UCSC Human Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
VisiGene
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1TTC9-DTn/a
    
    
     
n/achr14 70,625,048TTC9 divergent transcript (from RefSeq NR_110071.1)
2RN7SL77Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 70,610,232RNA, 7SL, cytoplasmic 77, pseudogene (from HGNC RN7SL77P)
3BTBD6P1n/a
    
    
     
n/achr1 23,902,104BTB domain containing 6 pseudogene 1 (from HGNC BTBD6P1)
4ENSG00000225885n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr8 118,345,906ENSG00000225885 (from geneSymbol)
5IFNG-AS1n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 68,112,107IFNG antisense RNA 1 (from HGNC IFNG-AS1)
6RNY1P11n/a
    
    
     
n/achr7 129,164,905RNA, Ro-associated Y1 pseudogene 11 (from HGNC RNY1P11)
7ENSG00000259421n/a
    
    
     
n/achr22 39,070,542ENSG00000259421 (from geneSymbol)
8LINC01470n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr5 152,801,935long intergenic non-protein coding RNA 1470 (from HGNC LINC01470)
9GLYATL1Bn/a
    
    
     
n/achr11 59,090,546glycine-N-acyltransferase like 1B (from RefSeq NM_001355566.1)
10ENSG00000279846n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr15 99,498,093ENSG00000279846 (from geneSymbol)
11LINC02642n/a
    
    
     
n/achr10 7,458,100long intergenic non-protein coding RNA 2642, transcript variant 12 (from RefSeq NR_184124.1)
12SIDT1-AS1n/a
    
    
     
n/achr3 113,589,468SIDT1 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_046729.1)
13HNRNPA1P70n/a
    
    
     
n/achr12 68,036,310heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 pseudogene 70 (from HGNC HNRNPA1P70)
14NCR2n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr6 41,343,248natural cytotoxicity triggering receptor 2, transcript variant 1 (from RefSeq NM_004828.4)
15IGLJ3n/a
    
    
     
n/achr22 22,904,937immunoglobulin lambda joining 3 (from HGNC IGLJ3)
16RPL39P41n/a
    
    
     
n/achr22 37,215,814ribosomal protein L39 pseudogene 41 (from HGNC RPL39P41)
17FCRL4n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr1 157,585,916Fc receptor like 4 (from RefSeq NM_031282.3)
18ENSG00000235419n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 230,550,300ENSG00000235419 (from geneSymbol)
19ENSG00000249779n/a
    
    
     
n/achr5 43,207,260ENSG00000249779 (from geneSymbol)
20ENSG00000230628n/a
    
    
     
n/achr1 234,682,838ENSG00000230628 (from geneSymbol)
21CCR8n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr3 39,331,694C-C motif chemokine receptor 8 (from RefSeq NM_005201.4)
22TRGV1n/a
    
    
     
n/achr7 38,367,877Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of T cell receptor (TR) gamma chain  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive T cell receptor (TR) chain due to altered  V-(D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Gamma-delta TRs recognize a variety of self and foreign non-peptide  antigens frequently expressed at the epithelial boundaries between the  host and external environment, including endogenous lipids presented by  MH-like protein CD1D and phosphoantigens presented by butyrophilin-like  molecule BTN3A1. Upon antigen recognition induces rapid, innate-like  immune responses involved in pathogen clearance and tissue repair  (PubMed:23348415, PubMed:28920588). Binding of gamma-delta TR complex  to antigen triggers phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based  activation motifs (ITAMs) in the CD3 chains by the LCK and FYN kinases,  allowing the recruitment, phosphorylation, and activation of ZAP70 that  facilitates phosphorylation of the scaffolding proteins LCP2 and LAT.  This lead to the formation of a supramolecular signalosome that  recruits the phospholipase PLCG1, resulting in calcium mobilization and  ERK activation, ultimately leading to T cell expansion and  differentiation into effector cells (PubMed:25674089). Gamma-delta TRs  are produced through somatic rearrangement of a limited repertoire of  variable (V), diversity (D), and joining (J) genes. The potential  diversity of gamma-delta TRs is conferred by the unique ability to  rearrange (D) genes in tandem and to utilize all three reading frames.  The combinatorial diversity is considerably increased by the sequence  exonuclease trimming and random nucleotide (N) region additions which  occur during the V-(D)-J rearrangements (PubMed:24387714). (from UniProt A0A0A0MS02)
23ZEB2P1n/a
    
    
     
n/achr4 16,361,256zinc finger E-box binding homeobox 2 pseudogene 1 (from HGNC ZEB2P1)
24ENSG00000293014n/a
    
    
     
n/achr4 16,379,103ENSG00000293014 (from geneSymbol)
25UNC93B6n/a
    
    
     
n/achr11 71,605,426unc-93 homolog B6, pseudogene (from HGNC UNC93B6)
26ENSG00000293238n/a
    
