a
    
    
     
n/achr17 75,338,987ribosomal protein L36a pseudogene 7 (from HGNC RPL36AP7)
17CD46P1n/a
    
    
     
n/achr1 207,651,322CD46 molecule pseudogene 1 (from HGNC CD46P1)
18IGLV3-13n/a
    
    
     
n/achr22 22,762,405immunoglobulin lambda variable 3-13 (pseudogene) (from HGNC IGLV3-13)
19ABI1P1n/a
    
    
     
n/achr14 55,547,398abl interactor 1 pseudogene 1 (from HGNC ABI1P1)
20OR5BQ1Pn/a
    
    
     
n/achr11 57,029,565olfactory receptor family 5 subfamily BQ member 1 pseudogene (from HGNC OR5BQ1P)
21CDCA3P1n/a
    
    
     
n/achr7 37,821,410CDCA3P1 (from geneSymbol)
22TRDV3n/a
    
    
     
n/achr14 22,469,369V region of the variable domain of T cell receptor (TR) delta  chain that participates in the antigen recognition (PubMed:24600447).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:28920588, PubMed:23348415). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0JD37)
23ENSG00000270423n/a
    
    
     
n/achr11 109,985,451ENSG00000270423 (from geneSymbol)
24RNU2-52Pn/a
    
    
     
n/achr20 41,024,299RNA, U2 small nuclear 52, pseudogene (from HGNC RNU2-52P)
25SCARNA1n/a
    
    
     
n/achr1 27,834,483small Cajal body-specific RNA 1 (from RefSeq NR_002997.1)
26NEFLP1n/a
    
    
     
n/achrY 21,221,597neurofilament light pseudogene 1 (from HGNC NEFLP1)
27BRWD1P2n/a
    
    
     
n/achr12 89,919,606bromodomain and WD repeat domain containing 1 pseudogene 2 (from HGNC BRWD1P2)
28SNORA71Dn/a
    
    
     
n/achr20 38,433,931small nucleolar RNA, H/ACA box 71D (from RefSeq NR_003018.2)
29HMGN1P30n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr18 58,018,927high mobility group nucleosome binding domain 1 pseudogene 30 (from HGNC HMGN1P30)
30MIR589n/a
    
    
     
n/achr7 5,495,868microRNA 589 (from RefSeq NR_030318.1)
31ENSG00000224523n/a
    
    
     
n/achrX 81,418,107ENSG00000224523 (from geneSymbol)
32ENSG00000241917n/a
    
    
     
n/achr12 101,936,445ENSG00000241917 (from geneSymbol)
33RPL36AP32n/a
    
    
     
n/achr8 28,810,260ribosomal protein L36a pseudogene 32 (from HGNC RPL36AP32)
34IGHV1-14n/a
    
    
     
n/achr14 106,146,011immunoglobulin heavy variable 1-14 (pseudogene) (from HGNC IGHV1-14)
35KRT8P34n/a
    
    
     
n/achr17 39,835,558keratin 8 pseudogene 34 (from HGNC KRT8P34)
36RPL23AP89n/a
    
    
     
n/achr1 12,080,420ribosomal protein L23a pseudogene 89 (from HGNC RPL23AP89)
37ENSG00000229983n/a
    
    
     
n/achr1 212,179,233ENSG00000229983 (from geneSymbol)
38Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr11 93,719,659Y_RNA (from geneSymbol)
39SNORA75n/a
    
    
     
n/achr12 9,445,131small nucleolar RNA, H/ACA box 75 (from HGNC SNORA75)
40ENSG00000244245n/a
    
    
     
n/achr5 108,593,788ENSG00000244245 (from geneSymbol)
41Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr1 202,914,930Y_RNA (from geneSymbol)
42SNRPFP1n/a
    
    
     
n/achr20 49,729,716small nuclear ribonucleoprotein polypeptide F pseudogene 1 (from HGNC SNRPFP1)
43RNA5SP221n/a
    
    
     
n/achr6 143,449,860RNA, 5S ribosomal pseudogene 221 (from HGNC RNA5SP221)
44PRELID3BP6n/a
    
    
     
n/achr5 42,917,699PRELI domain containing 3B pseudogene 6 (from HGNC PRELID3BP6)
45ENSG00000258115n/a
    
    
     
n/achr12 72,051,763ENSG00000258115 (from geneSymbol)
46Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr15 59,408,960Y_RNA (from geneSymbol)
47IGHV3-52n/a
    
    
     
n/achr14 106,586,601immunoglobulin heavy variable 3-52 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-52)
48Y_RNAn/a
    
    
     
n/achr3 23,273,858Y_RNA (from geneSymbol)
49SNORA79n/a
    
    
     
n/achr14 81,202,764small nucleolar RNA, H/ACA box 79 (from RefSeq NR_003021.2)
50ENSG00000225741n/a
    
    
     
n/achr22 22,104,038ENSG00000225741 (from geneSymbol)