    
     
n/achr11 71,605,650ENSG00000293238 (from geneSymbol)
27RPL9P33n/a
    
    
     
n/achr19 51,621,418ribosomal protein L9 pseudogene 33 (from HGNC RPL9P33)
28ENSG00000225411n/a
    
    
     
n/achr9 63,808,151ENSG00000225411 (from geneSymbol)
29RN7SL842Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr19 14,588,506RNA, 7SL, cytoplasmic 842, pseudogene (from HGNC RN7SL842P)
30RN7SL32Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr2 233,205,339RNA, 7SL, cytoplasmic 32, pseudogene (from HGNC RN7SL32P)
31PTBP1Pn/a
    
    
     
n/achr14 65,280,216polypyrimidine tract binding protein 1 pseudogene (from HGNC PTBP1P)
32OR10AH1Pn/a
    
    
     
n/achr7 5,117,611olfactory receptor family 10 subfamily AH member 1 pseudogene (from HGNC OR10AH1P)
33ENSG00000290673n/a
    
    
     
n/achr7 5,111,984ENSG00000290673 (from geneSymbol)
34ENSG00000236941n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr4 164,948,758ENSG00000236941 (from geneSymbol)
35LINC01684n/a
    
    
     
n/achr21 24,418,852long intergenic non-protein coding RNA 1684 (from HGNC LINC01684)
36IGKV1-37n/a
    
    
     
n/achr2 89,297,524Probable non-functional open reading frame (ORF) of V region  of the variable domain of immunoglobulin light chains  (PubMed:24600447). Non-functional ORF generally cannot participate in  the synthesis of a productive immunoglobulin chain due to altered V-  (D)-J or switch recombination and/or splicing site (at mRNA level)  and/or conserved amino acid change (protein level) (PubMed:9619395).  Immunoglobulins, also known as antibodies, are membrane-bound or  secreted glycoproteins produced by B lymphocytes. In the recognition  phase of humoral immunity, the membrane-bound immunoglobulins serve as  receptors which, upon binding of a specific antigen, trigger the clonal  expansion and differentiation of B lymphocytes into immunoglobulins-  secreting plasma cells. Secreted immunoglobulins mediate the effector  phase of humoral immunity, which results in the elimination of bound  antigens (PubMed:22158414, PubMed:20176268). The antigen binding site  is formed by the variable domain of one heavy chain, together with that  of its associated light chain. Thus, each immunoglobulin has two  antigen binding sites with remarkable affinity for a particular  antigen. The variable domains are assembled by a process called V-(D)-J  rearrangement and can then be subjected to somatic hypermutations  which, after exposure to antigen and selection, allow affinity  maturation for a particular antigen (PubMed:20176268, PubMed:17576170). (from UniProt A0A075B6S9)
37DYNLT3P2n/a
    
    
     
n/achr2 128,200,048dynein light chain Tctex-type 3 pseudogene 2 (from HGNC DYNLT3P2)
38SDAD1-AS1n/a
    
    
     
n/achr4 75,993,366SDAD1 antisense RNA 1 (from RefSeq NR_125906.1)
39ENSG00000224478n/a
    
    
     
n/achr6 159,110,289ENSG00000224478 (from geneSymbol)
40DNAJB12P1n/a
    
    
     
n/achr2 65,501,565DNAJB12P1 (from geneSymbol)
41LINC02909n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr12 25,000,733LINC02909 (from geneSymbol)
42ATP5MC2P3n/a
    
    
     
n/achr2 197,263,323ATP synthase membrane subunit c locus 2 pseudogene 3 (from HGNC ATP5MC2P3)
43ENSG00000231881n/a
    
    
     
n/achr6 44,074,040ENSG00000231881 (from geneSymbol)
44ENSG00000275033n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 95,662,539ENSG00000275033 (from geneSymbol)
45BNIP3P43n/a
    
    
     
n/achr21 13,120,525BNIP3P43 (from geneSymbol)
46IGHV3-41n/a
n/a
n/a
n/a
n/achr14 106,443,358immunoglobulin heavy variable 3-41 (pseudogene) (from HGNC IGHV3-41)
47OR5AK1Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 57,018,560olfactory receptor family 5 subfamily AK member 1 pseudogene (from HGNC OR5AK1P)
48OR5AK4Pn/a
n/a
n/a
n/a
n/achr11 57,037,985olfactory receptor family 5 subfamily AK member 4 pseudogene (from RefSeq NR_036445.1)
49CXCR5n/a
    
    
     
n/achr11 118,890,839C-X-C motif chemokine receptor 5, transcript variant 1 (from RefSeq NM_001716.5)
50ENSG00000225365n/a
    
    
     
n/achr7 158,538,687ENSG00000225365 (from geneSymbol)